Protein–RNA interactions for Protein: O00253

AGRP, Agouti-related protein, humanhuman

Predictions only

Length 132 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AGRPO00253 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
AGRPO00253 ZSCAN2-213ENST00000541040 965 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
AGRPO00253 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
AGRPO00253 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
AGRPO00253 AC023310.3-201ENST00000557027 670 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
AGRPO00253 AC100756.1-201ENST00000562736 682 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
AGRPO00253 AC138749.3-201ENST00000567691 622 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
AGRPO00253 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
AGRPO00253 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
AGRPO00253 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
AGRPO00253 IFT20-216ENST00000588477 774 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
AGRPO00253 AL359881.2-201ENST00000602973 570 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
AGRPO00253 MRNIP-225ENST00000610475 810 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
AGRPO00253 AC116165.1-201ENST00000611806 668 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
AGRPO00253 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
AGRPO00253 CCL4L2-214ENST00000617416 1258 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
AGRPO00253 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
AGRPO00253 PMS1-221ENST00000624204 3417 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
AGRPO00253 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
AGRPO00253 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
AGRPO00253 FAM84A-201ENST00000295092 6355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
AGRPO00253 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
AGRPO00253 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
AGRPO00253 RIPK1-201ENST00000259808 4160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
AGRPO00253 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
AGRPO00253 GRSF1-201ENST00000254799 6666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
AGRPO00253 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
AGRPO00253 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
AGRPO00253 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
AGRPO00253 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
AGRPO00253 FAM172A-206ENST00000509163 1369 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
AGRPO00253 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
AGRPO00253 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
AGRPO00253 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
AGRPO00253 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
AGRPO00253 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
AGRPO00253 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
AGRPO00253 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
AGRPO00253 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
AGRPO00253 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
AGRPO00253 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
AGRPO00253 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
AGRPO00253 RNASEH2B-202ENST00000422660 4830 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
AGRPO00253 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
AGRPO00253 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
AGRPO00253 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
AGRPO00253 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
AGRPO00253 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
AGRPO00253 LCN15-201ENST00000316144 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
AGRPO00253 WDR38-201ENST00000373574 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
AGRPO00253 AL136311.1-206ENST00000416069 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
AGRPO00253 ARSEP1-201ENST00000420443 635 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
AGRPO00253 Z98749.2-207ENST00000443658 679 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
AGRPO00253 MRPL36-204ENST00000508987 686 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
AGRPO00253 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
AGRPO00253 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
AGRPO00253 SLC25A39-207ENST00000586016 1156 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
AGRPO00253 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
AGRPO00253 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
AGRPO00253 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
AGRPO00253 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
AGRPO00253 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
AGRPO00253 ACBD5-202ENST00000375897 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
AGRPO00253 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
AGRPO00253 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
AGRPO00253 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
AGRPO00253 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
AGRPO00253 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
AGRPO00253 SNX30-201ENST00000374232 7622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
AGRPO00253 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
AGRPO00253 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
AGRPO00253 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
AGRPO00253 RPTOR-202ENST00000544334 5734 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
AGRPO00253 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
AGRPO00253 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
AGRPO00253 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
AGRPO00253 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
AGRPO00253 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
AGRPO00253 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
AGRPO00253 DIAPH2-204ENST00000373054 3376 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
AGRPO00253 SPEG-205ENST00000396698 3379 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
AGRPO00253 LYPLA2-201ENST00000374501 1117 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
AGRPO00253 KRTAP10-1-201ENST00000400375 1215 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
AGRPO00253 AL645941.1-201ENST00000415875 338 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
AGRPO00253 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
AGRPO00253 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
AGRPO00253 AC124944.1-201ENST00000448113 625 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
AGRPO00253 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
AGRPO00253 GPR53P-205ENST00000457298 1084 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
AGRPO00253 TMEM14B-212ENST00000475942 992 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
AGRPO00253 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
AGRPO00253 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
AGRPO00253 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
AGRPO00253 AC073389.2-202ENST00000607450 441 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
AGRPO00253 AC239798.4-201ENST00000609879 700 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
AGRPO00253 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
AGRPO00253 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
AGRPO00253 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
AGRPO00253 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
AGRPO00253 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
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