Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHC1

MLH3, DNA mismatch repair protein Mlh3, humanhuman

Predictions only

Length 1,453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MLH3Q9UHC1 PDE6G-201ENST00000331056 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MLH3Q9UHC1 RN7SKP214-201ENST00000364208 315 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
MLH3Q9UHC1 AC092800.1-201ENST00000449492 579 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
MLH3Q9UHC1 AC073150.1-201ENST00000450406 1084 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
MLH3Q9UHC1 HLA-J-204ENST00000495278 958 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
MLH3Q9UHC1 RCC2P8-201ENST00000502779 1035 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
MLH3Q9UHC1 PGAM1P5-201ENST00000548011 764 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
MLH3Q9UHC1 CDIP1-202ENST00000562334 1205 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
MLH3Q9UHC1 TMEM9-204ENST00000367334 1529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MLH3Q9UHC1 B4GALT3-201ENST00000319769 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MLH3Q9UHC1 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MLH3Q9UHC1 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
MLH3Q9UHC1 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
MLH3Q9UHC1 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MLH3Q9UHC1 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
MLH3Q9UHC1 PLA1A-205ENST00000494440 1775 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MLH3Q9UHC1 NRM-202ENST00000376420 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MLH3Q9UHC1 IDI2-AS1-201ENST00000420381 672 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MLH3Q9UHC1 AP1B1P1-201ENST00000432373 827 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
MLH3Q9UHC1 AC005779.2-201ENST00000593083 550 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
MLH3Q9UHC1 MIR6756-201ENST00000616240 63 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
MLH3Q9UHC1 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MLH3Q9UHC1 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MLH3Q9UHC1 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MLH3Q9UHC1 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MLH3Q9UHC1 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MLH3Q9UHC1 MVK-214ENST00000629016 1591 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MLH3Q9UHC1 CELF2-206ENST00000608830 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MLH3Q9UHC1 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MLH3Q9UHC1 ELAVL1-205ENST00000596459 1473 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MLH3Q9UHC1 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MLH3Q9UHC1 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MLH3Q9UHC1 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MLH3Q9UHC1 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MLH3Q9UHC1 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MLH3Q9UHC1 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MLH3Q9UHC1 FGF14-202ENST00000376143 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MLH3Q9UHC1 GTF2A2-205ENST00000396064 633 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MLH3Q9UHC1 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MLH3Q9UHC1 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MLH3Q9UHC1 GTF2A2-208ENST00000484743 408 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MLH3Q9UHC1 AC093627.5-203ENST00000497320 746 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MLH3Q9UHC1 AC008406.1-201ENST00000509530 541 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MLH3Q9UHC1 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MLH3Q9UHC1 SMIM23-202ENST00000523047 573 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MLH3Q9UHC1 AC004637.1-201ENST00000586675 482 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MLH3Q9UHC1 WT1-AS_6.1-201ENST00000614919 121 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
MLH3Q9UHC1 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MLH3Q9UHC1 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MLH3Q9UHC1 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MLH3Q9UHC1 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MLH3Q9UHC1 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
MLH3Q9UHC1 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MLH3Q9UHC1 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
MLH3Q9UHC1 AC026904.3-201ENST00000636550 1530 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
MLH3Q9UHC1 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MLH3Q9UHC1 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MLH3Q9UHC1 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MLH3Q9UHC1 PTOV1-214ENST00000600603 1443 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MLH3Q9UHC1 ZDHHC4-201ENST00000335965 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MLH3Q9UHC1 RPS16-202ENST00000339471 643 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MLH3Q9UHC1 RPL3-202ENST00000401609 1289 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MLH3Q9UHC1 KRT18P66-201ENST00000452970 1269 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
MLH3Q9UHC1 AC117500.3-201ENST00000537032 666 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MLH3Q9UHC1 AC011825.3-201ENST00000583184 565 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
MLH3Q9UHC1 AC051619.9-201ENST00000623237 597 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
MLH3Q9UHC1 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
MLH3Q9UHC1 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MLH3Q9UHC1 WDR45-224ENST00000485908 1301 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
MLH3Q9UHC1 PLAG1-203ENST00000429357 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
MLH3Q9UHC1 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MLH3Q9UHC1 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MLH3Q9UHC1 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
MLH3Q9UHC1 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MLH3Q9UHC1 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MLH3Q9UHC1 AL731661.1-201ENST00000438217 758 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MLH3Q9UHC1 PRSS30P-205ENST00000506153 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MLH3Q9UHC1 EEF1D-218ENST00000526838 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MLH3Q9UHC1 MAX-211ENST00000555667 574 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MLH3Q9UHC1 AC132192.2-201ENST00000596206 1147 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
MLH3Q9UHC1 AL805961.1-201ENST00000642026 753 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
MLH3Q9UHC1 WDR83-201ENST00000418543 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MLH3Q9UHC1 CATSPER2P1-203ENST00000429276 1466 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MLH3Q9UHC1 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MLH3Q9UHC1 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MLH3Q9UHC1 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MLH3Q9UHC1 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MLH3Q9UHC1 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MLH3Q9UHC1 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MLH3Q9UHC1 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MLH3Q9UHC1 SHC1P1-201ENST00000425230 1745 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
MLH3Q9UHC1 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MLH3Q9UHC1 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MLH3Q9UHC1 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MLH3Q9UHC1 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MLH3Q9UHC1 PUDP-202ENST00000412827 1376 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MLH3Q9UHC1 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MLH3Q9UHC1 OXNAD1-202ENST00000435829 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MLH3Q9UHC1 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MLH3Q9UHC1 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.3 ms