Protein–RNA interactions for Protein: P42166

TMPO, Lamina-associated polypeptide 2, isoform alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 694 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMPOP42166 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TMPOP42166 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TMPOP42166 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TMPOP42166 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TMPOP42166 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TMPOP42166 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TMPOP42166 LCE3A-201ENST00000335674 270 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TMPOP42166 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TMPOP42166 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TMPOP42166 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TMPOP42166 NSL1-201ENST00000366976 722 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TMPOP42166 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TMPOP42166 COX5BP8-201ENST00000416911 349 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
TMPOP42166 UFL1-AS1-201ENST00000430796 548 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TMPOP42166 ZNF707-203ENST00000442058 562 ntTSL 4 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TMPOP42166 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TMPOP42166 GNG4-205ENST00000484517 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TMPOP42166 ZSCAN2-213ENST00000541040 965 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TMPOP42166 AC005225.4-201ENST00000557330 545 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
TMPOP42166 AL359711.2-201ENST00000563105 872 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
TMPOP42166 AC004477.1-202ENST00000584428 539 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TMPOP42166 AL157392.3-207ENST00000601758 744 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TMPOP42166 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
TMPOP42166 CECR7-204ENST00000609932 568 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TMPOP42166 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TMPOP42166 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TMPOP42166 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TMPOP42166 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TMPOP42166 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TMPOP42166 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TMPOP42166 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TMPOP42166 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TMPOP42166 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
TMPOP42166 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TMPOP42166 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TMPOP42166 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TMPOP42166 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TMPOP42166 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TMPOP42166 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TMPOP42166 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TMPOP42166 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TMPOP42166 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TMPOP42166 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TMPOP42166 GRAP-202ENST00000395635 834 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TMPOP42166 BLCAP-202ENST00000397131 633 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TMPOP42166 BLCAP-203ENST00000397134 566 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TMPOP42166 KRTAP10-1-201ENST00000400375 1215 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TMPOP42166 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TMPOP42166 NME2P1-201ENST00000426182 414 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
TMPOP42166 AJ271736.1-201ENST00000483543 773 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TMPOP42166 SERF1A-205ENST00000507348 663 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TMPOP42166 AP001360.1-202ENST00000526934 479 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TMPOP42166 AC099482.1-201ENST00000563471 481 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TMPOP42166 AC124283.3-201ENST00000570869 594 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
TMPOP42166 TRAPPC6A-204ENST00000588062 695 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TMPOP42166 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TMPOP42166 BCRP3-202ENST00000621462 1021 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TMPOP42166 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TMPOP42166 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TMPOP42166 AC020915.1-201ENST00000413518 1469 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TMPOP42166 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TMPOP42166 CYB5R2-204ENST00000524790 1338 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TMPOP42166 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TMPOP42166 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TMPOP42166 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TMPOP42166 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TMPOP42166 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TMPOP42166 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TMPOP42166 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TMPOP42166 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TMPOP42166 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TMPOP42166 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TMPOP42166 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TMPOP42166 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TMPOP42166 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
TMPOP42166 C12orf10-201ENST00000267103 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TMPOP42166 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TMPOP42166 AC098614.1-201ENST00000368528 745 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
TMPOP42166 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TMPOP42166 ARL6IP4-207ENST00000426960 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TMPOP42166 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TMPOP42166 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TMPOP42166 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TMPOP42166 AC026410.3-201ENST00000514280 936 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
TMPOP42166 CLNS1A-210ENST00000528364 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TMPOP42166 HAUS2-207ENST00000568846 709 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TMPOP42166 PAM16-204ENST00000571941 674 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TMPOP42166 FAM66A-202ENST00000602658 546 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TMPOP42166 HIST1H2AB-201ENST00000615868 393 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TMPOP42166 RPSAP52-203ENST00000622976 1023 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
TMPOP42166 PDLIM3-213ENST00000629667 1016 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TMPOP42166 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TMPOP42166 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TMPOP42166 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TMPOP42166 KLRG1-201ENST00000266551 1335 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TMPOP42166 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TMPOP42166 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TMPOP42166 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TMPOP42166 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TMPOP42166 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51 ms