Protein–RNA interactions for Protein: P16219

ACADS, Short-chain specific acyl-CoA dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACADSP16219 MYH7-201ENST00000355349 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ACADSP16219 PIGT-246ENST00000639499 2021 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ACADSP16219 RSPO3-201ENST00000356698 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ACADSP16219 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ACADSP16219 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ACADSP16219 MINDY2-203ENST00000559228 9238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ACADSP16219 SIPA1-203ENST00000527525 3235 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ACADSP16219 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ACADSP16219 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ACADSP16219 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ACADSP16219 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ACADSP16219 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ACADSP16219 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ACADSP16219 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ACADSP16219 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ACADSP16219 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ACADSP16219 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ACADSP16219 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ACADSP16219 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ACADSP16219 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ACADSP16219 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
ACADSP16219 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ACADSP16219 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
ACADSP16219 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ACADSP16219 AC092634.8-201ENST00000639687 773 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ACADSP16219 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
ACADSP16219 ARL10-201ENST00000310389 10845 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ACADSP16219 MYADM-203ENST00000391769 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ACADSP16219 ZNF70-201ENST00000341976 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ACADSP16219 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ACADSP16219 LINC00987-201ENST00000427111 2472 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ACADSP16219 KIF1C-201ENST00000320785 7919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ACADSP16219 UVRAG-201ENST00000356136 4123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ACADSP16219 HTR3A-202ENST00000355556 2331 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ACADSP16219 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ACADSP16219 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ACADSP16219 AL359881.3-201ENST00000602640 1721 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
ACADSP16219 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
ACADSP16219 ADGRB2-205ENST00000398547 4857 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ACADSP16219 TMPRSS6-201ENST00000346753 3197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ACADSP16219 TAP2-201ENST00000374897 5684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ACADSP16219 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ACADSP16219 AKNA-204ENST00000374075 5038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ACADSP16219 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ACADSP16219 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ACADSP16219 POU5F1B-201ENST00000465342 5360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ACADSP16219 FOXP3-203ENST00000376207 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ACADSP16219 HIST3H2BB-201ENST00000620438 2364 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ACADSP16219 BAIAP3-216ENST00000628027 4732 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ACADSP16219 RBM6-201ENST00000266022 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ACADSP16219 YTHDF3-216ENST00000623280 5193 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ACADSP16219 MAP3K1-201ENST00000399503 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ACADSP16219 COQ8A-203ENST00000366779 5523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ACADSP16219 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ACADSP16219 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ACADSP16219 HNRNPH1-204ENST00000442819 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ACADSP16219 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ACADSP16219 SLC12A7-201ENST00000264930 5280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ACADSP16219 PIK3R1-211ENST00000521381 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ACADSP16219 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ACADSP16219 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ACADSP16219 NFATC4-207ENST00000553469 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ACADSP16219 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ACADSP16219 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ACADSP16219 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ACADSP16219 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ACADSP16219 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ACADSP16219 ABCG1-205ENST00000398449 2998 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ACADSP16219 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ACADSP16219 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ACADSP16219 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ACADSP16219 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ACADSP16219 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
ACADSP16219 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ACADSP16219 RCN2-203ENST00000394885 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ACADSP16219 NF2-205ENST00000361452 5884 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
ACADSP16219 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
ACADSP16219 GGT5-202ENST00000327365 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
ACADSP16219 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
ACADSP16219 ALAS2-201ENST00000330807 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
ACADSP16219 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
ACADSP16219 LINC00476-204ENST00000429781 2825 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
ACADSP16219 POLR2E-213ENST00000615234 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
ACADSP16219 LARGE1-201ENST00000354992 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
ACADSP16219 KHK-201ENST00000260598 2397 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
ACADSP16219 INF2-203ENST00000392634 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
ACADSP16219 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
ACADSP16219 CYP20A1-201ENST00000356079 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
ACADSP16219 MPZL1-203ENST00000392121 3421 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
ACADSP16219 CYB561-201ENST00000360793 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
ACADSP16219 STRA6-205ENST00000432245 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
ACADSP16219 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
ACADSP16219 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
ACADSP16219 DFNA5-201ENST00000342947 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
ACADSP16219 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
ACADSP16219 AC092135.3-201ENST00000624151 1846 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
ACADSP16219 GRIN2C-201ENST00000293190 4261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ACADSP16219 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ACADSP16219 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ACADSP16219 UBTF-205ENST00000526094 2459 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 99.4 ms