Protein–RNA interactions for Protein: P12004

PCNA, Proliferating cell nuclear antigen, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCNAP12004 FOXB1-201ENST00000396057 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PCNAP12004 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PCNAP12004 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PCNAP12004 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PCNAP12004 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
PCNAP12004 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PCNAP12004 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PCNAP12004 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PCNAP12004 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PCNAP12004 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PCNAP12004 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PCNAP12004 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PCNAP12004 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PCNAP12004 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
PCNAP12004 UBE3B-202ENST00000342494 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PCNAP12004 FAM110C-201ENST00000327669 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PCNAP12004 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PCNAP12004 APPL1-201ENST00000288266 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PCNAP12004 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PCNAP12004 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PCNAP12004 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PCNAP12004 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PCNAP12004 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PCNAP12004 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PCNAP12004 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PCNAP12004 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PCNAP12004 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PCNAP12004 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PCNAP12004 GOLGA7B-201ENST00000370602 6447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PCNAP12004 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PCNAP12004 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PCNAP12004 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PCNAP12004 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PCNAP12004 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PCNAP12004 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PCNAP12004 RPTOR-202ENST00000544334 5734 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PCNAP12004 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PCNAP12004 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PCNAP12004 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PCNAP12004 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PCNAP12004 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
PCNAP12004 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PCNAP12004 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PCNAP12004 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PCNAP12004 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PCNAP12004 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PCNAP12004 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PCNAP12004 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PCNAP12004 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
PCNAP12004 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PCNAP12004 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PCNAP12004 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PCNAP12004 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
PCNAP12004 EML4-201ENST00000318522 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PCNAP12004 SLC24A3-201ENST00000328041 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PCNAP12004 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PCNAP12004 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PCNAP12004 DLGAP2-215ENST00000637795 3380 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PCNAP12004 CTBP1-209ENST00000510568 4250 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PCNAP12004 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PCNAP12004 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PCNAP12004 STRN3-201ENST00000355683 3970 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
PCNAP12004 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
PCNAP12004 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
PCNAP12004 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
PCNAP12004 MYH6-201ENST00000356287 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
PCNAP12004 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
PCNAP12004 AL139423.1-201ENST00000606802 7923 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
PCNAP12004 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
PCNAP12004 TP53INP2-201ENST00000374809 4018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
PCNAP12004 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
PCNAP12004 COMP-203ENST00000542601 2707 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PCNAP12004 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
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PCNAP12004 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PCNAP12004 HS6ST3-201ENST00000376705 7804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PCNAP12004 LHFPL2-207ENST00000515007 4680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PCNAP12004 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
PCNAP12004 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
PCNAP12004 RBBP8-201ENST00000327155 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PCNAP12004 ZFP41-203ENST00000520584 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PCNAP12004 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PCNAP12004 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PCNAP12004 DMPK-202ENST00000343373 3227 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PCNAP12004 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
PCNAP12004 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PCNAP12004 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PCNAP12004 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
PCNAP12004 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PCNAP12004 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PCNAP12004 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PCNAP12004 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
PCNAP12004 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PCNAP12004 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PCNAP12004 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PCNAP12004 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
PCNAP12004 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PCNAP12004 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
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