Protein–RNA interactions for Protein: P28562

DUSP1, Dual specificity protein phosphatase 1, humanhuman

Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP1P28562 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
DUSP1P28562 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
DUSP1P28562 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
DUSP1P28562 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
DUSP1P28562 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC13.56□□□□□ -0.24
DUSP1P28562 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
DUSP1P28562 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
DUSP1P28562 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
DUSP1P28562 PPP3CB-201ENST00000342558 2418 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
DUSP1P28562 STAMBPL1-204ENST00000371927 4184 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
DUSP1P28562 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
DUSP1P28562 CRB2-201ENST00000359999 3659 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
DUSP1P28562 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
DUSP1P28562 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
DUSP1P28562 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
DUSP1P28562 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
DUSP1P28562 TP53INP2-201ENST00000374809 4018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
DUSP1P28562 C3-201ENST00000245907 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
DUSP1P28562 ANKMY1-207ENST00000403283 2874 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
DUSP1P28562 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
DUSP1P28562 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
DUSP1P28562 ZFR2-201ENST00000262961 4756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
DUSP1P28562 ABCG4-205ENST00000619701 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
DUSP1P28562 KIF1C-201ENST00000320785 7919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
DUSP1P28562 CUL3-201ENST00000264414 6741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
DUSP1P28562 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
DUSP1P28562 SLC41A1-201ENST00000367137 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
DUSP1P28562 ZNF70-201ENST00000341976 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
DUSP1P28562 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
DUSP1P28562 CDC25B-203ENST00000344256 3071 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
DUSP1P28562 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
DUSP1P28562 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
DUSP1P28562 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
DUSP1P28562 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
DUSP1P28562 STK17B-201ENST00000263955 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
DUSP1P28562 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
DUSP1P28562 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
DUSP1P28562 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
DUSP1P28562 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
DUSP1P28562 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
DUSP1P28562 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
DUSP1P28562 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
DUSP1P28562 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
DUSP1P28562 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
DUSP1P28562 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
DUSP1P28562 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
DUSP1P28562 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
DUSP1P28562 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
DUSP1P28562 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
DUSP1P28562 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
DUSP1P28562 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
DUSP1P28562 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
DUSP1P28562 MFRP-205ENST00000619721 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
DUSP1P28562 CFLAR-204ENST00000341582 2056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
DUSP1P28562 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
DUSP1P28562 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
DUSP1P28562 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
DUSP1P28562 NF2-205ENST00000361452 5884 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
DUSP1P28562 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
DUSP1P28562 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
DUSP1P28562 CYP1B1-205ENST00000610745 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
DUSP1P28562 TAP2-201ENST00000374897 5684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
DUSP1P28562 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
DUSP1P28562 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
DUSP1P28562 TOB2-201ENST00000327492 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
DUSP1P28562 FGD5-206ENST00000543601 5768 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
DUSP1P28562 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
DUSP1P28562 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
DUSP1P28562 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
DUSP1P28562 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
DUSP1P28562 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
DUSP1P28562 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
DUSP1P28562 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
DUSP1P28562 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
DUSP1P28562 ZNF563-201ENST00000293725 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
DUSP1P28562 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
DUSP1P28562 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
DUSP1P28562 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
DUSP1P28562 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
DUSP1P28562 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
DUSP1P28562 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
DUSP1P28562 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
DUSP1P28562 DLGAP1-214ENST00000539435 2402 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
DUSP1P28562 EOMES-201ENST00000295743 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
DUSP1P28562 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
DUSP1P28562 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
DUSP1P28562 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
DUSP1P28562 SLC17A5-201ENST00000355773 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
DUSP1P28562 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
DUSP1P28562 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
DUSP1P28562 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
DUSP1P28562 CLASP2-203ENST00000359576 7141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
DUSP1P28562 ZNF800-201ENST00000265827 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
DUSP1P28562 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
DUSP1P28562 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC13.54□□□□□ -0.24
DUSP1P28562 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
DUSP1P28562 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
DUSP1P28562 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC13.54□□□□□ -0.24
DUSP1P28562 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
DUSP1P28562 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms