Protein–RNA interactions for Protein: O15438

ABCC3, Canalicular multispecific organic anion transporter 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,527 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCC3O15438 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ABCC3O15438 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ABCC3O15438 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ABCC3O15438 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ABCC3O15438 AP000593.2-201ENST00000542775 1433 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
ABCC3O15438 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ABCC3O15438 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ABCC3O15438 CCNE1-203ENST00000444983 1680 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ABCC3O15438 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ABCC3O15438 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ABCC3O15438 ARF5-201ENST00000000233 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ABCC3O15438 DPCD-202ENST00000370151 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ABCC3O15438 LYPLA2-202ENST00000374502 1072 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ABCC3O15438 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ABCC3O15438 AC234782.1-201ENST00000451950 919 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
ABCC3O15438 CEP164P1-201ENST00000455142 418 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
ABCC3O15438 LINC02046-201ENST00000469812 378 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ABCC3O15438 AC025165.3-201ENST00000471530 679 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ABCC3O15438 AC008443.1-201ENST00000511331 1000 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ABCC3O15438 AL135838.1-202ENST00000556411 441 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ABCC3O15438 RN7SL555P-201ENST00000584742 339 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
ABCC3O15438 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ABCC3O15438 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ABCC3O15438 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ABCC3O15438 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ABCC3O15438 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ABCC3O15438 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ABCC3O15438 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ABCC3O15438 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ABCC3O15438 IGHA2-202ENST00000497872 1320 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ABCC3O15438 TPD52L2-207ENST00000369927 1094 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ABCC3O15438 C6orf136-202ENST00000376471 614 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ABCC3O15438 KRTAP10-3-201ENST00000391620 971 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ABCC3O15438 AC008267.1-201ENST00000474858 1069 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
ABCC3O15438 AL160314.3-201ENST00000556041 767 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
ABCC3O15438 EID1-202ENST00000560490 584 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ABCC3O15438 AC108134.4-201ENST00000570700 302 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ABCC3O15438 GLIS2-AS1-201ENST00000576080 340 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ABCC3O15438 FBXL12-204ENST00000586469 544 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ABCC3O15438 AC005324.6-201ENST00000587972 613 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
ABCC3O15438 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ABCC3O15438 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ABCC3O15438 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ABCC3O15438 DNAJC19-201ENST00000382564 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ABCC3O15438 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ABCC3O15438 SLC38A5-213ENST00000620913 1993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ABCC3O15438 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ABCC3O15438 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ABCC3O15438 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ABCC3O15438 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ABCC3O15438 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ABCC3O15438 MBD3L5-201ENST00000329753 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ABCC3O15438 APRT-201ENST00000378364 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ABCC3O15438 LYRM4-206ENST00000468929 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ABCC3O15438 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ABCC3O15438 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ABCC3O15438 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ABCC3O15438 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ABCC3O15438 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ABCC3O15438 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ABCC3O15438 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ABCC3O15438 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
ABCC3O15438 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ABCC3O15438 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
ABCC3O15438 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ABCC3O15438 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ABCC3O15438 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ABCC3O15438 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ABCC3O15438 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ABCC3O15438 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ABCC3O15438 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ABCC3O15438 IL27-201ENST00000356897 1044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ABCC3O15438 SSR4-203ENST00000370086 643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ABCC3O15438 SRSF10-211ENST00000484146 1089 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ABCC3O15438 NAT9-212ENST00000581136 1011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ABCC3O15438 AC011498.6-201ENST00000592034 510 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ABCC3O15438 AL805961.1-203ENST00000641078 1258 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
ABCC3O15438 TMBIM1-201ENST00000258412 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ABCC3O15438 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
ABCC3O15438 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
ABCC3O15438 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
ABCC3O15438 AC004899.1-201ENST00000424687 1714 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
ABCC3O15438 SPERT-204ENST00000610924 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
ABCC3O15438 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
ABCC3O15438 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ABCC3O15438 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ABCC3O15438 DYDC1-201ENST00000372202 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ABCC3O15438 AP000356.1-201ENST00000438893 364 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ABCC3O15438 AGTRAP-206ENST00000452018 809 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ABCC3O15438 EFCAB10-201ENST00000460135 717 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ABCC3O15438 AC125604.1-201ENST00000496255 707 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
ABCC3O15438 HDDC2-204ENST00000608295 879 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ABCC3O15438 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ABCC3O15438 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ABCC3O15438 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ABCC3O15438 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ABCC3O15438 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ABCC3O15438 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ABCC3O15438 LHFPL3-201ENST00000401970 1378 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ABCC3O15438 MPZL2-202ENST00000438295 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.4 ms