Protein–RNA interactions for Protein: Q96L08

SUSD3, Sushi domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUSD3Q96L08 PRAF2-201ENST00000376386 801 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SUSD3Q96L08 AGTRAP-202ENST00000376627 1055 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SUSD3Q96L08 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SUSD3Q96L08 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SUSD3Q96L08 FAM221A-203ENST00000409653 761 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SUSD3Q96L08 FAM221A-204ENST00000409994 1136 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SUSD3Q96L08 AL645941.1-201ENST00000415875 338 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SUSD3Q96L08 KIF9-205ENST00000432493 633 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SUSD3Q96L08 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SUSD3Q96L08 RPS2P32-201ENST00000439199 892 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
SUSD3Q96L08 LINC01939-201ENST00000445279 694 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SUSD3Q96L08 KRT223P-202ENST00000449164 1292 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
SUSD3Q96L08 ASF1B-202ENST00000474890 765 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SUSD3Q96L08 HBS1L-208ENST00000525067 582 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SUSD3Q96L08 AP001582.1-201ENST00000525856 295 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
SUSD3Q96L08 RPL28-206ENST00000558752 671 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SUSD3Q96L08 CMTM3-212ENST00000566121 572 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SUSD3Q96L08 COX6B1-204ENST00000592141 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SUSD3Q96L08 SCGB1C2-201ENST00000595228 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SUSD3Q96L08 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
SUSD3Q96L08 AC133552.6-201ENST00000613406 534 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
SUSD3Q96L08 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SUSD3Q96L08 FBLN7-203ENST00000409450 1394 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SUSD3Q96L08 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SUSD3Q96L08 AL138799.1-201ENST00000448213 1675 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
SUSD3Q96L08 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SUSD3Q96L08 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SUSD3Q96L08 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SUSD3Q96L08 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SUSD3Q96L08 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SUSD3Q96L08 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SUSD3Q96L08 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SUSD3Q96L08 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SUSD3Q96L08 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SUSD3Q96L08 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SUSD3Q96L08 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SUSD3Q96L08 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SUSD3Q96L08 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SUSD3Q96L08 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SUSD3Q96L08 PRPSAP2-216ENST00000536323 1872 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SUSD3Q96L08 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SUSD3Q96L08 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SUSD3Q96L08 PNMA3-202ENST00000593810 1432 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SUSD3Q96L08 TBCEL-205ENST00000529397 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SUSD3Q96L08 NAT8-201ENST00000272425 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SUSD3Q96L08 UEVLD-201ENST00000300038 995 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SUSD3Q96L08 PRKN-201ENST00000338468 1276 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SUSD3Q96L08 PTPA-213ENST00000419582 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SUSD3Q96L08 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SUSD3Q96L08 AP000552.1-208ENST00000452952 576 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SUSD3Q96L08 ARHGEF26-AS1-201ENST00000467912 628 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SUSD3Q96L08 MPZL1-209ENST00000474859 630 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SUSD3Q96L08 AC083973.1-206ENST00000518213 815 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SUSD3Q96L08 OVOL1-AS1-202ENST00000532454 494 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SUSD3Q96L08 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SUSD3Q96L08 AL118558.1-202ENST00000557242 451 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SUSD3Q96L08 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SUSD3Q96L08 SNAP25-AS1-208ENST00000605592 556 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SUSD3Q96L08 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SUSD3Q96L08 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SUSD3Q96L08 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SUSD3Q96L08 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SUSD3Q96L08 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SUSD3Q96L08 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SUSD3Q96L08 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SUSD3Q96L08 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SUSD3Q96L08 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SUSD3Q96L08 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SUSD3Q96L08 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SUSD3Q96L08 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SUSD3Q96L08 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SUSD3Q96L08 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SUSD3Q96L08 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SUSD3Q96L08 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SUSD3Q96L08 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SUSD3Q96L08 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SUSD3Q96L08 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SUSD3Q96L08 MUTYH-234ENST00000528013 1662 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SUSD3Q96L08 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SUSD3Q96L08 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SUSD3Q96L08 AC118344.1-201ENST00000378432 1462 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SUSD3Q96L08 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SUSD3Q96L08 SLC25A2-201ENST00000239451 1417 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SUSD3Q96L08 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SUSD3Q96L08 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SUSD3Q96L08 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SUSD3Q96L08 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SUSD3Q96L08 SHBG-202ENST00000380450 1271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SUSD3Q96L08 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SUSD3Q96L08 ZFAND2B-203ENST00000409206 1159 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SUSD3Q96L08 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SUSD3Q96L08 RPS24-203ENST00000435275 656 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SUSD3Q96L08 RNF216P1-213ENST00000494947 946 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SUSD3Q96L08 AC106760.1-201ENST00000508690 800 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
SUSD3Q96L08 FLJ27354-203ENST00000526694 851 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SUSD3Q96L08 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SUSD3Q96L08 AC027601.2-201ENST00000571085 805 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SUSD3Q96L08 KSR1-207ENST00000578981 748 ntTSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SUSD3Q96L08 AC079336.1-201ENST00000583156 420 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SUSD3Q96L08 RPS24-214ENST00000613865 538 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.4 ms