Protein–RNA interactions for Protein: Q9P267

MBD5, Methyl-CpG-binding domain protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 1,494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MBD5Q9P267 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
MBD5Q9P267 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
MBD5Q9P267 ANKRD30BP2-201ENST00000435744 1610 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
MBD5Q9P267 ZNF750-202ENST00000572562 1513 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
MBD5Q9P267 ZNRD1ASP-217ENST00000437417 1497 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
MBD5Q9P267 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
MBD5Q9P267 ZNF815P-201ENST00000421890 1352 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
MBD5Q9P267 CLRN1-203ENST00000328863 738 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
MBD5Q9P267 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
MBD5Q9P267 IFITM5-201ENST00000382614 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
MBD5Q9P267 AC012506.3-201ENST00000415245 892 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
MBD5Q9P267 AC099552.1-201ENST00000431083 744 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
MBD5Q9P267 CYB561A3-219ENST00000544118 1136 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
MBD5Q9P267 FOS-206ENST00000555347 1280 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
MBD5Q9P267 TXNDC17-202ENST00000570330 459 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
MBD5Q9P267 AL645939.5-201ENST00000606834 243 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
MBD5Q9P267 RETN-203ENST00000629642 400 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
MBD5Q9P267 AL603764.1-201ENST00000636452 321 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
MBD5Q9P267 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
MBD5Q9P267 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
MBD5Q9P267 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
MBD5Q9P267 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
MBD5Q9P267 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
MBD5Q9P267 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
MBD5Q9P267 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
MBD5Q9P267 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MBD5Q9P267 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
MBD5Q9P267 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MBD5Q9P267 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MBD5Q9P267 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MBD5Q9P267 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MBD5Q9P267 AKIP1-201ENST00000299576 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MBD5Q9P267 C9orf24-203ENST00000379126 496 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MBD5Q9P267 CRYBA2-202ENST00000392096 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MBD5Q9P267 AL662890.1-201ENST00000396818 632 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
MBD5Q9P267 IP6K2-205ENST00000413298 792 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
MBD5Q9P267 AC106786.1-201ENST00000442777 792 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
MBD5Q9P267 KCNK16-205ENST00000507712 889 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
MBD5Q9P267 AC022217.1-201ENST00000521069 738 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
MBD5Q9P267 LINC02332-201ENST00000557232 386 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
MBD5Q9P267 AC079328.1-201ENST00000560358 952 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
MBD5Q9P267 AC136428.1-201ENST00000569103 349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
MBD5Q9P267 RN7SL190P-201ENST00000582519 257 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
MBD5Q9P267 AC008537.4-201ENST00000595728 1103 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
MBD5Q9P267 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MBD5Q9P267 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
MBD5Q9P267 SUMO3-203ENST00000397898 1779 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
MBD5Q9P267 POLD3-208ENST00000532497 1700 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MBD5Q9P267 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MBD5Q9P267 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MBD5Q9P267 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MBD5Q9P267 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MBD5Q9P267 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MBD5Q9P267 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
MBD5Q9P267 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MBD5Q9P267 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MBD5Q9P267 RPL35A-205ENST00000448864 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MBD5Q9P267 SPTLC1P5-201ENST00000450718 252 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
MBD5Q9P267 TCEAL4-208ENST00000472484 1273 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MBD5Q9P267 IMP3P2-201ENST00000489760 475 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
MBD5Q9P267 AC078852.2-201ENST00000504748 527 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
MBD5Q9P267 TMEM208-207ENST00000563953 887 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
MBD5Q9P267 MFSD11-218ENST00000591864 446 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MBD5Q9P267 Z84492.1-201ENST00000606589 408 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
MBD5Q9P267 AC138649.2-201ENST00000615886 705 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
MBD5Q9P267 MEF2C-227ENST00000626391 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MBD5Q9P267 MEF2C-231ENST00000628656 1254 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MBD5Q9P267 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MBD5Q9P267 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
MBD5Q9P267 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
MBD5Q9P267 TK1-201ENST00000301634 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MBD5Q9P267 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
MBD5Q9P267 TMEM198B-201ENST00000471276 1958 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MBD5Q9P267 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
MBD5Q9P267 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
MBD5Q9P267 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MBD5Q9P267 FGFR1OP-201ENST00000349556 1484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MBD5Q9P267 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
MBD5Q9P267 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MBD5Q9P267 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MBD5Q9P267 CLUHP2-201ENST00000426660 1303 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
MBD5Q9P267 HIST2H2AA3-201ENST00000369159 549 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
MBD5Q9P267 TXNRD3NB-202ENST00000383572 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
MBD5Q9P267 NREP-204ENST00000419114 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
MBD5Q9P267 AL358393.1-201ENST00000456771 532 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
MBD5Q9P267 UPF3AP2-201ENST00000457924 1132 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
MBD5Q9P267 TMEM14B-210ENST00000473276 730 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
MBD5Q9P267 RPL23A-206ENST00000496182 636 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
MBD5Q9P267 CDK2AP2-205ENST00000531506 634 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
MBD5Q9P267 AC025259.3-202ENST00000564363 687 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
MBD5Q9P267 HIST2H2AA4-201ENST00000607355 564 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
MBD5Q9P267 AC007663.3-201ENST00000609632 465 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
MBD5Q9P267 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
MBD5Q9P267 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
MBD5Q9P267 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
MBD5Q9P267 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
MBD5Q9P267 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
MBD5Q9P267 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
MBD5Q9P267 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
MBD5Q9P267 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.3 ms