Protein–RNA interactions for Protein: O43731

KDELR3, ER lumen protein-retaining receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 214 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDELR3O43731 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
KDELR3O43731 AC079336.2-201ENST00000578408 927 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
KDELR3O43731 MIR8072-201ENST00000614241 80 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
KDELR3O43731 RPP40-207ENST00000618533 1056 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
KDELR3O43731 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
KDELR3O43731 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
KDELR3O43731 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
KDELR3O43731 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
KDELR3O43731 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
KDELR3O43731 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
KDELR3O43731 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
KDELR3O43731 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
KDELR3O43731 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
KDELR3O43731 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
KDELR3O43731 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
KDELR3O43731 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
KDELR3O43731 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
KDELR3O43731 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
KDELR3O43731 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
KDELR3O43731 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
KDELR3O43731 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
KDELR3O43731 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
KDELR3O43731 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
KDELR3O43731 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
KDELR3O43731 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
KDELR3O43731 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
KDELR3O43731 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
KDELR3O43731 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
KDELR3O43731 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
KDELR3O43731 METTL21A-209ENST00000448823 869 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
KDELR3O43731 RAD51D-205ENST00000460118 1064 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
KDELR3O43731 AC104596.2-201ENST00000512793 793 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
KDELR3O43731 AC005391.1-201ENST00000613285 341 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
KDELR3O43731 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
KDELR3O43731 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
KDELR3O43731 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
KDELR3O43731 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
KDELR3O43731 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
KDELR3O43731 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
KDELR3O43731 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
KDELR3O43731 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
KDELR3O43731 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
KDELR3O43731 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
KDELR3O43731 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
KDELR3O43731 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
KDELR3O43731 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
KDELR3O43731 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
KDELR3O43731 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
KDELR3O43731 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
KDELR3O43731 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
KDELR3O43731 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
KDELR3O43731 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
KDELR3O43731 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
KDELR3O43731 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
KDELR3O43731 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
KDELR3O43731 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
KDELR3O43731 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
KDELR3O43731 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
KDELR3O43731 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
KDELR3O43731 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
KDELR3O43731 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
KDELR3O43731 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
KDELR3O43731 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
KDELR3O43731 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
KDELR3O43731 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
KDELR3O43731 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
KDELR3O43731 RAB34-206ENST00000415040 1293 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
KDELR3O43731 AC104135.1-201ENST00000418001 763 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
KDELR3O43731 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
KDELR3O43731 AC093459.1-202ENST00000438963 768 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
KDELR3O43731 MYCLP2-201ENST00000449268 967 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
KDELR3O43731 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
KDELR3O43731 EVX1-AS-202ENST00000519050 576 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
KDELR3O43731 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
KDELR3O43731 YIF1B-214ENST00000591784 940 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
KDELR3O43731 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
KDELR3O43731 AC008494.3-201ENST00000606615 944 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
KDELR3O43731 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
KDELR3O43731 AC007431.3-201ENST00000623221 587 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
KDELR3O43731 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
KDELR3O43731 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
KDELR3O43731 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
KDELR3O43731 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
KDELR3O43731 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
KDELR3O43731 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
KDELR3O43731 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
KDELR3O43731 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
KDELR3O43731 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
KDELR3O43731 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
KDELR3O43731 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
KDELR3O43731 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
KDELR3O43731 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
KDELR3O43731 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
KDELR3O43731 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
KDELR3O43731 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
KDELR3O43731 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
KDELR3O43731 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
KDELR3O43731 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
KDELR3O43731 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
KDELR3O43731 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 191.1 ms