Protein–RNA interactions for Protein: Q93008

USP9X, Probable ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase FAF-X, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 2,570 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP9XQ93008 CTB-178M22.2-201ENST00000519795 503 ntTSL 4 BASIC13.51□□□□□ -0.25
USP9XQ93008 SNHG14-213ENST00000551077 638 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
USP9XQ93008 AL118516.1-201ENST00000564152 670 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
USP9XQ93008 MIR4683-201ENST00000579659 81 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
USP9XQ93008 AP005901.3-201ENST00000581666 415 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
USP9XQ93008 FAM104A-206ENST00000583024 417 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
USP9XQ93008 AC079336.4-201ENST00000584219 408 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
USP9XQ93008 IRF3-215ENST00000596822 823 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
USP9XQ93008 AP001002.3-201ENST00000623482 206 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
USP9XQ93008 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
USP9XQ93008 HTR4-209ENST00000521530 1323 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
USP9XQ93008 METTL6-201ENST00000383789 1413 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
USP9XQ93008 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
USP9XQ93008 SLC44A3-209ENST00000532427 1912 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
USP9XQ93008 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
USP9XQ93008 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
USP9XQ93008 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
USP9XQ93008 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
USP9XQ93008 ALPL-207ENST00000540617 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
USP9XQ93008 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
USP9XQ93008 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
USP9XQ93008 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
USP9XQ93008 P2RX5-208ENST00000552050 1536 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
USP9XQ93008 SPACA3-201ENST00000269053 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
USP9XQ93008 GSG1L-201ENST00000380897 1173 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
USP9XQ93008 CDRT15-201ENST00000420162 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
USP9XQ93008 AC233976.1-201ENST00000425150 451 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
USP9XQ93008 AC012362.1-201ENST00000434906 739 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
USP9XQ93008 AGPAT5P1-201ENST00000455855 1019 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
USP9XQ93008 AL157792.1-201ENST00000488281 530 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
USP9XQ93008 TPD52L1-208ENST00000528193 789 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
USP9XQ93008 AC007656.1-201ENST00000552238 573 ntTSL 4 BASIC13.51□□□□□ -0.25
USP9XQ93008 SPACA3-205ENST00000580599 949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
USP9XQ93008 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
USP9XQ93008 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
USP9XQ93008 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
USP9XQ93008 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
USP9XQ93008 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
USP9XQ93008 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
USP9XQ93008 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
USP9XQ93008 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
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USP9XQ93008 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
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USP9XQ93008 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
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USP9XQ93008 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
USP9XQ93008 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
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USP9XQ93008 TMEM219-204ENST00000566848 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
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USP9XQ93008 IGHA2-202ENST00000497872 1320 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
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USP9XQ93008 OR9I1-201ENST00000302610 945 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
USP9XQ93008 C1QB-201ENST00000314933 1044 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
USP9XQ93008 PSMB10-201ENST00000358514 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
USP9XQ93008 UROS-201ENST00000368774 744 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
USP9XQ93008 HDAC8-204ENST00000373560 819 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
USP9XQ93008 MCFD2-204ENST00000409207 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
USP9XQ93008 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
USP9XQ93008 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
USP9XQ93008 FAM86B1-218ENST00000534520 808 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
USP9XQ93008 RTN3P1-201ENST00000536295 711 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
USP9XQ93008 DNM1P51-201ENST00000558149 522 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
USP9XQ93008 AC084262.1-201ENST00000567818 751 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
USP9XQ93008 GHRHR-212ENST00000611037 923 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
USP9XQ93008 MEG3_2.1-201ENST00000611456 105 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
USP9XQ93008 AC105137.3-201ENST00000617588 984 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
USP9XQ93008 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
USP9XQ93008 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
USP9XQ93008 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
USP9XQ93008 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
USP9XQ93008 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
USP9XQ93008 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
USP9XQ93008 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
USP9XQ93008 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
USP9XQ93008 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
USP9XQ93008 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
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