Protein–RNA interactions for Protein: A5D8W1

CFAP69, Cilia- and flagella-associated protein 69, humanhuman

Predictions only

Length 941 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP69A5D8W1 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CFAP69A5D8W1 TTC13-201ENST00000366661 3253 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CFAP69A5D8W1 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CFAP69A5D8W1 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CFAP69A5D8W1 CA10-203ENST00000451037 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CFAP69A5D8W1 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CFAP69A5D8W1 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CFAP69A5D8W1 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CFAP69A5D8W1 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CFAP69A5D8W1 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CFAP69A5D8W1 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CFAP69A5D8W1 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CFAP69A5D8W1 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CFAP69A5D8W1 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CFAP69A5D8W1 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CFAP69A5D8W1 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CFAP69A5D8W1 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CFAP69A5D8W1 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CFAP69A5D8W1 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CFAP69A5D8W1 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CFAP69A5D8W1 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CFAP69A5D8W1 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CFAP69A5D8W1 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CFAP69A5D8W1 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CFAP69A5D8W1 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CFAP69A5D8W1 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CFAP69A5D8W1 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CFAP69A5D8W1 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CFAP69A5D8W1 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CFAP69A5D8W1 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CFAP69A5D8W1 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CFAP69A5D8W1 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CFAP69A5D8W1 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CFAP69A5D8W1 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CFAP69A5D8W1 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CFAP69A5D8W1 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CFAP69A5D8W1 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CFAP69A5D8W1 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CFAP69A5D8W1 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CFAP69A5D8W1 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CFAP69A5D8W1 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CFAP69A5D8W1 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CFAP69A5D8W1 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CFAP69A5D8W1 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CFAP69A5D8W1 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CFAP69A5D8W1 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CFAP69A5D8W1 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CFAP69A5D8W1 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CFAP69A5D8W1 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CFAP69A5D8W1 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CFAP69A5D8W1 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CFAP69A5D8W1 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CFAP69A5D8W1 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CFAP69A5D8W1 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CFAP69A5D8W1 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CFAP69A5D8W1 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CFAP69A5D8W1 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CFAP69A5D8W1 OR4D1-202ENST00000641449 4925 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CFAP69A5D8W1 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CFAP69A5D8W1 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CFAP69A5D8W1 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CFAP69A5D8W1 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CFAP69A5D8W1 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CFAP69A5D8W1 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CFAP69A5D8W1 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CFAP69A5D8W1 TACR3-201ENST00000304883 5190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CFAP69A5D8W1 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CFAP69A5D8W1 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CFAP69A5D8W1 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CFAP69A5D8W1 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CFAP69A5D8W1 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CFAP69A5D8W1 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
CFAP69A5D8W1 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CFAP69A5D8W1 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CFAP69A5D8W1 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CFAP69A5D8W1 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CFAP69A5D8W1 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CFAP69A5D8W1 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CFAP69A5D8W1 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
CFAP69A5D8W1 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CFAP69A5D8W1 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CFAP69A5D8W1 NBEAL2-205ENST00000450053 8827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CFAP69A5D8W1 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CFAP69A5D8W1 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CFAP69A5D8W1 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CFAP69A5D8W1 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CFAP69A5D8W1 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
CFAP69A5D8W1 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CFAP69A5D8W1 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CFAP69A5D8W1 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CFAP69A5D8W1 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CFAP69A5D8W1 ITPK1-201ENST00000267615 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CFAP69A5D8W1 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CFAP69A5D8W1 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CFAP69A5D8W1 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CFAP69A5D8W1 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CFAP69A5D8W1 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CFAP69A5D8W1 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CFAP69A5D8W1 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CFAP69A5D8W1 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.9 ms