Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPS6

SETD1B, Histone-lysine N-methyltransferase SETD1B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,966 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SETD1BQ9UPS6 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SETD1BQ9UPS6 AC011450.1-202ENST00000358234 573 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SETD1BQ9UPS6 ETV2-201ENST00000379023 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SETD1BQ9UPS6 AK6-201ENST00000380818 1183 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SETD1BQ9UPS6 SUMF2-210ENST00000437307 947 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SETD1BQ9UPS6 C8orf31-207ENST00000524181 1199 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SETD1BQ9UPS6 AC091564.6-201ENST00000526633 487 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SETD1BQ9UPS6 HTATIP2-205ENST00000530266 713 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SETD1BQ9UPS6 AC011603.1-201ENST00000553174 717 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SETD1BQ9UPS6 AF111169.4-201ENST00000556368 749 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SETD1BQ9UPS6 ACP7-202ENST00000594229 1149 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SETD1BQ9UPS6 AC073911.3-201ENST00000624401 631 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
SETD1BQ9UPS6 AC002472.3-201ENST00000640124 621 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
SETD1BQ9UPS6 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SETD1BQ9UPS6 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SETD1BQ9UPS6 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SETD1BQ9UPS6 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SETD1BQ9UPS6 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SETD1BQ9UPS6 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SETD1BQ9UPS6 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SETD1BQ9UPS6 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SETD1BQ9UPS6 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SETD1BQ9UPS6 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SETD1BQ9UPS6 POLD3-208ENST00000532497 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SETD1BQ9UPS6 FAM90A7P-201ENST00000382628 1395 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
SETD1BQ9UPS6 FAM90A23P-201ENST00000400136 1395 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
SETD1BQ9UPS6 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SETD1BQ9UPS6 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SETD1BQ9UPS6 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SETD1BQ9UPS6 TMEM177-202ENST00000401466 1346 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SETD1BQ9UPS6 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SETD1BQ9UPS6 AL080250.1-201ENST00000438676 445 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SETD1BQ9UPS6 RN7SL81P-201ENST00000493781 261 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
SETD1BQ9UPS6 MAX-211ENST00000555667 574 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SETD1BQ9UPS6 AC027237.1-201ENST00000560942 655 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
SETD1BQ9UPS6 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SETD1BQ9UPS6 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SETD1BQ9UPS6 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
SETD1BQ9UPS6 CSF3-201ENST00000225474 1509 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SETD1BQ9UPS6 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SETD1BQ9UPS6 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SETD1BQ9UPS6 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SETD1BQ9UPS6 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SETD1BQ9UPS6 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SETD1BQ9UPS6 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SETD1BQ9UPS6 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SETD1BQ9UPS6 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SETD1BQ9UPS6 AC090502.4-201ENST00000551714 1386 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
SETD1BQ9UPS6 CD300A-204ENST00000392625 1163 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SETD1BQ9UPS6 AC008723.1-201ENST00000506922 207 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
SETD1BQ9UPS6 DUX4L46-201ENST00000566845 751 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
SETD1BQ9UPS6 EIF5AP2-201ENST00000585668 1047 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
SETD1BQ9UPS6 LINC01224-201ENST00000593573 798 ntTSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SETD1BQ9UPS6 AC004466.1-201ENST00000599515 1080 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
SETD1BQ9UPS6 AC107464.3-201ENST00000609172 737 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
SETD1BQ9UPS6 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SETD1BQ9UPS6 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SETD1BQ9UPS6 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SETD1BQ9UPS6 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SETD1BQ9UPS6 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SETD1BQ9UPS6 C1QA-202ENST00000402322 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SETD1BQ9UPS6 LINC01388-201ENST00000416242 416 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SETD1BQ9UPS6 AP000358.1-201ENST00000456260 156 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
SETD1BQ9UPS6 APOC1P1-201ENST00000507983 630 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SETD1BQ9UPS6 SCARNA21-201ENST00000517026 139 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
SETD1BQ9UPS6 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SETD1BQ9UPS6 FAM236A-201ENST00000593662 453 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SETD1BQ9UPS6 FAM236B-201ENST00000596535 465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SETD1BQ9UPS6 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SETD1BQ9UPS6 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SETD1BQ9UPS6 CTNNBL1-209ENST00000621317 1990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SETD1BQ9UPS6 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
SETD1BQ9UPS6 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
SETD1BQ9UPS6 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
SETD1BQ9UPS6 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SETD1BQ9UPS6 MRPL23-204ENST00000397297 613 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SETD1BQ9UPS6 PTGR1-209ENST00000538962 1200 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SETD1BQ9UPS6 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SETD1BQ9UPS6 CMC2-224ENST00000630396 481 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SETD1BQ9UPS6 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SETD1BQ9UPS6 HSD17B6-205ENST00000554643 1751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SETD1BQ9UPS6 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SETD1BQ9UPS6 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SETD1BQ9UPS6 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SETD1BQ9UPS6 AC012442.2-201ENST00000414784 425 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SETD1BQ9UPS6 ACTBP7-201ENST00000418351 1124 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
SETD1BQ9UPS6 MSRB3-206ENST00000535664 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SETD1BQ9UPS6 AC010335.1-201ENST00000594590 599 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SETD1BQ9UPS6 AL157813.1-201ENST00000612996 587 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
SETD1BQ9UPS6 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SETD1BQ9UPS6 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SETD1BQ9UPS6 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC22■■□□□ 1.11
SETD1BQ9UPS6 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
SETD1BQ9UPS6 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SETD1BQ9UPS6 TGFB1I1-214ENST00000567607 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SETD1BQ9UPS6 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SETD1BQ9UPS6 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SETD1BQ9UPS6 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SETD1BQ9UPS6 CMTM5-202ENST00000342473 725 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SETD1BQ9UPS6 ALKBH2-201ENST00000343075 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.3 ms