Protein–RNA interactions for Protein: Q15262

PTPRK, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase kappa, humanhuman

Predictions only

Length 1,439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRKQ15262 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PTPRKQ15262 KAT8-201ENST00000219797 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PTPRKQ15262 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PTPRKQ15262 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PTPRKQ15262 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PTPRKQ15262 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PTPRKQ15262 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PTPRKQ15262 CCNA1-204ENST00000630422 1751 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PTPRKQ15262 UBE3B-201ENST00000340074 1448 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PTPRKQ15262 KLK1-201ENST00000301420 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PTPRKQ15262 HIST3H2A-201ENST00000366695 895 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PTPRKQ15262 PFN2-215ENST00000497148 743 ntTSL 4 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PTPRKQ15262 AC084859.1-201ENST00000533002 670 ntTSL 4 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PTPRKQ15262 PAFAH1B3-202ENST00000538771 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PTPRKQ15262 VASH1-AS1-201ENST00000554058 871 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PTPRKQ15262 AC139099.3-201ENST00000572850 472 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PTPRKQ15262 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PTPRKQ15262 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PTPRKQ15262 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PTPRKQ15262 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PTPRKQ15262 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PTPRKQ15262 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PTPRKQ15262 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PTPRKQ15262 PSMD8-209ENST00000602911 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PTPRKQ15262 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PTPRKQ15262 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PTPRKQ15262 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PTPRKQ15262 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PTPRKQ15262 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
PTPRKQ15262 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
PTPRKQ15262 NPPC-201ENST00000295440 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
PTPRKQ15262 EMC3-AS1-202ENST00000366264 559 ntTSL 4 BASIC23.33■■□□□ 1.32
PTPRKQ15262 LARGE-AS1-202ENST00000424291 1065 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
PTPRKQ15262 U82695.1-202ENST00000428676 700 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
PTPRKQ15262 LIMS3-201ENST00000437679 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
PTPRKQ15262 AL591846.1-201ENST00000451736 433 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
PTPRKQ15262 AC004522.2-201ENST00000456499 680 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.32
PTPRKQ15262 AC091804.1-201ENST00000486888 567 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
PTPRKQ15262 TP53AIP1-205ENST00000531399 806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
PTPRKQ15262 AC120498.1-201ENST00000563593 476 ntTSL 4 BASIC23.33■■□□□ 1.32
PTPRKQ15262 LINC00854-216ENST00000636331 718 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
PTPRKQ15262 ZSCAN30-212ENST00000639929 1305 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PTPRKQ15262 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
PTPRKQ15262 GTF2A1L-203ENST00000430487 1575 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PTPRKQ15262 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PTPRKQ15262 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PTPRKQ15262 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
PTPRKQ15262 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PTPRKQ15262 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PTPRKQ15262 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PTPRKQ15262 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PTPRKQ15262 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PTPRKQ15262 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PTPRKQ15262 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PTPRKQ15262 NEU2-201ENST00000233840 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PTPRKQ15262 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PTPRKQ15262 TEX29-201ENST00000283547 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PTPRKQ15262 SH3BGR-201ENST00000333634 1251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PTPRKQ15262 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PTPRKQ15262 PGGT1B-202ENST00000379615 903 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PTPRKQ15262 AL021707.3-201ENST00000418803 527 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PTPRKQ15262 CHL1-AS2-203ENST00000452919 726 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PTPRKQ15262 CENPBD1P1-203ENST00000479047 569 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PTPRKQ15262 ARTN-209ENST00000479128 471 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PTPRKQ15262 ZSCAN32-210ENST00000573830 668 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PTPRKQ15262 AC005262.2-201ENST00000587701 452 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PTPRKQ15262 TUBB6-213ENST00000591909 1017 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PTPRKQ15262 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PTPRKQ15262 FDPS-221ENST00000612683 1198 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PTPRKQ15262 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PTPRKQ15262 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PTPRKQ15262 NSUN5P1-204ENST00000428392 1562 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PTPRKQ15262 GRN-222ENST00000639447 1314 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PTPRKQ15262 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PTPRKQ15262 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PTPRKQ15262 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PTPRKQ15262 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PTPRKQ15262 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PTPRKQ15262 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PTPRKQ15262 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PTPRKQ15262 HARS-202ENST00000415192 1401 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PTPRKQ15262 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PTPRKQ15262 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PTPRKQ15262 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PTPRKQ15262 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PTPRKQ15262 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PTPRKQ15262 ACKR1-201ENST00000368121 1240 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
PTPRKQ15262 TMEM52-203ENST00000378602 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PTPRKQ15262 BX322559.1-201ENST00000456613 319 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PTPRKQ15262 MIR22HG-212ENST00000577164 931 ntTSL 4 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PTPRKQ15262 RPL36-203ENST00000577222 874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PTPRKQ15262 TNNT1-212ENST00000588981 1163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PTPRKQ15262 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PTPRKQ15262 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PTPRKQ15262 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PTPRKQ15262 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PTPRKQ15262 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PTPRKQ15262 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PTPRKQ15262 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PTPRKQ15262 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
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