Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRS4

TMPRSS4, Transmembrane protease serine 4, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMPRSS4Q9NRS4 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMPRSS4Q9NRS4 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
TMPRSS4Q9NRS4 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMPRSS4Q9NRS4 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
TMPRSS4Q9NRS4 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMPRSS4Q9NRS4 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMPRSS4Q9NRS4 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TMPRSS4Q9NRS4 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TMPRSS4Q9NRS4 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TMPRSS4Q9NRS4 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TMPRSS4Q9NRS4 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TMPRSS4Q9NRS4 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TMPRSS4Q9NRS4 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TMPRSS4Q9NRS4 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TMPRSS4Q9NRS4 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TMPRSS4Q9NRS4 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TMPRSS4Q9NRS4 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TMPRSS4Q9NRS4 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TMPRSS4Q9NRS4 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TMPRSS4Q9NRS4 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TMPRSS4Q9NRS4 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TMPRSS4Q9NRS4 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TMPRSS4Q9NRS4 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TMPRSS4Q9NRS4 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TMPRSS4Q9NRS4 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TMPRSS4Q9NRS4 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TMPRSS4Q9NRS4 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TMPRSS4Q9NRS4 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TMPRSS4Q9NRS4 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TMPRSS4Q9NRS4 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TMPRSS4Q9NRS4 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TMPRSS4Q9NRS4 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TMPRSS4Q9NRS4 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TMPRSS4Q9NRS4 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TMPRSS4Q9NRS4 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
TMPRSS4Q9NRS4 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
TMPRSS4Q9NRS4 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TMPRSS4Q9NRS4 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TMPRSS4Q9NRS4 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TMPRSS4Q9NRS4 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TMPRSS4Q9NRS4 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TMPRSS4Q9NRS4 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TMPRSS4Q9NRS4 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TMPRSS4Q9NRS4 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TMPRSS4Q9NRS4 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TMPRSS4Q9NRS4 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TMPRSS4Q9NRS4 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TMPRSS4Q9NRS4 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TMPRSS4Q9NRS4 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TMPRSS4Q9NRS4 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TMPRSS4Q9NRS4 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TMPRSS4Q9NRS4 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TMPRSS4Q9NRS4 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TMPRSS4Q9NRS4 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TMPRSS4Q9NRS4 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TMPRSS4Q9NRS4 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
TMPRSS4Q9NRS4 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TMPRSS4Q9NRS4 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TMPRSS4Q9NRS4 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TMPRSS4Q9NRS4 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TMPRSS4Q9NRS4 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TMPRSS4Q9NRS4 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
TMPRSS4Q9NRS4 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TMPRSS4Q9NRS4 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TMPRSS4Q9NRS4 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TMPRSS4Q9NRS4 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TMPRSS4Q9NRS4 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TMPRSS4Q9NRS4 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TMPRSS4Q9NRS4 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TMPRSS4Q9NRS4 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TMPRSS4Q9NRS4 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TMPRSS4Q9NRS4 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TMPRSS4Q9NRS4 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TMPRSS4Q9NRS4 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TMPRSS4Q9NRS4 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
TMPRSS4Q9NRS4 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TMPRSS4Q9NRS4 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TMPRSS4Q9NRS4 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
TMPRSS4Q9NRS4 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TMPRSS4Q9NRS4 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TMPRSS4Q9NRS4 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
TMPRSS4Q9NRS4 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
TMPRSS4Q9NRS4 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
TMPRSS4Q9NRS4 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
TMPRSS4Q9NRS4 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TMPRSS4Q9NRS4 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TMPRSS4Q9NRS4 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TMPRSS4Q9NRS4 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TMPRSS4Q9NRS4 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TMPRSS4Q9NRS4 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TMPRSS4Q9NRS4 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TMPRSS4Q9NRS4 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TMPRSS4Q9NRS4 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TMPRSS4Q9NRS4 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TMPRSS4Q9NRS4 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TMPRSS4Q9NRS4 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TMPRSS4Q9NRS4 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TMPRSS4Q9NRS4 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TMPRSS4Q9NRS4 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TMPRSS4Q9NRS4 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45 ms