Protein–RNA interactions for Protein: Q9P219

CCDC88C, Protein Daple, humanhuman

Predictions only

Length 2,028 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC88CQ9P219 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CCDC88CQ9P219 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CCDC88CQ9P219 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CCDC88CQ9P219 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CCDC88CQ9P219 DDC-202ENST00000380984 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CCDC88CQ9P219 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CCDC88CQ9P219 NPY5R-203ENST00000515560 3183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CCDC88CQ9P219 PXMP4-202ENST00000344022 989 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CCDC88CQ9P219 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CCDC88CQ9P219 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CCDC88CQ9P219 CUTA-202ENST00000374496 762 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CCDC88CQ9P219 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CCDC88CQ9P219 ARL6IP4-207ENST00000426960 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
CCDC88CQ9P219 PTPA-220ENST00000436883 532 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
CCDC88CQ9P219 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC15.06■□□□□ 0
CCDC88CQ9P219 GALT-202ENST00000450095 1280 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CCDC88CQ9P219 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
CCDC88CQ9P219 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CCDC88CQ9P219 SLC8B1-206ENST00000549069 1058 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CCDC88CQ9P219 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
CCDC88CQ9P219 CCL4L2-214ENST00000617416 1258 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CCDC88CQ9P219 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CCDC88CQ9P219 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CCDC88CQ9P219 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CCDC88CQ9P219 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CCDC88CQ9P219 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CCDC88CQ9P219 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CCDC88CQ9P219 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CCDC88CQ9P219 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CCDC88CQ9P219 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CCDC88CQ9P219 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CCDC88CQ9P219 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CCDC88CQ9P219 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CCDC88CQ9P219 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CCDC88CQ9P219 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
CCDC88CQ9P219 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC15.05■□□□□ 0
CCDC88CQ9P219 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CCDC88CQ9P219 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CCDC88CQ9P219 TSPO-202ENST00000337554 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CCDC88CQ9P219 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CCDC88CQ9P219 PGF-202ENST00000405431 666 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
CCDC88CQ9P219 AC020915.1-202ENST00000427361 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
CCDC88CQ9P219 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC15.05■□□□□ 0
CCDC88CQ9P219 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CCDC88CQ9P219 AC008378.1-201ENST00000521251 496 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
CCDC88CQ9P219 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
CCDC88CQ9P219 TMEM218-210ENST00000529609 734 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ 0
CCDC88CQ9P219 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
CCDC88CQ9P219 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CCDC88CQ9P219 AC005785.1-202ENST00000597164 237 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ 0
CCDC88CQ9P219 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ 0
CCDC88CQ9P219 AC008494.3-201ENST00000606615 944 ntBASIC15.05■□□□□ 0
CCDC88CQ9P219 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CCDC88CQ9P219 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
CCDC88CQ9P219 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CCDC88CQ9P219 NYNRIN-201ENST00000382554 7857 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
CCDC88CQ9P219 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CCDC88CQ9P219 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
CCDC88CQ9P219 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CCDC88CQ9P219 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CCDC88CQ9P219 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ 0
CCDC88CQ9P219 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CCDC88CQ9P219 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CCDC88CQ9P219 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CCDC88CQ9P219 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CCDC88CQ9P219 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CCDC88CQ9P219 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CCDC88CQ9P219 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CCDC88CQ9P219 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CCDC88CQ9P219 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CCDC88CQ9P219 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CCDC88CQ9P219 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CCDC88CQ9P219 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CCDC88CQ9P219 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
CCDC88CQ9P219 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CCDC88CQ9P219 SPATA8-AS1-201ENST00000558722 465 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
CCDC88CQ9P219 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC15.05■□□□□ -0
CCDC88CQ9P219 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CCDC88CQ9P219 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CCDC88CQ9P219 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CCDC88CQ9P219 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CCDC88CQ9P219 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC15.05■□□□□ -0
CCDC88CQ9P219 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CCDC88CQ9P219 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CCDC88CQ9P219 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CCDC88CQ9P219 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CCDC88CQ9P219 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CCDC88CQ9P219 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CCDC88CQ9P219 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CCDC88CQ9P219 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CCDC88CQ9P219 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CCDC88CQ9P219 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CCDC88CQ9P219 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CCDC88CQ9P219 AC063926.2-201ENST00000623766 1308 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CCDC88CQ9P219 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CCDC88CQ9P219 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CCDC88CQ9P219 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CCDC88CQ9P219 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CCDC88CQ9P219 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CCDC88CQ9P219 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.8 ms