Protein–RNA interactions for Protein: P35606

COPB2, Coatomer subunit beta', humanhuman

Predictions only

Length 906 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPB2P35606 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
COPB2P35606 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
COPB2P35606 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
COPB2P35606 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
COPB2P35606 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
COPB2P35606 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
COPB2P35606 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
COPB2P35606 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
COPB2P35606 LBHD1-201ENST00000354588 1320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
COPB2P35606 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
COPB2P35606 REXO1L6P-201ENST00000603433 1515 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
COPB2P35606 MIER1-209ENST00000401042 1648 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
COPB2P35606 OGDH-204ENST00000443864 1744 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
COPB2P35606 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
COPB2P35606 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
COPB2P35606 TSPAN32-204ENST00000381121 999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
COPB2P35606 MDP1-202ENST00000396833 582 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
COPB2P35606 MORN2-204ENST00000409665 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
COPB2P35606 AC243836.1-201ENST00000416696 438 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
COPB2P35606 AC007405.2-202ENST00000418106 540 ntTSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
COPB2P35606 RCN1-210ENST00000532942 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
COPB2P35606 AL583810.1-201ENST00000553344 1045 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
COPB2P35606 AL118558.1-202ENST00000557242 451 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
COPB2P35606 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
COPB2P35606 ANAPC11-216ENST00000579133 563 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
COPB2P35606 TECR-207ENST00000596073 1170 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
COPB2P35606 TECR-220ENST00000600083 1204 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
COPB2P35606 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
COPB2P35606 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
COPB2P35606 AGER-206ENST00000375070 1463 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
COPB2P35606 AGER-208ENST00000438221 1493 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
COPB2P35606 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
COPB2P35606 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
COPB2P35606 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
COPB2P35606 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
COPB2P35606 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
COPB2P35606 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
COPB2P35606 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
COPB2P35606 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
COPB2P35606 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
COPB2P35606 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
COPB2P35606 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
COPB2P35606 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
COPB2P35606 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
COPB2P35606 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
COPB2P35606 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
COPB2P35606 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
COPB2P35606 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
COPB2P35606 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
COPB2P35606 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
COPB2P35606 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
COPB2P35606 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
COPB2P35606 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
COPB2P35606 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
COPB2P35606 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
COPB2P35606 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
COPB2P35606 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
COPB2P35606 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
COPB2P35606 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
COPB2P35606 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
COPB2P35606 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
COPB2P35606 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
COPB2P35606 FDFT1-202ENST00000443614 1393 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
COPB2P35606 ZBTB12BP-201ENST00000314232 1122 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
COPB2P35606 UBE2T-201ENST00000367274 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
COPB2P35606 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
COPB2P35606 AC099336.1-201ENST00000417053 1171 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
COPB2P35606 AC016694.1-201ENST00000434179 700 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
COPB2P35606 ACTBP11-201ENST00000436287 1126 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
COPB2P35606 AL355994.2-201ENST00000447882 704 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
COPB2P35606 CSF2RBP1-201ENST00000447905 391 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
COPB2P35606 AC093433.1-201ENST00000458048 571 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
COPB2P35606 DMKN-216ENST00000458071 510 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
COPB2P35606 AC115284.1-201ENST00000488257 547 ntTSL 4 BASIC17.97■□□□□ 0.47
COPB2P35606 AC022137.2-201ENST00000503482 481 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
COPB2P35606 CEP57L1-208ENST00000519095 908 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
COPB2P35606 AP001453.3-201ENST00000545800 853 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
COPB2P35606 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
COPB2P35606 MIR4525-201ENST00000580000 75 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
COPB2P35606 ATF5-205ENST00000600336 682 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
COPB2P35606 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
COPB2P35606 ZNF711-201ENST00000276123 2887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
COPB2P35606 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
COPB2P35606 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
COPB2P35606 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
COPB2P35606 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
COPB2P35606 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
COPB2P35606 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
COPB2P35606 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
COPB2P35606 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
COPB2P35606 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
COPB2P35606 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
COPB2P35606 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
COPB2P35606 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
COPB2P35606 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
COPB2P35606 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
COPB2P35606 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
COPB2P35606 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
COPB2P35606 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
COPB2P35606 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms