Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYV2

TRIM54, Tripartite motif-containing protein 54, humanhuman

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM54Q9BYV2 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TRIM54Q9BYV2 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TRIM54Q9BYV2 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
TRIM54Q9BYV2 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
TRIM54Q9BYV2 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TRIM54Q9BYV2 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TRIM54Q9BYV2 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TRIM54Q9BYV2 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
TRIM54Q9BYV2 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TRIM54Q9BYV2 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
TRIM54Q9BYV2 CUL7-203ENST00000535468 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TRIM54Q9BYV2 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TRIM54Q9BYV2 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TRIM54Q9BYV2 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TRIM54Q9BYV2 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TRIM54Q9BYV2 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
TRIM54Q9BYV2 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TRIM54Q9BYV2 CNTNAP3-202ENST00000358144 4885 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TRIM54Q9BYV2 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TRIM54Q9BYV2 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TRIM54Q9BYV2 CPEB2-205ENST00000442003 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TRIM54Q9BYV2 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TRIM54Q9BYV2 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TRIM54Q9BYV2 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TRIM54Q9BYV2 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TRIM54Q9BYV2 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TRIM54Q9BYV2 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TRIM54Q9BYV2 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TRIM54Q9BYV2 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TRIM54Q9BYV2 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRIM54Q9BYV2 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRIM54Q9BYV2 TBC1D16-209ENST00000576768 6342 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRIM54Q9BYV2 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRIM54Q9BYV2 SEMA4F-210ENST00000611975 6007 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRIM54Q9BYV2 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRIM54Q9BYV2 AC021683.3-202ENST00000592572 4440 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRIM54Q9BYV2 ZNF831-201ENST00000371030 9401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRIM54Q9BYV2 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRIM54Q9BYV2 FARP1-214ENST00000595437 4926 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRIM54Q9BYV2 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRIM54Q9BYV2 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRIM54Q9BYV2 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRIM54Q9BYV2 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRIM54Q9BYV2 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRIM54Q9BYV2 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRIM54Q9BYV2 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRIM54Q9BYV2 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRIM54Q9BYV2 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRIM54Q9BYV2 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRIM54Q9BYV2 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRIM54Q9BYV2 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRIM54Q9BYV2 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRIM54Q9BYV2 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRIM54Q9BYV2 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRIM54Q9BYV2 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
TRIM54Q9BYV2 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRIM54Q9BYV2 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
TRIM54Q9BYV2 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRIM54Q9BYV2 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRIM54Q9BYV2 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRIM54Q9BYV2 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
TRIM54Q9BYV2 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRIM54Q9BYV2 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
TRIM54Q9BYV2 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRIM54Q9BYV2 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRIM54Q9BYV2 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRIM54Q9BYV2 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
TRIM54Q9BYV2 XKR5-201ENST00000618742 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRIM54Q9BYV2 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRIM54Q9BYV2 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRIM54Q9BYV2 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRIM54Q9BYV2 ZBTB7C-213ENST00000588982 4949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRIM54Q9BYV2 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRIM54Q9BYV2 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRIM54Q9BYV2 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRIM54Q9BYV2 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRIM54Q9BYV2 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRIM54Q9BYV2 MROH1-207ENST00000528919 5234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRIM54Q9BYV2 SYAP1-201ENST00000380155 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRIM54Q9BYV2 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRIM54Q9BYV2 KCTD15-201ENST00000284006 4918 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRIM54Q9BYV2 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRIM54Q9BYV2 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRIM54Q9BYV2 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRIM54Q9BYV2 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRIM54Q9BYV2 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRIM54Q9BYV2 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRIM54Q9BYV2 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRIM54Q9BYV2 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRIM54Q9BYV2 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRIM54Q9BYV2 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRIM54Q9BYV2 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRIM54Q9BYV2 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRIM54Q9BYV2 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRIM54Q9BYV2 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRIM54Q9BYV2 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRIM54Q9BYV2 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRIM54Q9BYV2 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRIM54Q9BYV2 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRIM54Q9BYV2 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.8 ms