Protein–RNA interactions for Protein: Q16531

DDB1, DNA damage-binding protein 1, humanhuman

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Length 1,140 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDB1Q16531 PNRC1-203ENST00000369472 816 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
DDB1Q16531 AC131097.2-203ENST00000401641 507 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
DDB1Q16531 AC100850.1-201ENST00000506768 649 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
DDB1Q16531 AC093879.1-201ENST00000508959 1176 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
DDB1Q16531 IQSEC3P1-201ENST00000538799 536 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
DDB1Q16531 C14orf132-202ENST00000553782 536 ntTSL 4 BASIC20.22■□□□□ 0.83
DDB1Q16531 C15orf40-211ENST00000565712 559 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
DDB1Q16531 MIR3147-201ENST00000577811 66 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
DDB1Q16531 RN7SL555P-201ENST00000584742 339 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
DDB1Q16531 FBXL12-204ENST00000586469 544 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
DDB1Q16531 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
DDB1Q16531 AC026740.1-201ENST00000607068 791 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
DDB1Q16531 AL023803.2-201ENST00000620080 638 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
DDB1Q16531 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
DDB1Q16531 HCRTR1-202ENST00000373706 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
DDB1Q16531 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
DDB1Q16531 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
DDB1Q16531 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
DDB1Q16531 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
DDB1Q16531 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
DDB1Q16531 ICAM2-201ENST00000412356 1334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
DDB1Q16531 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
DDB1Q16531 HSD17B6-201ENST00000322165 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
DDB1Q16531 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
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DDB1Q16531 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
DDB1Q16531 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
DDB1Q16531 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
DDB1Q16531 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
DDB1Q16531 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC20.21■□□□□ 0.83
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DDB1Q16531 ERCC1-203ENST00000340192 949 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
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DDB1Q16531 C1QTNF1-AS1-202ENST00000581579 865 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
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DDB1Q16531 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
DDB1Q16531 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
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DDB1Q16531 LAMTOR4-201ENST00000341942 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
DDB1Q16531 KLK8-204ENST00000391806 1051 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
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DDB1Q16531 POM121L8P-201ENST00000417732 1281 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
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DDB1Q16531 MYO16-AS1-201ENST00000439299 580 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
DDB1Q16531 POM121L9P-203ENST00000441984 1285 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
DDB1Q16531 AL160290.2-202ENST00000448671 574 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
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DDB1Q16531 AC113192.2-201ENST00000525320 308 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
DDB1Q16531 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
DDB1Q16531 AC068790.8-201ENST00000618862 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
DDB1Q16531 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
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