Protein–RNA interactions for Protein: O43861

ATP9B, Probable phospholipid-transporting ATPase IIB, humanhuman

Predictions only

Length 1,147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP9BO43861 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATP9BO43861 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATP9BO43861 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATP9BO43861 STK33P1-201ENST00000423835 1218 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
ATP9BO43861 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
ATP9BO43861 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
ATP9BO43861 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATP9BO43861 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATP9BO43861 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATP9BO43861 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATP9BO43861 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATP9BO43861 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATP9BO43861 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATP9BO43861 BX547991.1-201ENST00000582543 1206 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATP9BO43861 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATP9BO43861 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
ATP9BO43861 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATP9BO43861 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATP9BO43861 ITSN1-204ENST00000381285 6107 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATP9BO43861 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATP9BO43861 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATP9BO43861 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATP9BO43861 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATP9BO43861 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATP9BO43861 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
ATP9BO43861 EYA4-205ENST00000430974 2364 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATP9BO43861 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATP9BO43861 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATP9BO43861 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATP9BO43861 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATP9BO43861 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATP9BO43861 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATP9BO43861 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATP9BO43861 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATP9BO43861 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ATP9BO43861 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ATP9BO43861 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ATP9BO43861 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ATP9BO43861 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ATP9BO43861 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ATP9BO43861 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ATP9BO43861 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ATP9BO43861 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ATP9BO43861 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ATP9BO43861 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ATP9BO43861 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
ATP9BO43861 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ATP9BO43861 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ATP9BO43861 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ATP9BO43861 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ATP9BO43861 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ATP9BO43861 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ATP9BO43861 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ATP9BO43861 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ATP9BO43861 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
ATP9BO43861 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ATP9BO43861 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ATP9BO43861 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
ATP9BO43861 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ATP9BO43861 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ATP9BO43861 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ATP9BO43861 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ATP9BO43861 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ATP9BO43861 RN7SL204P-201ENST00000582831 262 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
ATP9BO43861 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ATP9BO43861 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ATP9BO43861 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ATP9BO43861 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ATP9BO43861 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ATP9BO43861 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ATP9BO43861 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ATP9BO43861 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ATP9BO43861 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ATP9BO43861 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ATP9BO43861 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ATP9BO43861 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ATP9BO43861 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ATP9BO43861 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ATP9BO43861 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ATP9BO43861 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ATP9BO43861 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ATP9BO43861 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ATP9BO43861 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ATP9BO43861 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ATP9BO43861 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ATP9BO43861 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ATP9BO43861 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ATP9BO43861 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ATP9BO43861 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ATP9BO43861 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ATP9BO43861 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ATP9BO43861 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ATP9BO43861 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ATP9BO43861 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
ATP9BO43861 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ATP9BO43861 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ATP9BO43861 AC002472.2-201ENST00000442739 958 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
ATP9BO43861 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
ATP9BO43861 AC124312.2-201ENST00000546615 427 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ATP9BO43861 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms