Protein–RNA interactions for Protein: Q12772

SREBF2, Sterol regulatory element-binding protein 2, humanhuman

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Length 1,141 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SREBF2Q12772 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SREBF2Q12772 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SREBF2Q12772 ARF5-201ENST00000000233 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SREBF2Q12772 PON3-201ENST00000265627 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SREBF2Q12772 NUDT1-201ENST00000339737 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SREBF2Q12772 IL27-201ENST00000356897 1044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SREBF2Q12772 CST9L-201ENST00000376979 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SREBF2Q12772 AC073316.1-202ENST00000402115 988 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SREBF2Q12772 PIK3IP1-202ENST00000402249 999 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SREBF2Q12772 AL136309.1-201ENST00000403917 691 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
SREBF2Q12772 NREP-204ENST00000419114 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SREBF2Q12772 VAMP8-203ENST00000432071 664 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SREBF2Q12772 AC243961.1-201ENST00000432559 384 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SREBF2Q12772 AC245056.1-201ENST00000437631 384 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SREBF2Q12772 TUBB8P8-201ENST00000458717 1058 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
SREBF2Q12772 LINC02046-201ENST00000469812 378 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SREBF2Q12772 AL391280.1-201ENST00000506969 1062 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
SREBF2Q12772 AP001547.1-201ENST00000527440 374 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SREBF2Q12772 AHNAK-205ENST00000530124 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SREBF2Q12772 EIF3K-202ENST00000538434 966 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SREBF2Q12772 LINC01629-201ENST00000553613 581 ntTSL 4 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SREBF2Q12772 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SREBF2Q12772 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SREBF2Q12772 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SREBF2Q12772 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SREBF2Q12772 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
SREBF2Q12772 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SREBF2Q12772 AL157791.1-201ENST00000553667 1699 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
SREBF2Q12772 KRT8P14-201ENST00000414254 1442 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
SREBF2Q12772 CAP2-206ENST00000489374 1430 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SREBF2Q12772 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SREBF2Q12772 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SREBF2Q12772 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SREBF2Q12772 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SREBF2Q12772 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SREBF2Q12772 RHD-206ENST00000423810 1637 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SREBF2Q12772 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SREBF2Q12772 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SREBF2Q12772 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SREBF2Q12772 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SREBF2Q12772 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SREBF2Q12772 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SREBF2Q12772 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SREBF2Q12772 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SREBF2Q12772 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SREBF2Q12772 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SREBF2Q12772 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SREBF2Q12772 KDSR-201ENST00000326575 1024 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SREBF2Q12772 NPPA-201ENST00000376476 728 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SREBF2Q12772 CSH2-203ENST00000392886 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SREBF2Q12772 CD8B-204ENST00000393759 1096 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SREBF2Q12772 AC026316.1-201ENST00000398900 414 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
SREBF2Q12772 Z82214.1-201ENST00000419643 988 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SREBF2Q12772 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SREBF2Q12772 LILRA5-204ENST00000486742 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SREBF2Q12772 MARK2P5-201ENST00000507649 634 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
SREBF2Q12772 CSH2-206ENST00000560142 749 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SREBF2Q12772 SAXO2-207ENST00000566861 404 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SREBF2Q12772 AC020922.3-201ENST00000595064 547 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
SREBF2Q12772 AL136295.7-201ENST00000619226 1200 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
SREBF2Q12772 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SREBF2Q12772 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SREBF2Q12772 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SREBF2Q12772 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SREBF2Q12772 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SREBF2Q12772 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SREBF2Q12772 BRMS1-202ENST00000425825 1363 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SREBF2Q12772 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SREBF2Q12772 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SREBF2Q12772 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SREBF2Q12772 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SREBF2Q12772 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SREBF2Q12772 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
SREBF2Q12772 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SREBF2Q12772 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SREBF2Q12772 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SREBF2Q12772 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SREBF2Q12772 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SREBF2Q12772 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SREBF2Q12772 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SREBF2Q12772 TUBA8-202ENST00000330423 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SREBF2Q12772 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SREBF2Q12772 MPV17-201ENST00000233545 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SREBF2Q12772 RAB36-202ENST00000341989 936 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SREBF2Q12772 APRT-201ENST00000378364 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SREBF2Q12772 FGFR3P1-201ENST00000449999 601 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
SREBF2Q12772 RNMTL1P1-201ENST00000454103 560 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
SREBF2Q12772 RN7SL8P-201ENST00000461771 266 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
SREBF2Q12772 RN7SL181P-201ENST00000462921 277 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
SREBF2Q12772 DERL3-208ENST00000476077 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SREBF2Q12772 CSTF3-206ENST00000524827 693 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SREBF2Q12772 AP000438.1-201ENST00000543624 749 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SREBF2Q12772 MAX-211ENST00000555667 574 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SREBF2Q12772 NPM1P43-201ENST00000558669 786 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
SREBF2Q12772 NAT9-212ENST00000581136 1011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SREBF2Q12772 INO80C-210ENST00000590757 595 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SREBF2Q12772 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
SREBF2Q12772 NDUFB5-216ENST00000611971 951 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SREBF2Q12772 AC103691.2-201ENST00000618824 433 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
SREBF2Q12772 AC068790.8-201ENST00000618862 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
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