Protein–RNA interactions for Protein: A3KMH1

VWA8, von Willebrand factor A domain-containing protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 1,905 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VWA8A3KMH1 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
VWA8A3KMH1 POLD3-208ENST00000532497 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
VWA8A3KMH1 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
VWA8A3KMH1 FAM32A-201ENST00000263384 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
VWA8A3KMH1 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
VWA8A3KMH1 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
VWA8A3KMH1 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
VWA8A3KMH1 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
VWA8A3KMH1 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
VWA8A3KMH1 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
VWA8A3KMH1 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
VWA8A3KMH1 HSD17B6-201ENST00000322165 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
VWA8A3KMH1 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
VWA8A3KMH1 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
VWA8A3KMH1 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
VWA8A3KMH1 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
VWA8A3KMH1 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
VWA8A3KMH1 DYNLRB2-201ENST00000305904 497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
VWA8A3KMH1 TISP43-201ENST00000409793 538 ntTSL 4 BASIC16.27■□□□□ 0.19
VWA8A3KMH1 DYNC1I1-203ENST00000413338 958 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
VWA8A3KMH1 CR769775.1-201ENST00000443347 931 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.19
VWA8A3KMH1 DCTD-213ENST00000510370 794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
VWA8A3KMH1 AC090735.1-201ENST00000523881 488 ntTSL 4 BASIC16.27■□□□□ 0.19
VWA8A3KMH1 LINC02449-203ENST00000536034 451 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.19
VWA8A3KMH1 DIO3OS-203ENST00000554441 1068 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
VWA8A3KMH1 AC046168.2-201ENST00000560590 875 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.19
VWA8A3KMH1 AC011510.1-201ENST00000598541 286 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.19
VWA8A3KMH1 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
VWA8A3KMH1 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
VWA8A3KMH1 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
VWA8A3KMH1 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
VWA8A3KMH1 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
VWA8A3KMH1 LEF1-216ENST00000510624 1472 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
VWA8A3KMH1 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
VWA8A3KMH1 ZNF711-201ENST00000276123 2887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
VWA8A3KMH1 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
VWA8A3KMH1 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
VWA8A3KMH1 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
VWA8A3KMH1 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
VWA8A3KMH1 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
VWA8A3KMH1 FAM153A-220ENST00000513554 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
VWA8A3KMH1 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
VWA8A3KMH1 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
VWA8A3KMH1 C1orf123-201ENST00000294360 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
VWA8A3KMH1 CIDEC-201ENST00000336832 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
VWA8A3KMH1 CSAG1-202ENST00000370287 875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
VWA8A3KMH1 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
VWA8A3KMH1 AC007319.1-202ENST00000412276 829 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
VWA8A3KMH1 CIDEC-203ENST00000423850 1036 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
VWA8A3KMH1 AL731661.1-201ENST00000438217 758 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
VWA8A3KMH1 AL450003.2-201ENST00000450445 428 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
VWA8A3KMH1 CIDEC-206ENST00000455015 1123 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
VWA8A3KMH1 CD74-212ENST00000524315 584 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
VWA8A3KMH1 C1RL-212ENST00000545337 813 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
VWA8A3KMH1 CYGB-203ENST00000589145 788 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
VWA8A3KMH1 DMAC2-208ENST00000589970 979 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
VWA8A3KMH1 DMAC2-215ENST00000597457 492 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
VWA8A3KMH1 AC004466.1-201ENST00000599515 1080 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
VWA8A3KMH1 AL139099.5-201ENST00000635274 300 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
VWA8A3KMH1 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
VWA8A3KMH1 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
VWA8A3KMH1 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
VWA8A3KMH1 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
VWA8A3KMH1 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
VWA8A3KMH1 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
VWA8A3KMH1 HTR4-209ENST00000521530 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
VWA8A3KMH1 CHRDL1-205ENST00000482160 1537 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
VWA8A3KMH1 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
VWA8A3KMH1 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
VWA8A3KMH1 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
VWA8A3KMH1 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
VWA8A3KMH1 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
VWA8A3KMH1 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
VWA8A3KMH1 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
VWA8A3KMH1 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
VWA8A3KMH1 DMAC2-204ENST00000438807 1454 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
VWA8A3KMH1 MUC1-202ENST00000338684 1107 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
VWA8A3KMH1 UROS-203ENST00000368786 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
VWA8A3KMH1 HOMER2P2-201ENST00000451621 847 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
VWA8A3KMH1 TAF8-204ENST00000456846 1293 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
VWA8A3KMH1 MUC1-218ENST00000471283 635 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
VWA8A3KMH1 IL32-218ENST00000530890 774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
VWA8A3KMH1 AC090502.1-201ENST00000549905 748 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
VWA8A3KMH1 AC090502.1-204ENST00000551210 469 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
VWA8A3KMH1 AL163636.1-201ENST00000554286 915 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
VWA8A3KMH1 RN7SL713P-201ENST00000582127 302 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
VWA8A3KMH1 AC021594.1-201ENST00000587174 636 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
VWA8A3KMH1 LINC00479-204ENST00000589300 718 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
VWA8A3KMH1 AC008403.1-201ENST00000595676 443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
VWA8A3KMH1 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
VWA8A3KMH1 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
VWA8A3KMH1 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
VWA8A3KMH1 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
VWA8A3KMH1 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
VWA8A3KMH1 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
VWA8A3KMH1 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
VWA8A3KMH1 TEX264-205ENST00000416589 1313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
VWA8A3KMH1 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
VWA8A3KMH1 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
VWA8A3KMH1 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms