Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULD4

BRPF3, Bromodomain and PHD finger-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRPF3Q9ULD4 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
BRPF3Q9ULD4 CAPN1-224ENST00000533129 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
BRPF3Q9ULD4 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
BRPF3Q9ULD4 AC148477.2-201ENST00000537762 3039 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
BRPF3Q9ULD4 ACBD5-202ENST00000375897 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
BRPF3Q9ULD4 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
BRPF3Q9ULD4 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
BRPF3Q9ULD4 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
BRPF3Q9ULD4 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
BRPF3Q9ULD4 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
BRPF3Q9ULD4 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
BRPF3Q9ULD4 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
BRPF3Q9ULD4 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
BRPF3Q9ULD4 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
BRPF3Q9ULD4 PHKG2-204ENST00000563588 5539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
BRPF3Q9ULD4 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
BRPF3Q9ULD4 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
BRPF3Q9ULD4 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
BRPF3Q9ULD4 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
BRPF3Q9ULD4 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
BRPF3Q9ULD4 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
BRPF3Q9ULD4 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
BRPF3Q9ULD4 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
BRPF3Q9ULD4 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
BRPF3Q9ULD4 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
BRPF3Q9ULD4 SYP-201ENST00000263233 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
BRPF3Q9ULD4 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
BRPF3Q9ULD4 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
BRPF3Q9ULD4 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
BRPF3Q9ULD4 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
BRPF3Q9ULD4 EPHX2-209ENST00000521780 2038 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
BRPF3Q9ULD4 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
BRPF3Q9ULD4 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
BRPF3Q9ULD4 AGT-201ENST00000366667 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
BRPF3Q9ULD4 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
BRPF3Q9ULD4 ALDH1B1-201ENST00000377698 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
BRPF3Q9ULD4 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
BRPF3Q9ULD4 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
BRPF3Q9ULD4 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
BRPF3Q9ULD4 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
BRPF3Q9ULD4 WLS-201ENST00000262348 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
BRPF3Q9ULD4 AMPD2-218ENST00000528454 2728 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
BRPF3Q9ULD4 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
BRPF3Q9ULD4 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
BRPF3Q9ULD4 GTF2H2C-210ENST00000510979 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
BRPF3Q9ULD4 SEMA3F-202ENST00000413852 3212 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
BRPF3Q9ULD4 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
BRPF3Q9ULD4 ENDOV-204ENST00000518137 2815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
BRPF3Q9ULD4 WASH2P-202ENST00000538033 2800 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
BRPF3Q9ULD4 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
BRPF3Q9ULD4 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
BRPF3Q9ULD4 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
BRPF3Q9ULD4 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
BRPF3Q9ULD4 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
BRPF3Q9ULD4 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
BRPF3Q9ULD4 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
BRPF3Q9ULD4 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC19.28■□□□□ 0.68
BRPF3Q9ULD4 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
BRPF3Q9ULD4 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
BRPF3Q9ULD4 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
BRPF3Q9ULD4 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
BRPF3Q9ULD4 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
BRPF3Q9ULD4 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
BRPF3Q9ULD4 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
BRPF3Q9ULD4 TAF6-201ENST00000344095 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
BRPF3Q9ULD4 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
BRPF3Q9ULD4 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
BRPF3Q9ULD4 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
BRPF3Q9ULD4 ARHGAP6-204ENST00000380718 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
BRPF3Q9ULD4 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
BRPF3Q9ULD4 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
BRPF3Q9ULD4 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
BRPF3Q9ULD4 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
BRPF3Q9ULD4 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
BRPF3Q9ULD4 THBS4-201ENST00000350881 3222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
BRPF3Q9ULD4 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
BRPF3Q9ULD4 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
BRPF3Q9ULD4 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
BRPF3Q9ULD4 AL359183.1-201ENST00000623796 2132 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
BRPF3Q9ULD4 ABR-228ENST00000574437 3196 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
BRPF3Q9ULD4 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
BRPF3Q9ULD4 CABP4-201ENST00000325656 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
BRPF3Q9ULD4 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
BRPF3Q9ULD4 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
BRPF3Q9ULD4 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
BRPF3Q9ULD4 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
BRPF3Q9ULD4 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
BRPF3Q9ULD4 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
BRPF3Q9ULD4 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC19.27■□□□□ 0.68
BRPF3Q9ULD4 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
BRPF3Q9ULD4 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
BRPF3Q9ULD4 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
BRPF3Q9ULD4 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
BRPF3Q9ULD4 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
BRPF3Q9ULD4 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
BRPF3Q9ULD4 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
BRPF3Q9ULD4 ALDH4A1-206ENST00000538839 2957 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
BRPF3Q9ULD4 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
BRPF3Q9ULD4 SDR42E2-201ENST00000602312 2630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
BRPF3Q9ULD4 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71 ms