Protein–RNA interactions for Protein: P20396

TRH, Pro-thyrotropin-releasing hormone, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRHP20396 AL513323.1-201ENST00000431862 1063 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TRHP20396 ZSCAN2-208ENST00000485222 910 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TRHP20396 ORAOV1P1-201ENST00000503108 395 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
TRHP20396 ZSCAN2-210ENST00000538076 1109 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TRHP20396 AC007326.1-201ENST00000604539 458 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
TRHP20396 AL358472.3-201ENST00000608147 415 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
TRHP20396 SLC12A5-216ENST00000626701 617 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TRHP20396 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TRHP20396 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TRHP20396 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TRHP20396 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TRHP20396 MBLAC2-202ENST00000514906 1936 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
TRHP20396 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
TRHP20396 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
TRHP20396 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
TRHP20396 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
TRHP20396 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
TRHP20396 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TRHP20396 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TRHP20396 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TRHP20396 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TRHP20396 E2F3P2-201ENST00000447755 1422 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
TRHP20396 GAL-201ENST00000265643 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TRHP20396 FGF14-202ENST00000376143 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TRHP20396 AL357833.1-201ENST00000413993 832 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TRHP20396 LIMS1-206ENST00000414829 439 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TRHP20396 AC093673.1-201ENST00000429630 648 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TRHP20396 AC092580.1-201ENST00000433998 658 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
TRHP20396 EIF3FP3-201ENST00000434851 1086 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
TRHP20396 LIMS3-205ENST00000487150 782 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TRHP20396 AC097381.2-201ENST00000510640 859 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TRHP20396 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TRHP20396 AP000357.2-201ENST00000633827 597 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TRHP20396 CSAG3-203ENST00000638835 793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TRHP20396 CSAG2-204ENST00000640702 793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TRHP20396 RPA3-201ENST00000223129 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TRHP20396 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TRHP20396 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TRHP20396 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
TRHP20396 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TRHP20396 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TRHP20396 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TRHP20396 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TRHP20396 KRT18P9-201ENST00000604826 1300 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
TRHP20396 GSTP1-201ENST00000398603 700 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TRHP20396 AF274858.1-201ENST00000406288 372 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
TRHP20396 SLC13A3-205ENST00000417157 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TRHP20396 RHBDD2-203ENST00000428119 1274 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TRHP20396 AL158166.1-201ENST00000433110 371 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TRHP20396 KCNK16-204ENST00000437525 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TRHP20396 RPS23-204ENST00000507980 836 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TRHP20396 AC106047.2-201ENST00000511723 743 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
TRHP20396 AC006518.1-201ENST00000541449 943 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
TRHP20396 AC079325.2-202ENST00000641031 462 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TRHP20396 AC079325.2-201ENST00000641710 606 ntAPPRIS P5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TRHP20396 AC015909.3-201ENST00000572855 1794 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
TRHP20396 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TRHP20396 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TRHP20396 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
TRHP20396 JPT1-202ENST00000356033 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TRHP20396 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TRHP20396 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TRHP20396 C16orf45-209ENST00000566490 1854 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TRHP20396 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TRHP20396 UBL7-201ENST00000361351 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TRHP20396 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TRHP20396 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TRHP20396 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TRHP20396 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TRHP20396 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TRHP20396 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TRHP20396 NCR3-202ENST00000376071 541 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TRHP20396 AL451105.2-201ENST00000413763 1234 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TRHP20396 FAM58BP-201ENST00000439056 645 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
TRHP20396 SOX2-OT-208ENST00000477928 902 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TRHP20396 TPD52L1-208ENST00000528193 789 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TRHP20396 BLOC1S5-205ENST00000543936 368 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TRHP20396 AL590235.1-201ENST00000564650 861 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
TRHP20396 SNRPD2-206ENST00000588301 702 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TRHP20396 AC020922.4-201ENST00000621389 339 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
TRHP20396 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TRHP20396 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TRHP20396 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TRHP20396 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TRHP20396 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TRHP20396 MEF2C-AS1-210ENST00000514011 1754 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TRHP20396 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TRHP20396 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TRHP20396 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TRHP20396 FBXL12-201ENST00000247977 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TRHP20396 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TRHP20396 DUTP3-201ENST00000450025 415 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
TRHP20396 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
TRHP20396 DPY19L2P5-201ENST00000456300 331 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
TRHP20396 AC135178.1-201ENST00000458568 537 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TRHP20396 KLHDC8A-203ENST00000460687 1022 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TRHP20396 POLD4-206ENST00000530584 899 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TRHP20396 AAMDC-210ENST00000532481 690 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TRHP20396 DUX4L46-201ENST00000566845 751 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
TRHP20396 NAMA-206ENST00000605377 509 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms