Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVL2

NUP58, Nucleoporin p58/p45, humanhuman

Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP58Q9BVL2 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
NUP58Q9BVL2 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
NUP58Q9BVL2 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
NUP58Q9BVL2 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NUP58Q9BVL2 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
NUP58Q9BVL2 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
NUP58Q9BVL2 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NUP58Q9BVL2 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NUP58Q9BVL2 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NUP58Q9BVL2 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NUP58Q9BVL2 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NUP58Q9BVL2 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NUP58Q9BVL2 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NUP58Q9BVL2 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NUP58Q9BVL2 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
NUP58Q9BVL2 APPL1-201ENST00000288266 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NUP58Q9BVL2 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
NUP58Q9BVL2 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
NUP58Q9BVL2 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NUP58Q9BVL2 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
NUP58Q9BVL2 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NUP58Q9BVL2 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
NUP58Q9BVL2 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NUP58Q9BVL2 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NUP58Q9BVL2 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NUP58Q9BVL2 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NUP58Q9BVL2 PPP3CB-201ENST00000342558 2418 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
NUP58Q9BVL2 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NUP58Q9BVL2 EIF4G1-206ENST00000392537 5229 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
NUP58Q9BVL2 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NUP58Q9BVL2 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
NUP58Q9BVL2 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
NUP58Q9BVL2 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NUP58Q9BVL2 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
NUP58Q9BVL2 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
NUP58Q9BVL2 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NUP58Q9BVL2 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
NUP58Q9BVL2 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
NUP58Q9BVL2 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
NUP58Q9BVL2 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NUP58Q9BVL2 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
NUP58Q9BVL2 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
NUP58Q9BVL2 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
NUP58Q9BVL2 LINC02212-201ENST00000515243 2130 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
NUP58Q9BVL2 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
NUP58Q9BVL2 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NUP58Q9BVL2 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NUP58Q9BVL2 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
NUP58Q9BVL2 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NUP58Q9BVL2 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
NUP58Q9BVL2 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
NUP58Q9BVL2 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NUP58Q9BVL2 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NUP58Q9BVL2 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
NUP58Q9BVL2 MEGF10-202ENST00000418761 2238 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NUP58Q9BVL2 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
NUP58Q9BVL2 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NUP58Q9BVL2 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
NUP58Q9BVL2 GOLGA5-201ENST00000163416 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NUP58Q9BVL2 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NUP58Q9BVL2 GGT6-201ENST00000301395 2534 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
NUP58Q9BVL2 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
NUP58Q9BVL2 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
NUP58Q9BVL2 PLEKHG3-202ENST00000394691 4397 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
NUP58Q9BVL2 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
NUP58Q9BVL2 CFLAR-204ENST00000341582 2056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
NUP58Q9BVL2 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
NUP58Q9BVL2 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
NUP58Q9BVL2 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
NUP58Q9BVL2 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
NUP58Q9BVL2 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
NUP58Q9BVL2 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC17.27■□□□□ 0.36
NUP58Q9BVL2 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
NUP58Q9BVL2 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
NUP58Q9BVL2 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
NUP58Q9BVL2 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
NUP58Q9BVL2 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
NUP58Q9BVL2 SEMA3G-201ENST00000231721 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
NUP58Q9BVL2 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
NUP58Q9BVL2 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
NUP58Q9BVL2 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.35
NUP58Q9BVL2 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
NUP58Q9BVL2 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
NUP58Q9BVL2 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
NUP58Q9BVL2 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
NUP58Q9BVL2 AC027601.1-201ENST00000575922 4506 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
NUP58Q9BVL2 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
NUP58Q9BVL2 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
NUP58Q9BVL2 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
NUP58Q9BVL2 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
NUP58Q9BVL2 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
NUP58Q9BVL2 ECE1-204ENST00000415912 5099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NUP58Q9BVL2 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NUP58Q9BVL2 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NUP58Q9BVL2 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
NUP58Q9BVL2 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NUP58Q9BVL2 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NUP58Q9BVL2 MMRN2-201ENST00000372027 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NUP58Q9BVL2 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
NUP58Q9BVL2 INPP5D-201ENST00000359570 5274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.4 ms