Protein–RNA interactions for Protein: Q16828

DUSP6, Dual specificity protein phosphatase 6, humanhuman

Predictions only

Length 381 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP6Q16828 AC005597.1-201ENST00000588092 420 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
DUSP6Q16828 SEPT9-233ENST00000590917 541 ntTSL 4 BASIC16.33■□□□□ 0.2
DUSP6Q16828 NDUFV2P1-201ENST00000596415 907 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
DUSP6Q16828 AC011495.3-201ENST00000596472 427 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
DUSP6Q16828 AC138627.1-207ENST00000641560 1006 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
DUSP6Q16828 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
DUSP6Q16828 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
DUSP6Q16828 CENPBD1P1-204ENST00000487264 1308 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
DUSP6Q16828 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
DUSP6Q16828 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
DUSP6Q16828 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
DUSP6Q16828 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
DUSP6Q16828 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
DUSP6Q16828 NSUN5P1-204ENST00000428392 1562 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
DUSP6Q16828 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
DUSP6Q16828 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
DUSP6Q16828 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
DUSP6Q16828 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
DUSP6Q16828 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
DUSP6Q16828 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
DUSP6Q16828 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
DUSP6Q16828 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
DUSP6Q16828 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
DUSP6Q16828 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
DUSP6Q16828 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
DUSP6Q16828 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
DUSP6Q16828 MAX-205ENST00000358664 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
DUSP6Q16828 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
DUSP6Q16828 HIST2H2AA3-201ENST00000369159 549 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
DUSP6Q16828 PPIE-203ENST00000372830 1198 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
DUSP6Q16828 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
DUSP6Q16828 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
DUSP6Q16828 CRYAA-202ENST00000398132 826 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
DUSP6Q16828 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
DUSP6Q16828 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
DUSP6Q16828 ANAPC13-205ENST00000511751 896 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
DUSP6Q16828 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
DUSP6Q16828 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
DUSP6Q16828 C17orf49-209ENST00000552775 779 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
DUSP6Q16828 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
DUSP6Q16828 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
DUSP6Q16828 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
DUSP6Q16828 FP236240.1-204ENST00000624932 712 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
DUSP6Q16828 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
DUSP6Q16828 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
DUSP6Q16828 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
DUSP6Q16828 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
DUSP6Q16828 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
DUSP6Q16828 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
DUSP6Q16828 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
DUSP6Q16828 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
DUSP6Q16828 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
DUSP6Q16828 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
DUSP6Q16828 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
DUSP6Q16828 AL023775.1-201ENST00000454907 1746 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
DUSP6Q16828 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
DUSP6Q16828 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
DUSP6Q16828 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
DUSP6Q16828 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
DUSP6Q16828 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
DUSP6Q16828 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
DUSP6Q16828 AC012506.3-201ENST00000415245 892 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
DUSP6Q16828 AC233976.1-201ENST00000425150 451 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
DUSP6Q16828 SPATA3-204ENST00000433428 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
DUSP6Q16828 MRPS25-203ENST00000444840 1281 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
DUSP6Q16828 ZNF789-204ENST00000448667 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
DUSP6Q16828 XXYLT1-AS1-201ENST00000458531 431 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
DUSP6Q16828 RN7SL769P-201ENST00000469386 295 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
DUSP6Q16828 GDNF-AS1-201ENST00000503382 604 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
DUSP6Q16828 AL163636.1-201ENST00000554286 915 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
DUSP6Q16828 CHMP4BP1-201ENST00000556017 588 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
DUSP6Q16828 AF111167.2-202ENST00000558267 599 ntTSL 4 BASIC16.31■□□□□ 0.2
DUSP6Q16828 CCNB2-203ENST00000559622 1064 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
DUSP6Q16828 AC092634.5-202ENST00000587736 928 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
DUSP6Q16828 CCL5-202ENST00000605140 1244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
DUSP6Q16828 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
DUSP6Q16828 LINC00595-217ENST00000635545 549 ntTSL 4 BASIC16.31■□□□□ 0.2
DUSP6Q16828 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
DUSP6Q16828 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
DUSP6Q16828 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
DUSP6Q16828 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
DUSP6Q16828 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
DUSP6Q16828 FAM83A-201ENST00000276699 1858 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
DUSP6Q16828 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
DUSP6Q16828 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
DUSP6Q16828 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
DUSP6Q16828 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
DUSP6Q16828 CCDC51-204ENST00000442740 1554 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
DUSP6Q16828 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
DUSP6Q16828 KRT8P19-201ENST00000551916 1455 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
DUSP6Q16828 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
DUSP6Q16828 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
DUSP6Q16828 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
DUSP6Q16828 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
DUSP6Q16828 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC16.3■□□□□ 0.2
DUSP6Q16828 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
DUSP6Q16828 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
DUSP6Q16828 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
DUSP6Q16828 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
DUSP6Q16828 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80 ms