Protein–RNA interactions for Protein: Q9UP95

SLC12A4, Solute carrier family 12 member 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,085 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC12A4Q9UP95 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC12A4Q9UP95 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC12A4Q9UP95 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC12A4Q9UP95 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC12A4Q9UP95 MAP7-207ENST00000616617 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC12A4Q9UP95 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC12A4Q9UP95 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC12A4Q9UP95 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC12A4Q9UP95 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC12A4Q9UP95 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC12A4Q9UP95 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC12A4Q9UP95 TAB1-201ENST00000216160 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC12A4Q9UP95 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC12A4Q9UP95 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC12A4Q9UP95 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC12A4Q9UP95 ECE1-201ENST00000264205 2381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC12A4Q9UP95 FGD1-201ENST00000375135 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC12A4Q9UP95 RAB2A-201ENST00000262646 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC12A4Q9UP95 NDRG4-217ENST00000562999 2931 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC12A4Q9UP95 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC12A4Q9UP95 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC12A4Q9UP95 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC12A4Q9UP95 CUL1-201ENST00000325222 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
SLC12A4Q9UP95 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
SLC12A4Q9UP95 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
SLC12A4Q9UP95 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
SLC12A4Q9UP95 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
SLC12A4Q9UP95 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
SLC12A4Q9UP95 BTN1A1-201ENST00000244513 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
SLC12A4Q9UP95 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
SLC12A4Q9UP95 GPD1L-201ENST00000282541 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SLC12A4Q9UP95 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SLC12A4Q9UP95 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SLC12A4Q9UP95 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SLC12A4Q9UP95 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SLC12A4Q9UP95 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SLC12A4Q9UP95 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SLC12A4Q9UP95 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SLC12A4Q9UP95 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SLC12A4Q9UP95 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SLC12A4Q9UP95 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SLC12A4Q9UP95 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SLC12A4Q9UP95 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SLC12A4Q9UP95 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SLC12A4Q9UP95 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SLC12A4Q9UP95 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SLC12A4Q9UP95 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SLC12A4Q9UP95 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
SLC12A4Q9UP95 PIGT-246ENST00000639499 2021 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SLC12A4Q9UP95 DPYSL4-201ENST00000338492 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SLC12A4Q9UP95 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SLC12A4Q9UP95 ADAM15-206ENST00000368412 2804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SLC12A4Q9UP95 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SLC12A4Q9UP95 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SLC12A4Q9UP95 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SLC12A4Q9UP95 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
SLC12A4Q9UP95 CEP76-201ENST00000262127 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SLC12A4Q9UP95 C21orf58-202ENST00000397679 2900 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SLC12A4Q9UP95 DDX59-206ENST00000447706 2900 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SLC12A4Q9UP95 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SLC12A4Q9UP95 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SLC12A4Q9UP95 AFAP1L1-205ENST00000515000 2319 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SLC12A4Q9UP95 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SLC12A4Q9UP95 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SLC12A4Q9UP95 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SLC12A4Q9UP95 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SLC12A4Q9UP95 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SLC12A4Q9UP95 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SLC12A4Q9UP95 PRKN-204ENST00000366896 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SLC12A4Q9UP95 CCDC32-201ENST00000358005 1704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SLC12A4Q9UP95 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SLC12A4Q9UP95 IPO8-201ENST00000256079 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SLC12A4Q9UP95 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SLC12A4Q9UP95 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SLC12A4Q9UP95 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SLC12A4Q9UP95 AC007920.1-201ENST00000356133 2674 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SLC12A4Q9UP95 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SLC12A4Q9UP95 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SLC12A4Q9UP95 SYNRG-225ENST00000619541 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SLC12A4Q9UP95 OPCML-IT1-201ENST00000533859 2936 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SLC12A4Q9UP95 AC025674.2-201ENST00000522622 2971 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SLC12A4Q9UP95 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SLC12A4Q9UP95 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SLC12A4Q9UP95 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
SLC12A4Q9UP95 CRACR2A-201ENST00000252322 2186 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SLC12A4Q9UP95 TNIP1-214ENST00000522226 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SLC12A4Q9UP95 GGT1-202ENST00000400380 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SLC12A4Q9UP95 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SLC12A4Q9UP95 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SLC12A4Q9UP95 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SLC12A4Q9UP95 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SLC12A4Q9UP95 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SLC12A4Q9UP95 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SLC12A4Q9UP95 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SLC12A4Q9UP95 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SLC12A4Q9UP95 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SLC12A4Q9UP95 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
SLC12A4Q9UP95 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SLC12A4Q9UP95 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SLC12A4Q9UP95 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms