Protein–RNA interactions for Protein: Q13615

MTMR3, Myotubularin-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,198 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTMR3Q13615 TRIM67-202ENST00000444294 9320 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
MTMR3Q13615 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
MTMR3Q13615 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
MTMR3Q13615 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
MTMR3Q13615 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
MTMR3Q13615 ARHGAP39-201ENST00000276826 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
MTMR3Q13615 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
MTMR3Q13615 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
MTMR3Q13615 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
MTMR3Q13615 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
MTMR3Q13615 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
MTMR3Q13615 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
MTMR3Q13615 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
MTMR3Q13615 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
MTMR3Q13615 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
MTMR3Q13615 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
MTMR3Q13615 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
MTMR3Q13615 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
MTMR3Q13615 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
MTMR3Q13615 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
MTMR3Q13615 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
MTMR3Q13615 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
MTMR3Q13615 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
MTMR3Q13615 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
MTMR3Q13615 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
MTMR3Q13615 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
MTMR3Q13615 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
MTMR3Q13615 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
MTMR3Q13615 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
MTMR3Q13615 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
MTMR3Q13615 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
MTMR3Q13615 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
MTMR3Q13615 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
MTMR3Q13615 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
MTMR3Q13615 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
MTMR3Q13615 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
MTMR3Q13615 VCX3B-202ENST00000381032 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
MTMR3Q13615 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
MTMR3Q13615 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC17.25■□□□□ 0.35
MTMR3Q13615 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
MTMR3Q13615 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
MTMR3Q13615 FKBP11-203ENST00000453172 959 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
MTMR3Q13615 HHEX-203ENST00000492654 808 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
MTMR3Q13615 AC011495.1-201ENST00000498085 584 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
MTMR3Q13615 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
MTMR3Q13615 POLE2-203ENST00000553805 496 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
MTMR3Q13615 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
MTMR3Q13615 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
MTMR3Q13615 Six3os1_5.1-201ENST00000611000 271 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
MTMR3Q13615 AL031056.2-201ENST00000637957 1217 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
MTMR3Q13615 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
MTMR3Q13615 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
MTMR3Q13615 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
MTMR3Q13615 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
MTMR3Q13615 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
MTMR3Q13615 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
MTMR3Q13615 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
MTMR3Q13615 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
MTMR3Q13615 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
MTMR3Q13615 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
MTMR3Q13615 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
MTMR3Q13615 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
MTMR3Q13615 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
MTMR3Q13615 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
MTMR3Q13615 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
MTMR3Q13615 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
MTMR3Q13615 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
MTMR3Q13615 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
MTMR3Q13615 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
MTMR3Q13615 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
MTMR3Q13615 YBEY-202ENST00000339195 890 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
MTMR3Q13615 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
MTMR3Q13615 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
MTMR3Q13615 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
MTMR3Q13615 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
MTMR3Q13615 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
MTMR3Q13615 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
MTMR3Q13615 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
MTMR3Q13615 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
MTMR3Q13615 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
MTMR3Q13615 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
MTMR3Q13615 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
MTMR3Q13615 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
MTMR3Q13615 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
MTMR3Q13615 AC008969.1-205ENST00000553254 876 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
MTMR3Q13615 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
MTMR3Q13615 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
MTMR3Q13615 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC17.24■□□□□ 0.35
MTMR3Q13615 NAA38-206ENST00000576384 424 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
MTMR3Q13615 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC17.24■□□□□ 0.35
MTMR3Q13615 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
MTMR3Q13615 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
MTMR3Q13615 AL606495.2-201ENST00000605867 535 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
MTMR3Q13615 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
MTMR3Q13615 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC17.24■□□□□ 0.35
MTMR3Q13615 ME2-201ENST00000321341 9415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
MTMR3Q13615 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
MTMR3Q13615 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
MTMR3Q13615 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
MTMR3Q13615 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
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