Protein–RNA interactions for Protein: Q96LR9

APOLD1, Apolipoprotein L domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 279 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOLD1Q96LR9 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
APOLD1Q96LR9 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
APOLD1Q96LR9 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
APOLD1Q96LR9 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
APOLD1Q96LR9 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
APOLD1Q96LR9 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
APOLD1Q96LR9 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
APOLD1Q96LR9 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
APOLD1Q96LR9 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
APOLD1Q96LR9 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
APOLD1Q96LR9 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
APOLD1Q96LR9 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
APOLD1Q96LR9 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
APOLD1Q96LR9 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
APOLD1Q96LR9 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
APOLD1Q96LR9 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
APOLD1Q96LR9 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
APOLD1Q96LR9 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
APOLD1Q96LR9 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
APOLD1Q96LR9 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
APOLD1Q96LR9 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
APOLD1Q96LR9 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
APOLD1Q96LR9 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
APOLD1Q96LR9 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
APOLD1Q96LR9 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
APOLD1Q96LR9 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
APOLD1Q96LR9 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
APOLD1Q96LR9 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
APOLD1Q96LR9 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
APOLD1Q96LR9 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
APOLD1Q96LR9 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
APOLD1Q96LR9 KIAA0907-201ENST00000368319 1155 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
APOLD1Q96LR9 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
APOLD1Q96LR9 MXI1-205ENST00000393134 889 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
APOLD1Q96LR9 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
APOLD1Q96LR9 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC15.71■□□□□ 0.11
APOLD1Q96LR9 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
APOLD1Q96LR9 MYCLP2-201ENST00000449268 967 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
APOLD1Q96LR9 AL606760.2-202ENST00000452466 524 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
APOLD1Q96LR9 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
APOLD1Q96LR9 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
APOLD1Q96LR9 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
APOLD1Q96LR9 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
APOLD1Q96LR9 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
APOLD1Q96LR9 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
APOLD1Q96LR9 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
APOLD1Q96LR9 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
APOLD1Q96LR9 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
APOLD1Q96LR9 AC105339.1-202ENST00000559535 1283 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
APOLD1Q96LR9 ACAP1-208ENST00000574499 412 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
APOLD1Q96LR9 AC073389.2-202ENST00000607450 441 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
APOLD1Q96LR9 AC017083.2-201ENST00000608069 979 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
APOLD1Q96LR9 AL162274.1-201ENST00000617191 1098 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
APOLD1Q96LR9 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
APOLD1Q96LR9 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
APOLD1Q96LR9 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
APOLD1Q96LR9 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
APOLD1Q96LR9 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
APOLD1Q96LR9 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
APOLD1Q96LR9 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
APOLD1Q96LR9 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
APOLD1Q96LR9 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
APOLD1Q96LR9 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
APOLD1Q96LR9 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC15.71■□□□□ 0.1
APOLD1Q96LR9 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
APOLD1Q96LR9 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
APOLD1Q96LR9 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
APOLD1Q96LR9 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
APOLD1Q96LR9 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
APOLD1Q96LR9 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
APOLD1Q96LR9 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
APOLD1Q96LR9 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
APOLD1Q96LR9 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
APOLD1Q96LR9 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
APOLD1Q96LR9 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
APOLD1Q96LR9 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
APOLD1Q96LR9 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
APOLD1Q96LR9 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
APOLD1Q96LR9 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
APOLD1Q96LR9 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
APOLD1Q96LR9 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
APOLD1Q96LR9 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
APOLD1Q96LR9 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
APOLD1Q96LR9 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
APOLD1Q96LR9 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
APOLD1Q96LR9 NAA10-201ENST00000370009 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
APOLD1Q96LR9 NAA10-203ENST00000370015 1002 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
APOLD1Q96LR9 HLA-V-201ENST00000429037 534 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
APOLD1Q96LR9 AL161785.3-201ENST00000435157 395 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
APOLD1Q96LR9 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
APOLD1Q96LR9 ZFPL1-207ENST00000526791 384 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
APOLD1Q96LR9 AC123567.1-201ENST00000548294 1261 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
APOLD1Q96LR9 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
APOLD1Q96LR9 AC099568.2-201ENST00000609194 695 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
APOLD1Q96LR9 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
APOLD1Q96LR9 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
APOLD1Q96LR9 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
APOLD1Q96LR9 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
APOLD1Q96LR9 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
APOLD1Q96LR9 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms