Protein–RNA interactions for Protein: Q14C86

GAPVD1, GTPase-activating protein and VPS9 domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 1,478 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GAPVD1Q14C86 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
GAPVD1Q14C86 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
GAPVD1Q14C86 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
GAPVD1Q14C86 AC005865.1-202ENST00000543036 641 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
GAPVD1Q14C86 SNHG14-213ENST00000551077 638 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
GAPVD1Q14C86 AC135983.4-201ENST00000564116 1262 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
GAPVD1Q14C86 GLIS2-AS1-201ENST00000576080 340 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
GAPVD1Q14C86 AC005901.1-201ENST00000592766 552 ntTSL 4 BASIC25.21■■□□□ 1.63
GAPVD1Q14C86 AL132994.2-201ENST00000603120 687 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
GAPVD1Q14C86 Metazoa_SRP.65-201ENST00000615602 264 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
GAPVD1Q14C86 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
GAPVD1Q14C86 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
GAPVD1Q14C86 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
GAPVD1Q14C86 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
GAPVD1Q14C86 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
GAPVD1Q14C86 MVK-214ENST00000629016 1591 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
GAPVD1Q14C86 TMEM198B-201ENST00000471276 1958 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
GAPVD1Q14C86 ARV1-201ENST00000310256 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
GAPVD1Q14C86 CXorf40B-202ENST00000370404 1316 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
GAPVD1Q14C86 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
GAPVD1Q14C86 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
GAPVD1Q14C86 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
GAPVD1Q14C86 AC090515.2-201ENST00000500929 1396 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
GAPVD1Q14C86 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
GAPVD1Q14C86 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
GAPVD1Q14C86 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
GAPVD1Q14C86 OR1J1-201ENST00000259357 969 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
GAPVD1Q14C86 ODF4-201ENST00000328248 1156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
GAPVD1Q14C86 RPS16-202ENST00000339471 643 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
GAPVD1Q14C86 LINC01237-201ENST00000415434 573 ntTSL 4 BASIC25.21■■□□□ 1.63
GAPVD1Q14C86 GLYCTK-204ENST00000471180 992 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
GAPVD1Q14C86 AC093627.5-203ENST00000497320 746 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
GAPVD1Q14C86 IGLV3-15-201ENST00000518356 244 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
GAPVD1Q14C86 PGAM1P5-201ENST00000548011 764 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
GAPVD1Q14C86 AC009779.1-201ENST00000551138 283 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
GAPVD1Q14C86 CDIP1-202ENST00000562334 1205 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
GAPVD1Q14C86 RANGRF-205ENST00000580434 749 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
GAPVD1Q14C86 WT1-AS_6.1-201ENST00000614919 121 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
GAPVD1Q14C86 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
GAPVD1Q14C86 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
GAPVD1Q14C86 B4GALT3-201ENST00000319769 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
GAPVD1Q14C86 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
GAPVD1Q14C86 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
GAPVD1Q14C86 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
GAPVD1Q14C86 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
GAPVD1Q14C86 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
GAPVD1Q14C86 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
GAPVD1Q14C86 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
GAPVD1Q14C86 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
GAPVD1Q14C86 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
GAPVD1Q14C86 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
GAPVD1Q14C86 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
GAPVD1Q14C86 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
GAPVD1Q14C86 C9orf24-201ENST00000297623 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
GAPVD1Q14C86 NRM-202ENST00000376420 1228 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
GAPVD1Q14C86 C9orf24-205ENST00000379133 712 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
GAPVD1Q14C86 AL450469.2-201ENST00000427132 499 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
GAPVD1Q14C86 RPL37A-203ENST00000427280 698 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
GAPVD1Q14C86 RPL37A-206ENST00000456586 401 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
GAPVD1Q14C86 RCC2P8-201ENST00000502779 1035 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
GAPVD1Q14C86 FAM153B-214ENST00000512862 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
GAPVD1Q14C86 RPL37A-211ENST00000598925 775 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
GAPVD1Q14C86 NR2F2-AS1-215ENST00000620029 1223 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
GAPVD1Q14C86 AL805961.1-201ENST00000642026 753 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
GAPVD1Q14C86 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
GAPVD1Q14C86 EPHX1-202ENST00000366837 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
GAPVD1Q14C86 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
GAPVD1Q14C86 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
GAPVD1Q14C86 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
GAPVD1Q14C86 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
GAPVD1Q14C86 SUMO1-203ENST00000392246 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
GAPVD1Q14C86 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
GAPVD1Q14C86 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
GAPVD1Q14C86 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
GAPVD1Q14C86 STYXL1-201ENST00000248600 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
GAPVD1Q14C86 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
GAPVD1Q14C86 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
GAPVD1Q14C86 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
GAPVD1Q14C86 PFN2-202ENST00000423691 911 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
GAPVD1Q14C86 AC116609.2-201ENST00000431542 256 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
GAPVD1Q14C86 HNRNPA1P36-201ENST00000521313 955 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
GAPVD1Q14C86 SNORD3B-2-202ENST00000571722 791 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
GAPVD1Q14C86 CCDC121-202ENST00000394775 1472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
GAPVD1Q14C86 WDR83-201ENST00000418543 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
GAPVD1Q14C86 FOSB-213ENST00000615753 1468 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
GAPVD1Q14C86 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
GAPVD1Q14C86 CCNE1-203ENST00000444983 1680 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
GAPVD1Q14C86 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
GAPVD1Q14C86 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
GAPVD1Q14C86 FKBP6-201ENST00000252037 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
GAPVD1Q14C86 PGA5-201ENST00000312403 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
GAPVD1Q14C86 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
GAPVD1Q14C86 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
GAPVD1Q14C86 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
GAPVD1Q14C86 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
GAPVD1Q14C86 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
GAPVD1Q14C86 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
GAPVD1Q14C86 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
GAPVD1Q14C86 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
GAPVD1Q14C86 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
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