Protein–RNA interactions for Protein: P08240

SRPRA, Signal recognition particle receptor subunit alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRPRAP08240 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SRPRAP08240 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SRPRAP08240 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SRPRAP08240 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SRPRAP08240 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SRPRAP08240 TNNI1-203ENST00000367312 1100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SRPRAP08240 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SRPRAP08240 RHCE-206ENST00000413854 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SRPRAP08240 ATP5G2P4-201ENST00000442175 420 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
SRPRAP08240 AL354710.2-201ENST00000468244 550 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SRPRAP08240 AC084864.1-201ENST00000496217 305 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SRPRAP08240 TMEM161B-AS1-212ENST00000513011 833 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SRPRAP08240 AC026410.3-201ENST00000514280 936 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
SRPRAP08240 AP001995.1-201ENST00000531784 1157 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SRPRAP08240 LINC01089-209ENST00000542933 1220 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SRPRAP08240 TMEM170A-203ENST00000566980 547 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SRPRAP08240 AC008735.3-201ENST00000596646 500 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
SRPRAP08240 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SRPRAP08240 CCL4L2-214ENST00000617416 1258 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SRPRAP08240 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SRPRAP08240 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SRPRAP08240 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SRPRAP08240 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SRPRAP08240 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SRPRAP08240 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SRPRAP08240 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SRPRAP08240 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SRPRAP08240 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SRPRAP08240 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SRPRAP08240 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SRPRAP08240 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SRPRAP08240 BCS1L-205ENST00000412366 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SRPRAP08240 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SRPRAP08240 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SRPRAP08240 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SRPRAP08240 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SRPRAP08240 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SRPRAP08240 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SRPRAP08240 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SRPRAP08240 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SRPRAP08240 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SRPRAP08240 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SRPRAP08240 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SRPRAP08240 PPDPF-201ENST00000370177 627 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SRPRAP08240 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SRPRAP08240 IFI27L1-201ENST00000393115 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SRPRAP08240 AC079776.1-201ENST00000401540 1152 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
SRPRAP08240 TPM1-207ENST00000403994 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SRPRAP08240 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SRPRAP08240 TMEM14DP-201ENST00000422205 345 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
SRPRAP08240 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SRPRAP08240 KDM4A-AS1-204ENST00000439057 686 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SRPRAP08240 TMEM147-AS1-201ENST00000444728 487 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SRPRAP08240 ACA64.2-201ENST00000459014 129 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
SRPRAP08240 MTX3-202ENST00000512528 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SRPRAP08240 CCKBR-202ENST00000525014 792 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SRPRAP08240 ACRV1-202ENST00000527795 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SRPRAP08240 AL132711.1-201ENST00000557546 722 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SRPRAP08240 RAB43P1-201ENST00000561790 589 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
SRPRAP08240 RPL36-203ENST00000577222 874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SRPRAP08240 RAMP2-202ENST00000587142 549 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SRPRAP08240 RAMP2-203ENST00000588576 573 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SRPRAP08240 AC011497.1-201ENST00000596781 561 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SRPRAP08240 AC093813.1-201ENST00000605066 256 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
SRPRAP08240 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SRPRAP08240 AC006449.3-201ENST00000620144 563 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SRPRAP08240 RPSAP52-203ENST00000622976 1023 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
SRPRAP08240 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SRPRAP08240 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SRPRAP08240 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SRPRAP08240 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SRPRAP08240 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SRPRAP08240 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SRPRAP08240 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
SRPRAP08240 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SRPRAP08240 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SRPRAP08240 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SRPRAP08240 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SRPRAP08240 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SRPRAP08240 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SRPRAP08240 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SRPRAP08240 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SRPRAP08240 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SRPRAP08240 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SRPRAP08240 S100A16-201ENST00000368703 946 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SRPRAP08240 CLCN6-207ENST00000376497 814 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SRPRAP08240 LRRC30-201ENST00000383467 923 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SRPRAP08240 ECSIT-203ENST00000417981 970 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SRPRAP08240 AC112492.5-201ENST00000421897 457 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
SRPRAP08240 SFTPC-202ENST00000437090 773 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SRPRAP08240 ATG10-207ENST00000513443 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SRPRAP08240 IGHV3-71-201ENST00000523324 359 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
SRPRAP08240 HILS1-202ENST00000545329 423 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
SRPRAP08240 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SRPRAP08240 GCHFR-204ENST00000559445 626 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SRPRAP08240 ZNF180-204ENST00000586637 1023 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SRPRAP08240 AC017083.2-201ENST00000608069 979 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
SRPRAP08240 FAM171B-202ENST00000612606 940 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SRPRAP08240 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SRPRAP08240 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.3 ms