Protein–RNA interactions for Protein: Q3BBV0

NBPF1, Neuroblastoma breakpoint family member 1, humanhuman

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Length 1,214 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NBPF1Q3BBV0 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NBPF1Q3BBV0 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NBPF1Q3BBV0 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NBPF1Q3BBV0 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NBPF1Q3BBV0 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NBPF1Q3BBV0 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NBPF1Q3BBV0 LINC01185-202ENST00000452343 1705 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NBPF1Q3BBV0 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NBPF1Q3BBV0 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NBPF1Q3BBV0 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NBPF1Q3BBV0 RABEPK-206ENST00000628863 1537 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NBPF1Q3BBV0 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NBPF1Q3BBV0 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NBPF1Q3BBV0 LBX2-201ENST00000341396 886 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NBPF1Q3BBV0 PGGT1B-202ENST00000379615 903 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NBPF1Q3BBV0 SGK2-207ENST00000426287 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NBPF1Q3BBV0 KRT223P-202ENST00000449164 1292 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
NBPF1Q3BBV0 ARHGEF26-AS1-201ENST00000467912 628 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NBPF1Q3BBV0 AC104989.1-201ENST00000519711 778 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
NBPF1Q3BBV0 MFF-223ENST00000524634 647 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NBPF1Q3BBV0 AC136475.5-202ENST00000524824 587 ntTSL 4 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NBPF1Q3BBV0 AC125603.2-201ENST00000546835 876 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NBPF1Q3BBV0 PIGL-212ENST00000581006 554 ntTSL 4 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NBPF1Q3BBV0 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NBPF1Q3BBV0 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NBPF1Q3BBV0 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NBPF1Q3BBV0 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NBPF1Q3BBV0 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NBPF1Q3BBV0 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NBPF1Q3BBV0 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
NBPF1Q3BBV0 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NBPF1Q3BBV0 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NBPF1Q3BBV0 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NBPF1Q3BBV0 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
NBPF1Q3BBV0 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NBPF1Q3BBV0 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
NBPF1Q3BBV0 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
NBPF1Q3BBV0 ACKR1-201ENST00000368121 1240 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
NBPF1Q3BBV0 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
NBPF1Q3BBV0 BRF1-202ENST00000379932 884 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
NBPF1Q3BBV0 AC099336.1-201ENST00000417053 1171 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
NBPF1Q3BBV0 PTPA-213ENST00000419582 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NBPF1Q3BBV0 KIF9-205ENST00000432493 633 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NBPF1Q3BBV0 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
NBPF1Q3BBV0 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
NBPF1Q3BBV0 ROPN1-207ENST00000484329 566 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
NBPF1Q3BBV0 AC109479.1-201ENST00000519603 624 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
NBPF1Q3BBV0 AC009486.1-201ENST00000569860 813 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
NBPF1Q3BBV0 AL033527.4-201ENST00000641026 673 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
NBPF1Q3BBV0 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
NBPF1Q3BBV0 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
NBPF1Q3BBV0 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NBPF1Q3BBV0 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
NBPF1Q3BBV0 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NBPF1Q3BBV0 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NBPF1Q3BBV0 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NBPF1Q3BBV0 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NBPF1Q3BBV0 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
NBPF1Q3BBV0 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
NBPF1Q3BBV0 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NBPF1Q3BBV0 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
NBPF1Q3BBV0 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
NBPF1Q3BBV0 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NBPF1Q3BBV0 NEU3-206ENST00000532963 1643 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
NBPF1Q3BBV0 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NBPF1Q3BBV0 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
NBPF1Q3BBV0 RTN4IP1-201ENST00000369063 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NBPF1Q3BBV0 PRPSAP2-216ENST00000536323 1872 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
NBPF1Q3BBV0 RMDN1-212ENST00000519966 1164 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
NBPF1Q3BBV0 C17orf49-209ENST00000552775 779 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
NBPF1Q3BBV0 AP005482.1-201ENST00000563722 1273 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
NBPF1Q3BBV0 RPL36-203ENST00000577222 874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
NBPF1Q3BBV0 AC008805.2-201ENST00000590069 435 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
NBPF1Q3BBV0 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
NBPF1Q3BBV0 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NBPF1Q3BBV0 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
NBPF1Q3BBV0 POMP-201ENST00000380842 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NBPF1Q3BBV0 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
NBPF1Q3BBV0 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
NBPF1Q3BBV0 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NBPF1Q3BBV0 PNMA3-202ENST00000593810 1432 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
NBPF1Q3BBV0 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NBPF1Q3BBV0 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NBPF1Q3BBV0 NSUN5P1-204ENST00000428392 1562 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
NBPF1Q3BBV0 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NBPF1Q3BBV0 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NBPF1Q3BBV0 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NBPF1Q3BBV0 LINC00094-204ENST00000599836 1689 ntAPPRIS P5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
NBPF1Q3BBV0 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NBPF1Q3BBV0 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
NBPF1Q3BBV0 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
NBPF1Q3BBV0 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
NBPF1Q3BBV0 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NBPF1Q3BBV0 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NBPF1Q3BBV0 AGRP-201ENST00000290953 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NBPF1Q3BBV0 RPL39L-201ENST00000296277 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NBPF1Q3BBV0 CRYAA-203ENST00000398133 600 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
NBPF1Q3BBV0 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
NBPF1Q3BBV0 AL354761.2-202ENST00000430816 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
NBPF1Q3BBV0 AL031283.3-201ENST00000439788 727 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
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