Protein–RNA interactions for Protein: P60709

ACTB, Actin, cytoplasmic 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTBP60709 UHRF1BP1L-201ENST00000279907 5168 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
ACTBP60709 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
ACTBP60709 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
ACTBP60709 ZNF618-201ENST00000288466 9109 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
ACTBP60709 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
ACTBP60709 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
ACTBP60709 PHLDB2-203ENST00000412622 5996 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
ACTBP60709 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
ACTBP60709 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
ACTBP60709 MBNL1-205ENST00000355460 5941 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
ACTBP60709 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
ACTBP60709 ATP5F1-202ENST00000369722 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
ACTBP60709 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
ACTBP60709 ZEB2-225ENST00000558170 4012 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
ACTBP60709 CA10-201ENST00000285273 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
ACTBP60709 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
ACTBP60709 PHF24-201ENST00000242315 5718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
ACTBP60709 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
ACTBP60709 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
ACTBP60709 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
ACTBP60709 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
ACTBP60709 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
ACTBP60709 AC087386.2-201ENST00000623212 4637 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
ACTBP60709 KIF17-201ENST00000247986 3969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
ACTBP60709 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
ACTBP60709 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
ACTBP60709 PCDHGB1-202ENST00000611598 2592 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
ACTBP60709 KHNYN-201ENST00000251343 6725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
ACTBP60709 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
ACTBP60709 UBR2-201ENST00000372899 7857 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
ACTBP60709 UBR2-202ENST00000372901 7857 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
ACTBP60709 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
ACTBP60709 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
ACTBP60709 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
ACTBP60709 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
ACTBP60709 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
ACTBP60709 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
ACTBP60709 R3HDM2P2-201ENST00000401880 2116 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
ACTBP60709 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
ACTBP60709 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
ACTBP60709 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
ACTBP60709 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
ACTBP60709 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
ACTBP60709 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
ACTBP60709 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
ACTBP60709 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
ACTBP60709 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
ACTBP60709 WDR20-202ENST00000322340 3060 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
ACTBP60709 RAF1-205ENST00000442415 3085 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
ACTBP60709 RBM46-204ENST00000514866 2315 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
ACTBP60709 SELENON-203ENST00000374315 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
ACTBP60709 CDKN2AIP-201ENST00000302350 2646 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
ACTBP60709 SOGA3-201ENST00000465909 3756 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
ACTBP60709 EIF4G1-218ENST00000434061 5026 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
ACTBP60709 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
ACTBP60709 GABRG3-208ENST00000615808 10768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
ACTBP60709 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
ACTBP60709 ACSL3-202ENST00000392066 3147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
ACTBP60709 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
ACTBP60709 DNM1-203ENST00000393594 3245 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
ACTBP60709 PRMT9-201ENST00000322396 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
ACTBP60709 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
ACTBP60709 LRP8-201ENST00000306052 7648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
ACTBP60709 NCKAP5L-201ENST00000335999 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
ACTBP60709 AC007686.3-201ENST00000619017 3487 ntBASIC13.65□□□□□ -0.23
ACTBP60709 FGD5-AS1-202ENST00000424349 3792 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
ACTBP60709 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
ACTBP60709 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
ACTBP60709 SOCS5-202ENST00000394861 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
ACTBP60709 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
ACTBP60709 TMEM189-202ENST00000371652 7714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
ACTBP60709 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
ACTBP60709 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
ACTBP60709 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
ACTBP60709 DMTN-205ENST00000432128 2508 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
ACTBP60709 SLC4A9-203ENST00000506545 2838 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
ACTBP60709 SAFB-205ENST00000588852 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
ACTBP60709 B4GALNT1-201ENST00000341156 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
ACTBP60709 ST6GAL2-204ENST00000409382 7275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
ACTBP60709 ZSWIM8-221ENST00000604729 6075 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
ACTBP60709 THSD4-202ENST00000355327 9200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
ACTBP60709 FAM149A-202ENST00000356371 2997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
ACTBP60709 ADORA1-201ENST00000309502 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
ACTBP60709 TGFB1-201ENST00000221930 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
ACTBP60709 ITGBL1-207ENST00000622834 2369 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
ACTBP60709 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
ACTBP60709 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
ACTBP60709 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
ACTBP60709 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
ACTBP60709 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
ACTBP60709 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
ACTBP60709 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
ACTBP60709 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
ACTBP60709 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
ACTBP60709 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
ACTBP60709 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
ACTBP60709 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC13.64□□□□□ -0.23
ACTBP60709 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
ACTBP60709 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
ACTBP60709 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
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