Protein–RNA interactions for Protein: H3BUS1

SYS1-DBNDD2, SYS1-DBNDD2 readthrough (NMD candidate), humanhuman

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Length 97 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CAND2-201ENST00000295989 4429 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
SYS1-DBNDD2H3BUS1 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
SYS1-DBNDD2H3BUS1 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TNS2-202ENST00000314276 4944 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DAGLB-201ENST00000297056 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GPR132-202ENST00000392585 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LINC01107-201ENST00000446979 1975 ntTSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PHLDB2-204ENST00000431670 6127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AP001267.2-201ENST00000532619 2086 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SMYD5-202ENST00000389501 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
SYS1-DBNDD2H3BUS1 KRT4-204ENST00000551956 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MAGI3-202ENST00000369611 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
SYS1-DBNDD2H3BUS1 KDM2B-202ENST00000377071 4595 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FFAR4-202ENST00000371483 3653 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PCDHB5-201ENST00000231134 3408 ntAPPRIS P1 BASIC11.37□□□□□ -0.59
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NLRP2B-201ENST00000434992 3194 ntAPPRIS P1 BASIC11.37□□□□□ -0.59
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CABLES2-201ENST00000279101 3785 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RIC8B-202ENST00000392837 5135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FASN-201ENST00000306749 8565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DNAJB6-201ENST00000262177 2527 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DYDC2-204ENST00000372199 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
SYS1-DBNDD2H3BUS1 KLHL34-201ENST00000379499 3641 ntAPPRIS P1 BASIC11.37□□□□□ -0.59
SYS1-DBNDD2H3BUS1 KIRREL3-205ENST00000529097 3397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PSME3-203ENST00000541124 3366 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MFAP3-201ENST00000322602 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC11.37□□□□□ -0.59
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SPPL2B-209ENST00000613503 3456 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TNFAIP8L1-201ENST00000327473 3814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
SYS1-DBNDD2H3BUS1 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ALAS1-204ENST00000469224 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC11.37□□□□□ -0.59
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TNFAIP8L1-202ENST00000536716 3845 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
SYS1-DBNDD2H3BUS1 JKAMP-207ENST00000554271 2137 ntTSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC11.37□□□□□ -0.59
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CAMKV-202ENST00000463537 2818 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CHMP7-202ENST00000397677 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MAN2B1-203ENST00000456935 3184 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AP5Z1-201ENST00000348624 2901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PAPSS2-202ENST00000456849 3856 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LINC00863-201ENST00000439559 3287 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MLST8-201ENST00000301724 1735 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
SYS1-DBNDD2H3BUS1 C1orf43-206ENST00000368521 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NMNAT3-203ENST00000413939 1711 ntTSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
SYS1-DBNDD2H3BUS1 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
SYS1-DBNDD2H3BUS1 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC11.37□□□□□ -0.59
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CREB3L4-202ENST00000368600 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GAB2-202ENST00000361507 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FOXD4L5-201ENST00000377420 3109 ntAPPRIS P1 BASIC11.37□□□□□ -0.59
SYS1-DBNDD2H3BUS1 KIFC3-202ENST00000421376 3128 ntTSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CDK20-202ENST00000336654 2176 ntTSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
SYS1-DBNDD2H3BUS1 WDR17-205ENST00000508596 4294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ARHGEF37-201ENST00000333677 4968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LPO-201ENST00000262290 2979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GPRC5C-202ENST00000392627 2988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ITGB8-201ENST00000222573 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
SYS1-DBNDD2H3BUS1 THBS2-206ENST00000617924 5280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FUT1-201ENST00000310160 4246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LIMD2-201ENST00000259006 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DLG4-203ENST00000399510 3975 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL356275.1-201ENST00000638446 7440 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
SYS1-DBNDD2H3BUS1 STK40-204ENST00000373132 3621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
SYS1-DBNDD2H3BUS1 STK26-202ENST00000394334 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ATG14-201ENST00000247178 4742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SEPT6-201ENST00000343984 2693 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PLAU-202ENST00000446342 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
SYS1-DBNDD2H3BUS1 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FZD6-206ENST00000523739 2774 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PSMD9-207ENST00000541212 2784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL589669.1-201ENST00000639829 1506 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZNF587-203ENST00000423137 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZMYND15-201ENST00000269289 2448 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SLC22A23-202ENST00000380302 2883 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NOTCH1-201ENST00000277541 9371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC008894.2-201ENST00000597983 2987 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RAB6C-201ENST00000410061 3075 ntAPPRIS P1 BASIC11.36□□□□□ -0.59
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
SYS1-DBNDD2H3BUS1 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
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