Protein–RNA interactions for Protein: Q9BW71

HIRIP3, HIRA-interacting protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 556 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIRIP3Q9BW71 ACAP1-208ENST00000574499 412 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
HIRIP3Q9BW71 AC087294.1-201ENST00000580291 1152 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
HIRIP3Q9BW71 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
HIRIP3Q9BW71 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HIRIP3Q9BW71 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HIRIP3Q9BW71 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HIRIP3Q9BW71 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
HIRIP3Q9BW71 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
HIRIP3Q9BW71 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
HIRIP3Q9BW71 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HIRIP3Q9BW71 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
HIRIP3Q9BW71 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
HIRIP3Q9BW71 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HIRIP3Q9BW71 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
HIRIP3Q9BW71 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
HIRIP3Q9BW71 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HIRIP3Q9BW71 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
HIRIP3Q9BW71 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
HIRIP3Q9BW71 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
HIRIP3Q9BW71 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
HIRIP3Q9BW71 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
HIRIP3Q9BW71 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
HIRIP3Q9BW71 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
HIRIP3Q9BW71 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
HIRIP3Q9BW71 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
HIRIP3Q9BW71 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
HIRIP3Q9BW71 PXMP4-202ENST00000344022 989 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
HIRIP3Q9BW71 C1orf68-201ENST00000368775 949 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
HIRIP3Q9BW71 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
HIRIP3Q9BW71 KRTAP10-1-201ENST00000400375 1215 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
HIRIP3Q9BW71 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
HIRIP3Q9BW71 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
HIRIP3Q9BW71 CTBP2P3-201ENST00000585629 1255 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
HIRIP3Q9BW71 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
HIRIP3Q9BW71 MIR6752-201ENST00000618442 71 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
HIRIP3Q9BW71 AC244517.11-204ENST00000624424 760 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
HIRIP3Q9BW71 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
HIRIP3Q9BW71 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
HIRIP3Q9BW71 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
HIRIP3Q9BW71 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
HIRIP3Q9BW71 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
HIRIP3Q9BW71 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
HIRIP3Q9BW71 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
HIRIP3Q9BW71 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
HIRIP3Q9BW71 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
HIRIP3Q9BW71 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
HIRIP3Q9BW71 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
HIRIP3Q9BW71 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
HIRIP3Q9BW71 DDC-202ENST00000380984 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
HIRIP3Q9BW71 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
HIRIP3Q9BW71 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
HIRIP3Q9BW71 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
HIRIP3Q9BW71 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
HIRIP3Q9BW71 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.64■■□□□ 1.21
HIRIP3Q9BW71 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
HIRIP3Q9BW71 PDCD6-212ENST00000614778 1050 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
HIRIP3Q9BW71 TAMM41-212ENST00000630288 607 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
HIRIP3Q9BW71 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
HIRIP3Q9BW71 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
HIRIP3Q9BW71 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
HIRIP3Q9BW71 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
HIRIP3Q9BW71 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
HIRIP3Q9BW71 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
HIRIP3Q9BW71 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
HIRIP3Q9BW71 SYN1-201ENST00000295987 3299 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
HIRIP3Q9BW71 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HIRIP3Q9BW71 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HIRIP3Q9BW71 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
HIRIP3Q9BW71 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HIRIP3Q9BW71 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
HIRIP3Q9BW71 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HIRIP3Q9BW71 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HIRIP3Q9BW71 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HIRIP3Q9BW71 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
HIRIP3Q9BW71 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
HIRIP3Q9BW71 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
HIRIP3Q9BW71 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HIRIP3Q9BW71 NAA10-201ENST00000370009 837 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HIRIP3Q9BW71 NAA10-203ENST00000370015 1002 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
HIRIP3Q9BW71 WDR38-201ENST00000373574 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HIRIP3Q9BW71 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
HIRIP3Q9BW71 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
HIRIP3Q9BW71 HLA-V-201ENST00000429037 534 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
HIRIP3Q9BW71 TMEM161B-AS1-212ENST00000513011 833 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
HIRIP3Q9BW71 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
HIRIP3Q9BW71 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
HIRIP3Q9BW71 AP001995.1-201ENST00000531784 1157 ntTSL 4 BASIC22.63■■□□□ 1.21
HIRIP3Q9BW71 AC055876.2-201ENST00000531834 546 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
HIRIP3Q9BW71 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
HIRIP3Q9BW71 AC079336.1-201ENST00000583156 420 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
HIRIP3Q9BW71 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HIRIP3Q9BW71 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
HIRIP3Q9BW71 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HIRIP3Q9BW71 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
HIRIP3Q9BW71 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HIRIP3Q9BW71 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HIRIP3Q9BW71 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
HIRIP3Q9BW71 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
HIRIP3Q9BW71 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HIRIP3Q9BW71 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.6 ms