Protein–RNA interactions for Protein: Q9UI47

CTNNA3, Catenin alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 895 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNA3Q9UI47 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CTNNA3Q9UI47 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CTNNA3Q9UI47 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CTNNA3Q9UI47 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CTNNA3Q9UI47 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CTNNA3Q9UI47 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CTNNA3Q9UI47 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CTNNA3Q9UI47 C1R-202ENST00000536053 2347 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CTNNA3Q9UI47 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CTNNA3Q9UI47 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CTNNA3Q9UI47 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CTNNA3Q9UI47 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CTNNA3Q9UI47 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CTNNA3Q9UI47 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CTNNA3Q9UI47 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CTNNA3Q9UI47 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
CTNNA3Q9UI47 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CTNNA3Q9UI47 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
CTNNA3Q9UI47 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CTNNA3Q9UI47 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CTNNA3Q9UI47 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CTNNA3Q9UI47 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CTNNA3Q9UI47 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CTNNA3Q9UI47 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CTNNA3Q9UI47 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CTNNA3Q9UI47 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CTNNA3Q9UI47 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CTNNA3Q9UI47 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CTNNA3Q9UI47 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CTNNA3Q9UI47 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CTNNA3Q9UI47 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CTNNA3Q9UI47 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CTNNA3Q9UI47 SLC34A1-201ENST00000324417 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CTNNA3Q9UI47 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CTNNA3Q9UI47 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CTNNA3Q9UI47 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CTNNA3Q9UI47 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CTNNA3Q9UI47 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CTNNA3Q9UI47 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CTNNA3Q9UI47 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CTNNA3Q9UI47 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CTNNA3Q9UI47 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CTNNA3Q9UI47 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CTNNA3Q9UI47 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
CTNNA3Q9UI47 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CTNNA3Q9UI47 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CTNNA3Q9UI47 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CTNNA3Q9UI47 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CTNNA3Q9UI47 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CTNNA3Q9UI47 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CTNNA3Q9UI47 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CTNNA3Q9UI47 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CTNNA3Q9UI47 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CTNNA3Q9UI47 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
CTNNA3Q9UI47 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
CTNNA3Q9UI47 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CTNNA3Q9UI47 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
CTNNA3Q9UI47 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
CTNNA3Q9UI47 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CTNNA3Q9UI47 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CTNNA3Q9UI47 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CTNNA3Q9UI47 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CTNNA3Q9UI47 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CTNNA3Q9UI47 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CTNNA3Q9UI47 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CTNNA3Q9UI47 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CTNNA3Q9UI47 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CTNNA3Q9UI47 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CTNNA3Q9UI47 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CTNNA3Q9UI47 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
CTNNA3Q9UI47 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CTNNA3Q9UI47 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
CTNNA3Q9UI47 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
CTNNA3Q9UI47 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC18.83■□□□□ 0.61
CTNNA3Q9UI47 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
CTNNA3Q9UI47 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
CTNNA3Q9UI47 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
CTNNA3Q9UI47 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
CTNNA3Q9UI47 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
CTNNA3Q9UI47 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
CTNNA3Q9UI47 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
CTNNA3Q9UI47 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
CTNNA3Q9UI47 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
CTNNA3Q9UI47 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
CTNNA3Q9UI47 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
CTNNA3Q9UI47 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
CTNNA3Q9UI47 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
CTNNA3Q9UI47 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
CTNNA3Q9UI47 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
CTNNA3Q9UI47 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
CTNNA3Q9UI47 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
CTNNA3Q9UI47 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
CTNNA3Q9UI47 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
CTNNA3Q9UI47 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
CTNNA3Q9UI47 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
CTNNA3Q9UI47 S100A6-205ENST00000496817 673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
CTNNA3Q9UI47 C5orf66-202ENST00000507641 547 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
CTNNA3Q9UI47 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
CTNNA3Q9UI47 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
CTNNA3Q9UI47 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.8 ms