Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2K6

KLHL42, Kelch-like protein 42, humanhuman

Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL42Q9P2K6 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KLHL42Q9P2K6 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KLHL42Q9P2K6 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KLHL42Q9P2K6 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KLHL42Q9P2K6 KRT18P43-201ENST00000469825 1281 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
KLHL42Q9P2K6 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KLHL42Q9P2K6 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KLHL42Q9P2K6 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KLHL42Q9P2K6 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KLHL42Q9P2K6 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
KLHL42Q9P2K6 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KLHL42Q9P2K6 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
KLHL42Q9P2K6 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
KLHL42Q9P2K6 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KLHL42Q9P2K6 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KLHL42Q9P2K6 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KLHL42Q9P2K6 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KLHL42Q9P2K6 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KLHL42Q9P2K6 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KLHL42Q9P2K6 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KLHL42Q9P2K6 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KLHL42Q9P2K6 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KLHL42Q9P2K6 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KLHL42Q9P2K6 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KLHL42Q9P2K6 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
KLHL42Q9P2K6 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KLHL42Q9P2K6 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KLHL42Q9P2K6 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
KLHL42Q9P2K6 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KLHL42Q9P2K6 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KLHL42Q9P2K6 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KLHL42Q9P2K6 OSBP2-219ENST00000535268 3248 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KLHL42Q9P2K6 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KLHL42Q9P2K6 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KLHL42Q9P2K6 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KLHL42Q9P2K6 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
KLHL42Q9P2K6 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KLHL42Q9P2K6 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KLHL42Q9P2K6 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KLHL42Q9P2K6 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KLHL42Q9P2K6 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
KLHL42Q9P2K6 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KLHL42Q9P2K6 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KLHL42Q9P2K6 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KLHL42Q9P2K6 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KLHL42Q9P2K6 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KLHL42Q9P2K6 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KLHL42Q9P2K6 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KLHL42Q9P2K6 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KLHL42Q9P2K6 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KLHL42Q9P2K6 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KLHL42Q9P2K6 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KLHL42Q9P2K6 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KLHL42Q9P2K6 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KLHL42Q9P2K6 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KLHL42Q9P2K6 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KLHL42Q9P2K6 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KLHL42Q9P2K6 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KLHL42Q9P2K6 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
KLHL42Q9P2K6 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
KLHL42Q9P2K6 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
KLHL42Q9P2K6 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KLHL42Q9P2K6 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KLHL42Q9P2K6 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KLHL42Q9P2K6 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KLHL42Q9P2K6 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
KLHL42Q9P2K6 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
KLHL42Q9P2K6 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KLHL42Q9P2K6 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
KLHL42Q9P2K6 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KLHL42Q9P2K6 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KLHL42Q9P2K6 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KLHL42Q9P2K6 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KLHL42Q9P2K6 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KLHL42Q9P2K6 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KLHL42Q9P2K6 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KLHL42Q9P2K6 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KLHL42Q9P2K6 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KLHL42Q9P2K6 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KLHL42Q9P2K6 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KLHL42Q9P2K6 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KLHL42Q9P2K6 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KLHL42Q9P2K6 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KLHL42Q9P2K6 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KLHL42Q9P2K6 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KLHL42Q9P2K6 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KLHL42Q9P2K6 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KLHL42Q9P2K6 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KLHL42Q9P2K6 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KLHL42Q9P2K6 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KLHL42Q9P2K6 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KLHL42Q9P2K6 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KLHL42Q9P2K6 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KLHL42Q9P2K6 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KLHL42Q9P2K6 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KLHL42Q9P2K6 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KLHL42Q9P2K6 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KLHL42Q9P2K6 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KLHL42Q9P2K6 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KLHL42Q9P2K6 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.8 ms