Protein–RNA interactions for Protein: Q9HAT0

ROPN1, Ropporin-1A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ROPN1Q9HAT0 NEURL1-201ENST00000369780 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ROPN1Q9HAT0 REEP3-201ENST00000373758 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ROPN1Q9HAT0 FADS1-201ENST00000350997 4525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ROPN1Q9HAT0 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
ROPN1Q9HAT0 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ROPN1Q9HAT0 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ROPN1Q9HAT0 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ROPN1Q9HAT0 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ROPN1Q9HAT0 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ROPN1Q9HAT0 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ROPN1Q9HAT0 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ROPN1Q9HAT0 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ROPN1Q9HAT0 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
ROPN1Q9HAT0 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ROPN1Q9HAT0 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
ROPN1Q9HAT0 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
ROPN1Q9HAT0 ZNF84-202ENST00000392319 7020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ROPN1Q9HAT0 HSPH1-201ENST00000320027 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ROPN1Q9HAT0 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ROPN1Q9HAT0 AL161772.1-201ENST00000610494 4412 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
ROPN1Q9HAT0 ZBED1-201ENST00000381218 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ROPN1Q9HAT0 RHPN1-201ENST00000289013 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ROPN1Q9HAT0 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ROPN1Q9HAT0 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ROPN1Q9HAT0 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ROPN1Q9HAT0 SLC39A1-204ENST00000368623 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ROPN1Q9HAT0 CCDC116-201ENST00000292779 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ROPN1Q9HAT0 NYAP1-201ENST00000300179 3581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ROPN1Q9HAT0 PTPRO-202ENST00000348962 5061 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ROPN1Q9HAT0 PATZ1-204ENST00000405309 3711 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ROPN1Q9HAT0 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ROPN1Q9HAT0 BAG4-201ENST00000287322 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ROPN1Q9HAT0 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ROPN1Q9HAT0 KIF21A-202ENST00000361961 6601 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ROPN1Q9HAT0 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ROPN1Q9HAT0 ZCCHC17-202ENST00000373714 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ROPN1Q9HAT0 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ROPN1Q9HAT0 MBD1-212ENST00000585672 2532 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ROPN1Q9HAT0 TTC39A-208ENST00000413473 2718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ROPN1Q9HAT0 DNAJC14-201ENST00000317269 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ROPN1Q9HAT0 ELOA-204ENST00000613537 4924 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ROPN1Q9HAT0 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ROPN1Q9HAT0 ANXA6-215ENST00000523714 2451 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ROPN1Q9HAT0 RGS9-202ENST00000443584 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ROPN1Q9HAT0 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
ROPN1Q9HAT0 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ROPN1Q9HAT0 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
ROPN1Q9HAT0 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC16■□□□□ 0.15
ROPN1Q9HAT0 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ROPN1Q9HAT0 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ROPN1Q9HAT0 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
ROPN1Q9HAT0 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ROPN1Q9HAT0 BANP-203ENST00000393207 2438 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ROPN1Q9HAT0 ANKLE2-210ENST00000542657 2446 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ROPN1Q9HAT0 AC123912.2-201ENST00000594927 2409 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ROPN1Q9HAT0 C4A-259ENST00000498271 5269 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ROPN1Q9HAT0 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ROPN1Q9HAT0 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ROPN1Q9HAT0 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ROPN1Q9HAT0 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ROPN1Q9HAT0 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ROPN1Q9HAT0 IGSF1-204ENST00000370903 4594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ROPN1Q9HAT0 LDLR-202ENST00000455727 2333 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ROPN1Q9HAT0 EIF3J-AS1-201ENST00000313807 2863 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ROPN1Q9HAT0 SLC22A12-203ENST00000377572 2887 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ROPN1Q9HAT0 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ROPN1Q9HAT0 KIAA1683-209ENST00000612316 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ROPN1Q9HAT0 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ROPN1Q9HAT0 C5orf66-206ENST00000624272 2479 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ROPN1Q9HAT0 ME2-201ENST00000321341 9415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ROPN1Q9HAT0 USP19-205ENST00000398898 4474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ROPN1Q9HAT0 C22orf34-201ENST00000343999 2816 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ROPN1Q9HAT0 SUPT20H-212ENST00000475892 2836 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ROPN1Q9HAT0 ACIN1-203ENST00000357481 2563 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ROPN1Q9HAT0 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ROPN1Q9HAT0 IRAK4-212ENST00000551736 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ROPN1Q9HAT0 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ROPN1Q9HAT0 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ROPN1Q9HAT0 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ROPN1Q9HAT0 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ROPN1Q9HAT0 TOB2-201ENST00000327492 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ROPN1Q9HAT0 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ROPN1Q9HAT0 PRMT9-201ENST00000322396 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ROPN1Q9HAT0 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ROPN1Q9HAT0 KLF4-201ENST00000374672 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ROPN1Q9HAT0 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ROPN1Q9HAT0 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
ROPN1Q9HAT0 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ROPN1Q9HAT0 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ROPN1Q9HAT0 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ROPN1Q9HAT0 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ROPN1Q9HAT0 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ROPN1Q9HAT0 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ROPN1Q9HAT0 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ROPN1Q9HAT0 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
ROPN1Q9HAT0 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
ROPN1Q9HAT0 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ROPN1Q9HAT0 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
ROPN1Q9HAT0 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ROPN1Q9HAT0 CCHCR1-201ENST00000376266 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms