Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0C7

AMBRA1, Activating molecule in BECN1-regulated autophagy protein 1, humanhuman

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Length 1,298 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AMBRA1Q9C0C7 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC14.85□□□□□ -0.03
AMBRA1Q9C0C7 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
AMBRA1Q9C0C7 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
AMBRA1Q9C0C7 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
AMBRA1Q9C0C7 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
AMBRA1Q9C0C7 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
AMBRA1Q9C0C7 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
AMBRA1Q9C0C7 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
AMBRA1Q9C0C7 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
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AMBRA1Q9C0C7 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
AMBRA1Q9C0C7 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
AMBRA1Q9C0C7 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
AMBRA1Q9C0C7 HYAL1-209ENST00000618175 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
AMBRA1Q9C0C7 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
AMBRA1Q9C0C7 RGS3-201ENST00000317613 2542 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
AMBRA1Q9C0C7 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
AMBRA1Q9C0C7 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
AMBRA1Q9C0C7 SPIRE1-201ENST00000309836 1877 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
AMBRA1Q9C0C7 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
AMBRA1Q9C0C7 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
AMBRA1Q9C0C7 ITGBL1-207ENST00000622834 2369 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
AMBRA1Q9C0C7 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
AMBRA1Q9C0C7 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
AMBRA1Q9C0C7 FAM114A2-215ENST00000522858 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
AMBRA1Q9C0C7 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
AMBRA1Q9C0C7 PDE1B-207ENST00000550620 2150 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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AMBRA1Q9C0C7 LIMK2-204ENST00000406516 2657 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
AMBRA1Q9C0C7 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
AMBRA1Q9C0C7 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
AMBRA1Q9C0C7 RASSF5-201ENST00000577571 3496 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
AMBRA1Q9C0C7 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
AMBRA1Q9C0C7 DMTN-205ENST00000432128 2508 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
AMBRA1Q9C0C7 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
AMBRA1Q9C0C7 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
AMBRA1Q9C0C7 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
AMBRA1Q9C0C7 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
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AMBRA1Q9C0C7 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
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AMBRA1Q9C0C7 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
AMBRA1Q9C0C7 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
AMBRA1Q9C0C7 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
AMBRA1Q9C0C7 FMO5-201ENST00000254090 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
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AMBRA1Q9C0C7 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
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AMBRA1Q9C0C7 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
AMBRA1Q9C0C7 WASH2P-202ENST00000538033 2800 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
AMBRA1Q9C0C7 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
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