Protein–RNA interactions for Protein: Q16836

HADH, Hydroxyacyl-coenzyme A dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 314 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HADHQ16836 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HADHQ16836 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HADHQ16836 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HADHQ16836 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HADHQ16836 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HADHQ16836 CPEB3-201ENST00000265997 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HADHQ16836 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HADHQ16836 MAST1-201ENST00000251472 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HADHQ16836 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HADHQ16836 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HADHQ16836 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HADHQ16836 NID1-201ENST00000264187 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HADHQ16836 MFN2-203ENST00000444836 4531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HADHQ16836 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HADHQ16836 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HADHQ16836 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HADHQ16836 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HADHQ16836 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HADHQ16836 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HADHQ16836 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
HADHQ16836 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HADHQ16836 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HADHQ16836 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HADHQ16836 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HADHQ16836 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HADHQ16836 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HADHQ16836 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HADHQ16836 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
HADHQ16836 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
HADHQ16836 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HADHQ16836 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HADHQ16836 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HADHQ16836 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HADHQ16836 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HADHQ16836 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
HADHQ16836 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HADHQ16836 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HADHQ16836 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HADHQ16836 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HADHQ16836 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HADHQ16836 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HADHQ16836 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HADHQ16836 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HADHQ16836 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HADHQ16836 PLXDC1-201ENST00000315392 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HADHQ16836 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HADHQ16836 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HADHQ16836 CLEC16A-203ENST00000409790 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HADHQ16836 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HADHQ16836 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HADHQ16836 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HADHQ16836 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HADHQ16836 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HADHQ16836 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HADHQ16836 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HADHQ16836 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HADHQ16836 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HADHQ16836 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HADHQ16836 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HADHQ16836 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HADHQ16836 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HADHQ16836 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HADHQ16836 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HADHQ16836 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HADHQ16836 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HADHQ16836 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HADHQ16836 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
HADHQ16836 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
HADHQ16836 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HADHQ16836 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HADHQ16836 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HADHQ16836 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
HADHQ16836 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HADHQ16836 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HADHQ16836 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HADHQ16836 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HADHQ16836 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
HADHQ16836 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
HADHQ16836 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HADHQ16836 MINK1-201ENST00000347992 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HADHQ16836 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HADHQ16836 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HADHQ16836 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HADHQ16836 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HADHQ16836 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HADHQ16836 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HADHQ16836 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HADHQ16836 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HADHQ16836 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HADHQ16836 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HADHQ16836 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HADHQ16836 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HADHQ16836 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HADHQ16836 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HADHQ16836 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HADHQ16836 KCTD15-201ENST00000284006 4918 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HADHQ16836 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HADHQ16836 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HADHQ16836 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HADHQ16836 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.5 ms