Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIA0

CYTH4, Cytohesin-4, humanhuman

Predictions only

Length 394 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYTH4Q9UIA0 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CYTH4Q9UIA0 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CYTH4Q9UIA0 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CYTH4Q9UIA0 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CYTH4Q9UIA0 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CYTH4Q9UIA0 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CYTH4Q9UIA0 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CYTH4Q9UIA0 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CYTH4Q9UIA0 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CYTH4Q9UIA0 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CYTH4Q9UIA0 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CYTH4Q9UIA0 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CYTH4Q9UIA0 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CYTH4Q9UIA0 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CYTH4Q9UIA0 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
CYTH4Q9UIA0 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CYTH4Q9UIA0 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CYTH4Q9UIA0 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CYTH4Q9UIA0 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
CYTH4Q9UIA0 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CYTH4Q9UIA0 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CYTH4Q9UIA0 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
CYTH4Q9UIA0 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CYTH4Q9UIA0 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CYTH4Q9UIA0 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CYTH4Q9UIA0 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CYTH4Q9UIA0 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CYTH4Q9UIA0 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
CYTH4Q9UIA0 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CYTH4Q9UIA0 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CYTH4Q9UIA0 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CYTH4Q9UIA0 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CYTH4Q9UIA0 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CYTH4Q9UIA0 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CYTH4Q9UIA0 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CYTH4Q9UIA0 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CYTH4Q9UIA0 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CYTH4Q9UIA0 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CYTH4Q9UIA0 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CYTH4Q9UIA0 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CYTH4Q9UIA0 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CYTH4Q9UIA0 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CYTH4Q9UIA0 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CYTH4Q9UIA0 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CYTH4Q9UIA0 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CYTH4Q9UIA0 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CYTH4Q9UIA0 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CYTH4Q9UIA0 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CYTH4Q9UIA0 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CYTH4Q9UIA0 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
CYTH4Q9UIA0 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
CYTH4Q9UIA0 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
CYTH4Q9UIA0 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
CYTH4Q9UIA0 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
CYTH4Q9UIA0 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
CYTH4Q9UIA0 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CYTH4Q9UIA0 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CYTH4Q9UIA0 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CYTH4Q9UIA0 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CYTH4Q9UIA0 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CYTH4Q9UIA0 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CYTH4Q9UIA0 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CYTH4Q9UIA0 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CYTH4Q9UIA0 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CYTH4Q9UIA0 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CYTH4Q9UIA0 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CYTH4Q9UIA0 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CYTH4Q9UIA0 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CYTH4Q9UIA0 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CYTH4Q9UIA0 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CYTH4Q9UIA0 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CYTH4Q9UIA0 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CYTH4Q9UIA0 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CYTH4Q9UIA0 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CYTH4Q9UIA0 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CYTH4Q9UIA0 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CYTH4Q9UIA0 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CYTH4Q9UIA0 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CYTH4Q9UIA0 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CYTH4Q9UIA0 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CYTH4Q9UIA0 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CYTH4Q9UIA0 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CYTH4Q9UIA0 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CYTH4Q9UIA0 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CYTH4Q9UIA0 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CYTH4Q9UIA0 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CYTH4Q9UIA0 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
CYTH4Q9UIA0 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
CYTH4Q9UIA0 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CYTH4Q9UIA0 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CYTH4Q9UIA0 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CYTH4Q9UIA0 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CYTH4Q9UIA0 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CYTH4Q9UIA0 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CYTH4Q9UIA0 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CYTH4Q9UIA0 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CYTH4Q9UIA0 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CYTH4Q9UIA0 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CYTH4Q9UIA0 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CYTH4Q9UIA0 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 110.4 ms