Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXP7

GIN1, Gypsy retrotransposon integrase-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 522 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GIN1Q9NXP7 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GIN1Q9NXP7 ARPP19-202ENST00000561650 3245 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GIN1Q9NXP7 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GIN1Q9NXP7 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GIN1Q9NXP7 RAI14-202ENST00000428746 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GIN1Q9NXP7 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GIN1Q9NXP7 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GIN1Q9NXP7 SYNGAP1-203ENST00000428982 4339 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GIN1Q9NXP7 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GIN1Q9NXP7 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GIN1Q9NXP7 RASGRF2-206ENST00000638442 2842 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GIN1Q9NXP7 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GIN1Q9NXP7 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GIN1Q9NXP7 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GIN1Q9NXP7 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GIN1Q9NXP7 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GIN1Q9NXP7 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GIN1Q9NXP7 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GIN1Q9NXP7 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GIN1Q9NXP7 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GIN1Q9NXP7 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GIN1Q9NXP7 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GIN1Q9NXP7 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GIN1Q9NXP7 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GIN1Q9NXP7 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GIN1Q9NXP7 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GIN1Q9NXP7 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GIN1Q9NXP7 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
GIN1Q9NXP7 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GIN1Q9NXP7 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
GIN1Q9NXP7 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GIN1Q9NXP7 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
GIN1Q9NXP7 PTGFRN-201ENST00000393203 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GIN1Q9NXP7 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GIN1Q9NXP7 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GIN1Q9NXP7 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GIN1Q9NXP7 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GIN1Q9NXP7 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GIN1Q9NXP7 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GIN1Q9NXP7 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GIN1Q9NXP7 YPEL1-201ENST00000339468 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GIN1Q9NXP7 ZNF497-201ENST00000311044 3468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GIN1Q9NXP7 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GIN1Q9NXP7 GPSM1-202ENST00000354753 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GIN1Q9NXP7 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GIN1Q9NXP7 SLC35A2-204ENST00000376521 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GIN1Q9NXP7 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
GIN1Q9NXP7 CALN1-201ENST00000329008 9243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
GIN1Q9NXP7 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
GIN1Q9NXP7 PRMT9-201ENST00000322396 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
GIN1Q9NXP7 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
GIN1Q9NXP7 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GIN1Q9NXP7 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GIN1Q9NXP7 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GIN1Q9NXP7 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GIN1Q9NXP7 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
GIN1Q9NXP7 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
GIN1Q9NXP7 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
GIN1Q9NXP7 AC010247.2-201ENST00000559786 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GIN1Q9NXP7 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
GIN1Q9NXP7 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
GIN1Q9NXP7 PODN-207ENST00000618387 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
GIN1Q9NXP7 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GIN1Q9NXP7 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GIN1Q9NXP7 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
GIN1Q9NXP7 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GIN1Q9NXP7 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
GIN1Q9NXP7 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC15.08■□□□□ 0
GIN1Q9NXP7 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC15.08■□□□□ 0
GIN1Q9NXP7 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC15.08■□□□□ 0
GIN1Q9NXP7 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
GIN1Q9NXP7 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC15.08■□□□□ 0
GIN1Q9NXP7 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC15.08■□□□□ 0
GIN1Q9NXP7 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC15.08■□□□□ 0
GIN1Q9NXP7 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC15.08■□□□□ 0
GIN1Q9NXP7 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
GIN1Q9NXP7 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC15.08■□□□□ 0
GIN1Q9NXP7 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC15.08■□□□□ 0
GIN1Q9NXP7 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
GIN1Q9NXP7 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
GIN1Q9NXP7 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
GIN1Q9NXP7 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.08■□□□□ 0
GIN1Q9NXP7 AP4E1-201ENST00000261842 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GIN1Q9NXP7 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
GIN1Q9NXP7 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
GIN1Q9NXP7 KLF5-201ENST00000377687 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GIN1Q9NXP7 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GIN1Q9NXP7 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GIN1Q9NXP7 PXN-221ENST00000637617 3246 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
GIN1Q9NXP7 TARSL2-201ENST00000335968 3610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GIN1Q9NXP7 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
GIN1Q9NXP7 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
GIN1Q9NXP7 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
GIN1Q9NXP7 SEMA5B-201ENST00000195173 4523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
GIN1Q9NXP7 SLITRK2-202ENST00000370490 7672 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
GIN1Q9NXP7 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
GIN1Q9NXP7 TGIF2-202ENST00000373874 3432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
GIN1Q9NXP7 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
GIN1Q9NXP7 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GIN1Q9NXP7 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.6 ms