Protein–RNA interactions for Protein: O14522

PTPRT, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase T, humanhuman

Predictions only

Length 1,441 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRTO14522 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PTPRTO14522 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PTPRTO14522 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PTPRTO14522 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PTPRTO14522 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PTPRTO14522 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PTPRTO14522 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PTPRTO14522 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PTPRTO14522 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PTPRTO14522 NOL4L-202ENST00000326071 701 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PTPRTO14522 KRTAP21-2-201ENST00000333892 440 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PTPRTO14522 CIDEC-201ENST00000336832 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PTPRTO14522 C6orf136-202ENST00000376471 614 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PTPRTO14522 LINC01237-201ENST00000415434 573 ntTSL 4 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PTPRTO14522 CIDEC-203ENST00000423850 1036 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PTPRTO14522 HNRNPA1P63-201ENST00000427917 963 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
PTPRTO14522 USE1-202ENST00000445667 795 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PTPRTO14522 AGTRAP-206ENST00000452018 809 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PTPRTO14522 CIDEC-206ENST00000455015 1123 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PTPRTO14522 RN7SL8P-201ENST00000461771 266 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
PTPRTO14522 IGHV3OR16-8-201ENST00000565407 349 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PTPRTO14522 AC136428.1-201ENST00000569103 349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PTPRTO14522 AC068025.1-201ENST00000577218 762 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PTPRTO14522 AC008537.4-201ENST00000595728 1103 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PTPRTO14522 WDR45-230ENST00000634559 1192 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PTPRTO14522 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PTPRTO14522 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PTPRTO14522 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PTPRTO14522 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PTPRTO14522 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PTPRTO14522 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PTPRTO14522 LINC00094-204ENST00000599836 1689 ntAPPRIS P5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PTPRTO14522 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PTPRTO14522 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PTPRTO14522 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PTPRTO14522 NSUN5P1-204ENST00000428392 1562 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PTPRTO14522 SYCE2-201ENST00000293695 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PTPRTO14522 C1orf43-205ENST00000368519 1163 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PTPRTO14522 S100A2-203ENST00000368709 457 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PTPRTO14522 EDF1-202ENST00000371648 809 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PTPRTO14522 ACTG1P2-201ENST00000415776 1125 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
PTPRTO14522 ACTG1P11-201ENST00000425411 1125 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
PTPRTO14522 IQCF3-203ENST00000444293 450 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PTPRTO14522 SIRPB2-203ENST00000444444 884 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PTPRTO14522 NOC2LP1-201ENST00000450578 752 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
PTPRTO14522 AC113383.1-201ENST00000514696 582 ntTSL 4 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PTPRTO14522 RCE1-204ENST00000525356 1270 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PTPRTO14522 HIRIP3-204ENST00000564026 988 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PTPRTO14522 TXNDC17-202ENST00000570330 459 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PTPRTO14522 AL136301.1-201ENST00000615830 422 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
PTPRTO14522 AC100757.4-201ENST00000626934 759 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
PTPRTO14522 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PTPRTO14522 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PTPRTO14522 PLCXD2-204ENST00000477665 1721 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PTPRTO14522 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PTPRTO14522 TCF7-218ENST00000520958 1408 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PTPRTO14522 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PTPRTO14522 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PTPRTO14522 TOM1L1-201ENST00000348161 1895 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PTPRTO14522 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PTPRTO14522 SNHG1-213ENST00000540725 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PTPRTO14522 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PTPRTO14522 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PTPRTO14522 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PTPRTO14522 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PTPRTO14522 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PTPRTO14522 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PTPRTO14522 ANAPC11-202ENST00000357385 881 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PTPRTO14522 KRTAP20-4-201ENST00000382828 224 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PTPRTO14522 CRCP-204ENST00000398684 492 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PTPRTO14522 KLF2P2-201ENST00000416807 1039 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
PTPRTO14522 TCERG1L-AS1-201ENST00000436942 472 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PTPRTO14522 SEPT7P9-202ENST00000489259 743 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PTPRTO14522 AC019193.1-201ENST00000506678 823 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
PTPRTO14522 KRT18P25-201ENST00000508931 1278 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
PTPRTO14522 ANAPC13-205ENST00000511751 896 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PTPRTO14522 BX539320.1-201ENST00000623759 877 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
PTPRTO14522 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
PTPRTO14522 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PTPRTO14522 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PTPRTO14522 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PTPRTO14522 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PTPRTO14522 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PTPRTO14522 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PTPRTO14522 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PTPRTO14522 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PTPRTO14522 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
PTPRTO14522 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PTPRTO14522 ARV1-201ENST00000310256 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PTPRTO14522 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PTPRTO14522 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PTPRTO14522 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PTPRTO14522 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PTPRTO14522 POLR2L-201ENST00000322028 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PTPRTO14522 NIF3L1-205ENST00000409588 1269 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PTPRTO14522 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PTPRTO14522 HCST-202ENST00000437550 445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PTPRTO14522 AL160290.2-202ENST00000448671 574 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PTPRTO14522 RPL35A-205ENST00000448864 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PTPRTO14522 FKBP2-203ENST00000449942 613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms