Protein–RNA interactions for Protein: P51965

UBE2E1, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 E1, humanhuman

Predictions only

Length 193 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2E1P51965 NEU3-203ENST00000529024 581 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
UBE2E1P51965 TAPBPL-205ENST00000544021 772 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
UBE2E1P51965 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC12.74□□□□□ -0.37
UBE2E1P51965 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
UBE2E1P51965 AC138474.1-201ENST00000586630 523 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
UBE2E1P51965 AL157392.3-207ENST00000601758 744 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
UBE2E1P51965 MIR8072-201ENST00000614241 80 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
UBE2E1P51965 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
UBE2E1P51965 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
UBE2E1P51965 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
UBE2E1P51965 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
UBE2E1P51965 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
UBE2E1P51965 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
UBE2E1P51965 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
UBE2E1P51965 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
UBE2E1P51965 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
UBE2E1P51965 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
UBE2E1P51965 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
UBE2E1P51965 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
UBE2E1P51965 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
UBE2E1P51965 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
UBE2E1P51965 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
UBE2E1P51965 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
UBE2E1P51965 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
UBE2E1P51965 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
UBE2E1P51965 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
UBE2E1P51965 SPAAR-202ENST00000443779 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
UBE2E1P51965 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
UBE2E1P51965 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
UBE2E1P51965 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
UBE2E1P51965 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
UBE2E1P51965 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
UBE2E1P51965 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
UBE2E1P51965 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
UBE2E1P51965 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
UBE2E1P51965 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
UBE2E1P51965 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
UBE2E1P51965 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
UBE2E1P51965 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
UBE2E1P51965 KLRG1-201ENST00000266551 1335 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
UBE2E1P51965 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
UBE2E1P51965 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
UBE2E1P51965 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
UBE2E1P51965 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
UBE2E1P51965 TOMM5-201ENST00000321301 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
UBE2E1P51965 KIAA0907-201ENST00000368319 1155 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
UBE2E1P51965 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
UBE2E1P51965 C10orf35-201ENST00000373279 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
UBE2E1P51965 COX5BP8-201ENST00000416911 349 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
UBE2E1P51965 AC098850.1-201ENST00000419919 790 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
UBE2E1P51965 UFL1-AS1-201ENST00000430796 548 ntTSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
UBE2E1P51965 AC016683.1-202ENST00000438409 583 ntTSL 4 BASIC12.73□□□□□ -0.37
UBE2E1P51965 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
UBE2E1P51965 AL606760.2-202ENST00000452466 524 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
UBE2E1P51965 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
UBE2E1P51965 AC105339.1-202ENST00000559535 1283 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
UBE2E1P51965 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
UBE2E1P51965 AC124287.1-201ENST00000582249 838 ntTSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
UBE2E1P51965 CTBP2P3-201ENST00000585629 1255 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
UBE2E1P51965 TUBB6-203ENST00000586653 788 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
UBE2E1P51965 BRI3BPP1-201ENST00000594224 787 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
UBE2E1P51965 KXD1-204ENST00000595073 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
UBE2E1P51965 AC011466.1-201ENST00000595201 566 ntTSL 4 BASIC12.73□□□□□ -0.37
UBE2E1P51965 ZNF83-215ENST00000600714 810 ntTSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
UBE2E1P51965 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
UBE2E1P51965 SRP9-204ENST00000619790 377 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
UBE2E1P51965 AL035252.4-201ENST00000624174 288 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
UBE2E1P51965 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
UBE2E1P51965 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
UBE2E1P51965 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
UBE2E1P51965 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
UBE2E1P51965 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
UBE2E1P51965 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
UBE2E1P51965 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
UBE2E1P51965 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
UBE2E1P51965 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
UBE2E1P51965 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
UBE2E1P51965 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
UBE2E1P51965 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
UBE2E1P51965 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
UBE2E1P51965 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
UBE2E1P51965 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
UBE2E1P51965 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
UBE2E1P51965 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
UBE2E1P51965 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
UBE2E1P51965 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
UBE2E1P51965 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
UBE2E1P51965 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
UBE2E1P51965 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
UBE2E1P51965 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
UBE2E1P51965 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
UBE2E1P51965 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
UBE2E1P51965 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
UBE2E1P51965 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
UBE2E1P51965 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
UBE2E1P51965 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
UBE2E1P51965 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
UBE2E1P51965 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
UBE2E1P51965 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
UBE2E1P51965 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.3 ms