Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNH6

SNX7, Sorting nexin-7, humanhuman

Predictions only

Length 387 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX7Q9UNH6 AC005225.4-201ENST00000557330 545 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SNX7Q9UNH6 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SNX7Q9UNH6 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SNX7Q9UNH6 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SNX7Q9UNH6 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SNX7Q9UNH6 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SNX7Q9UNH6 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SNX7Q9UNH6 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SNX7Q9UNH6 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SNX7Q9UNH6 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SNX7Q9UNH6 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SNX7Q9UNH6 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SNX7Q9UNH6 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SNX7Q9UNH6 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SNX7Q9UNH6 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SNX7Q9UNH6 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SNX7Q9UNH6 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SNX7Q9UNH6 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SNX7Q9UNH6 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SNX7Q9UNH6 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SNX7Q9UNH6 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SNX7Q9UNH6 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SNX7Q9UNH6 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SNX7Q9UNH6 SPEG-201ENST00000312358 10782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SNX7Q9UNH6 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SNX7Q9UNH6 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SNX7Q9UNH6 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SNX7Q9UNH6 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SNX7Q9UNH6 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SNX7Q9UNH6 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SNX7Q9UNH6 GRM5-205ENST00000455756 7927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SNX7Q9UNH6 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SNX7Q9UNH6 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SNX7Q9UNH6 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SNX7Q9UNH6 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SNX7Q9UNH6 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SNX7Q9UNH6 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SNX7Q9UNH6 C1R-202ENST00000536053 2347 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SNX7Q9UNH6 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SNX7Q9UNH6 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SNX7Q9UNH6 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SNX7Q9UNH6 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SNX7Q9UNH6 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SNX7Q9UNH6 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SNX7Q9UNH6 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SNX7Q9UNH6 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SNX7Q9UNH6 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SNX7Q9UNH6 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SNX7Q9UNH6 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SNX7Q9UNH6 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SNX7Q9UNH6 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SNX7Q9UNH6 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SNX7Q9UNH6 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SNX7Q9UNH6 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SNX7Q9UNH6 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SNX7Q9UNH6 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SNX7Q9UNH6 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SNX7Q9UNH6 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SNX7Q9UNH6 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SNX7Q9UNH6 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SNX7Q9UNH6 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SNX7Q9UNH6 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SNX7Q9UNH6 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SNX7Q9UNH6 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SNX7Q9UNH6 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SNX7Q9UNH6 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SNX7Q9UNH6 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SNX7Q9UNH6 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SNX7Q9UNH6 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SNX7Q9UNH6 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SNX7Q9UNH6 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SNX7Q9UNH6 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SNX7Q9UNH6 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SNX7Q9UNH6 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SNX7Q9UNH6 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SNX7Q9UNH6 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SNX7Q9UNH6 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SNX7Q9UNH6 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SNX7Q9UNH6 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SNX7Q9UNH6 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SNX7Q9UNH6 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SNX7Q9UNH6 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SNX7Q9UNH6 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SNX7Q9UNH6 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SNX7Q9UNH6 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SNX7Q9UNH6 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SNX7Q9UNH6 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SNX7Q9UNH6 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SNX7Q9UNH6 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SNX7Q9UNH6 AC244107.1-201ENST00000442033 332 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SNX7Q9UNH6 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SNX7Q9UNH6 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SNX7Q9UNH6 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SNX7Q9UNH6 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SNX7Q9UNH6 COQ6-210ENST00000554920 649 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SNX7Q9UNH6 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SNX7Q9UNH6 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SNX7Q9UNH6 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SNX7Q9UNH6 CECR7-204ENST00000609932 568 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SNX7Q9UNH6 AL358472.5-202ENST00000641448 1267 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.7 ms