Protein–RNA interactions for Protein: P16422

EPCAM, Epithelial cell adhesion molecule, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPCAMP16422 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
EPCAMP16422 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
EPCAMP16422 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
EPCAMP16422 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
EPCAMP16422 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
EPCAMP16422 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
EPCAMP16422 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
EPCAMP16422 FOS-202ENST00000535987 1402 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
EPCAMP16422 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
EPCAMP16422 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
EPCAMP16422 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
EPCAMP16422 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
EPCAMP16422 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
EPCAMP16422 NEU2-201ENST00000233840 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
EPCAMP16422 GABARAPL2-201ENST00000037243 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
EPCAMP16422 TCEAL1-203ENST00000372626 721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
EPCAMP16422 BLCAP-204ENST00000397135 685 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
EPCAMP16422 AC127070.2-201ENST00000424075 555 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
EPCAMP16422 MTX1P1-201ENST00000440904 838 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
EPCAMP16422 AL160290.2-201ENST00000448347 831 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
EPCAMP16422 ARTN-209ENST00000479128 471 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
EPCAMP16422 AC093904.2-201ENST00000495580 418 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
EPCAMP16422 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
EPCAMP16422 ACTG1P17-201ENST00000558391 1119 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
EPCAMP16422 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
EPCAMP16422 YIF1B-215ENST00000592246 936 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
EPCAMP16422 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
EPCAMP16422 THAP4-206ENST00000612200 969 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
EPCAMP16422 IKZF1-217ENST00000612658 962 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
EPCAMP16422 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
EPCAMP16422 ETV2-208ENST00000621247 941 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
EPCAMP16422 AC006453.4-201ENST00000636949 1252 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
EPCAMP16422 AL365199.1-201ENST00000421320 1714 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
EPCAMP16422 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
EPCAMP16422 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
EPCAMP16422 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
EPCAMP16422 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
EPCAMP16422 HARS-202ENST00000415192 1401 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
EPCAMP16422 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
EPCAMP16422 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
EPCAMP16422 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
EPCAMP16422 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
EPCAMP16422 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
EPCAMP16422 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
EPCAMP16422 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
EPCAMP16422 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
EPCAMP16422 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
EPCAMP16422 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
EPCAMP16422 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
EPCAMP16422 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
EPCAMP16422 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
EPCAMP16422 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
EPCAMP16422 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
EPCAMP16422 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
EPCAMP16422 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
EPCAMP16422 ZNRD1-201ENST00000332435 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
EPCAMP16422 TSHR-202ENST00000342443 1281 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
EPCAMP16422 WDR3-202ENST00000369441 1035 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
EPCAMP16422 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
EPCAMP16422 IGLV4-69-201ENST00000390282 419 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
EPCAMP16422 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
EPCAMP16422 MPV17-205ENST00000402310 906 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
EPCAMP16422 HCST-202ENST00000437550 445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
EPCAMP16422 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
EPCAMP16422 RPSAP36-202ENST00000494591 1261 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
EPCAMP16422 RNA5SP423-201ENST00000517127 109 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
EPCAMP16422 LSM1-203ENST00000520755 975 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
EPCAMP16422 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
EPCAMP16422 ERH-203ENST00000557016 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
EPCAMP16422 AP006547.1-201ENST00000563435 692 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
EPCAMP16422 AC104982.3-201ENST00000581995 514 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
EPCAMP16422 AC011447.3-204ENST00000585498 883 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
EPCAMP16422 RPS5-209ENST00000601521 1203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
EPCAMP16422 LINC01233-203ENST00000601708 494 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
EPCAMP16422 ECM1P1-201ENST00000604092 1279 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
EPCAMP16422 RBM8A-206ENST00000632555 751 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
EPCAMP16422 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
EPCAMP16422 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
EPCAMP16422 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
EPCAMP16422 OSTF1-201ENST00000346234 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
EPCAMP16422 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
EPCAMP16422 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
EPCAMP16422 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
EPCAMP16422 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
EPCAMP16422 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
EPCAMP16422 DMAC2-204ENST00000438807 1454 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
EPCAMP16422 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
EPCAMP16422 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
EPCAMP16422 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
EPCAMP16422 KATNA1-201ENST00000335643 1564 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
EPCAMP16422 MRFAP1-202ENST00000382581 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
EPCAMP16422 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
EPCAMP16422 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
EPCAMP16422 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
EPCAMP16422 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
EPCAMP16422 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
EPCAMP16422 CBX3-203ENST00000409747 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
EPCAMP16422 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
EPCAMP16422 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
EPCAMP16422 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.3 ms