Protein–RNA interactions for Protein: P48668

KRT6C, Keratin, type II cytoskeletal 6C, humanhuman

Predictions only

Length 564 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT6CP48668 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KRT6CP48668 AK4-202ENST00000395334 6998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KRT6CP48668 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KRT6CP48668 SYAP1-201ENST00000380155 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KRT6CP48668 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KRT6CP48668 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
KRT6CP48668 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KRT6CP48668 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KRT6CP48668 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KRT6CP48668 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KRT6CP48668 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KRT6CP48668 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KRT6CP48668 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KRT6CP48668 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KRT6CP48668 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KRT6CP48668 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KRT6CP48668 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KRT6CP48668 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KRT6CP48668 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KRT6CP48668 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
KRT6CP48668 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
KRT6CP48668 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KRT6CP48668 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KRT6CP48668 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KRT6CP48668 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
KRT6CP48668 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KRT6CP48668 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KRT6CP48668 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KRT6CP48668 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
KRT6CP48668 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KRT6CP48668 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KRT6CP48668 NANOS1-202ENST00000425699 4017 ntAPPRIS P2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KRT6CP48668 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KRT6CP48668 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KRT6CP48668 PAK2-201ENST00000327134 6139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KRT6CP48668 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KRT6CP48668 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KRT6CP48668 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KRT6CP48668 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KRT6CP48668 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KRT6CP48668 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KRT6CP48668 B4GALNT3-201ENST00000266383 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KRT6CP48668 HAND2-AS1-202ENST00000502896 5278 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KRT6CP48668 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KRT6CP48668 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KRT6CP48668 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KRT6CP48668 ELOA-204ENST00000613537 4924 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KRT6CP48668 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KRT6CP48668 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KRT6CP48668 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KRT6CP48668 MYO3A-201ENST00000265944 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KRT6CP48668 ARHGEF28-202ENST00000296799 4424 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KRT6CP48668 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KRT6CP48668 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KRT6CP48668 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KRT6CP48668 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KRT6CP48668 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KRT6CP48668 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KRT6CP48668 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KRT6CP48668 REEP3-201ENST00000373758 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KRT6CP48668 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KRT6CP48668 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KRT6CP48668 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KRT6CP48668 RIMS1-216ENST00000521978 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KRT6CP48668 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KRT6CP48668 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KRT6CP48668 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KRT6CP48668 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
KRT6CP48668 EIF4G1-212ENST00000424196 5653 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KRT6CP48668 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KRT6CP48668 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KRT6CP48668 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KRT6CP48668 HS6ST3-201ENST00000376705 7804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KRT6CP48668 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KRT6CP48668 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KRT6CP48668 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KRT6CP48668 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KRT6CP48668 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KRT6CP48668 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KRT6CP48668 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KRT6CP48668 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KRT6CP48668 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KRT6CP48668 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KRT6CP48668 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KRT6CP48668 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KRT6CP48668 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KRT6CP48668 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KRT6CP48668 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KRT6CP48668 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KRT6CP48668 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KRT6CP48668 IL12RB2-206ENST00000544434 3782 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KRT6CP48668 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KRT6CP48668 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KRT6CP48668 THSD4-202ENST00000355327 9200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KRT6CP48668 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KRT6CP48668 NFATC4-206ENST00000539237 5686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KRT6CP48668 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KRT6CP48668 LIMK2-203ENST00000340552 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KRT6CP48668 FAM45BP-202ENST00000592932 1624 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
KRT6CP48668 TMEM139-201ENST00000359333 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.3 ms