Protein–RNA interactions for Protein: P23468

PTPRD, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase delta, humanhuman

Predictions only

Length 1,912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRDP23468 RPS24-214ENST00000613865 538 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PTPRDP23468 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PTPRDP23468 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PTPRDP23468 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PTPRDP23468 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PTPRDP23468 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PTPRDP23468 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PTPRDP23468 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PTPRDP23468 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PTPRDP23468 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PTPRDP23468 PFDN5-202ENST00000334478 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PTPRDP23468 GBGT1-202ENST00000372038 847 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PTPRDP23468 IFI27L1-201ENST00000393115 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PTPRDP23468 DRGX-202ENST00000434016 955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PTPRDP23468 AC128709.2-201ENST00000438408 558 ntTSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PTPRDP23468 AC139149.1-202ENST00000442532 783 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PTPRDP23468 ANAPC15-214ENST00000543587 883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PTPRDP23468 HTT-AS1_1.1-201ENST00000612914 230 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
PTPRDP23468 AC145423.3-201ENST00000615987 467 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
PTPRDP23468 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PTPRDP23468 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PTPRDP23468 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PTPRDP23468 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PTPRDP23468 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PTPRDP23468 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PTPRDP23468 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PTPRDP23468 AL138709.1-201ENST00000614840 1693 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
PTPRDP23468 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PTPRDP23468 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
PTPRDP23468 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PTPRDP23468 PEMT-203ENST00000395782 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PTPRDP23468 Z94721.1-201ENST00000444102 385 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PTPRDP23468 BNIP3P42-201ENST00000454982 569 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
PTPRDP23468 AC004522.2-201ENST00000456499 680 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PTPRDP23468 STAG3L5P-205ENST00000473757 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PTPRDP23468 AC116456.1-201ENST00000526646 815 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PTPRDP23468 BNIP3P29-201ENST00000598302 571 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
PTPRDP23468 AC011447.5-201ENST00000616168 564 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
PTPRDP23468 BX539320.1-201ENST00000623759 877 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
PTPRDP23468 TCEA2-203ENST00000361317 1427 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PTPRDP23468 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PTPRDP23468 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PTPRDP23468 CCDC51-204ENST00000442740 1554 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PTPRDP23468 POLD3-208ENST00000532497 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PTPRDP23468 PXYLP1-201ENST00000286353 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PTPRDP23468 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PTPRDP23468 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PTPRDP23468 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PTPRDP23468 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PTPRDP23468 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PTPRDP23468 COMT-205ENST00000406520 1339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PTPRDP23468 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
PTPRDP23468 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
PTPRDP23468 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PTPRDP23468 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PTPRDP23468 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PTPRDP23468 RWDD4-205ENST00000510968 1551 ntTSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PTPRDP23468 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PTPRDP23468 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PTPRDP23468 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PTPRDP23468 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PTPRDP23468 SPAG11A-201ENST00000326558 612 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PTPRDP23468 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PTPRDP23468 AL031283.3-201ENST00000439788 727 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PTPRDP23468 AL121845.2-201ENST00000467211 252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PTPRDP23468 AC106820.3-201ENST00000561653 397 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
PTPRDP23468 AC009133.1-202ENST00000563806 494 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PTPRDP23468 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PTPRDP23468 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PTPRDP23468 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PTPRDP23468 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
PTPRDP23468 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PTPRDP23468 MAX-205ENST00000358664 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PTPRDP23468 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PTPRDP23468 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PTPRDP23468 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PTPRDP23468 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PTPRDP23468 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PTPRDP23468 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PTPRDP23468 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PTPRDP23468 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PTPRDP23468 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PTPRDP23468 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PTPRDP23468 HEBP1-201ENST00000014930 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PTPRDP23468 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PTPRDP23468 NCR1-201ENST00000291890 1155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PTPRDP23468 NCR1-202ENST00000338835 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PTPRDP23468 NCR1-203ENST00000350790 739 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PTPRDP23468 BOLA2P3-201ENST00000404566 256 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
PTPRDP23468 VASH1-AS1-201ENST00000554058 871 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PTPRDP23468 FP565260.6-205ENST00000624120 898 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PTPRDP23468 PPP2R1B-203ENST00000393055 1525 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PTPRDP23468 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PTPRDP23468 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PTPRDP23468 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PTPRDP23468 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PTPRDP23468 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
PTPRDP23468 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PTPRDP23468 ZDHHC4-203ENST00000396707 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PTPRDP23468 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
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