Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZ76

CNTNAP3, Contactin-associated protein-like 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTNAP3Q9BZ76 RHD-203ENST00000357542 1387 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CNTNAP3Q9BZ76 TUBBP5-203ENST00000508529 1334 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CNTNAP3Q9BZ76 BST2-201ENST00000252593 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CNTNAP3Q9BZ76 BATF-201ENST00000286639 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CNTNAP3Q9BZ76 ZFAND2B-205ENST00000409319 771 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CNTNAP3Q9BZ76 NPPC-202ENST00000409852 1051 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
CNTNAP3Q9BZ76 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
CNTNAP3Q9BZ76 AL929472.3-201ENST00000433474 700 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CNTNAP3Q9BZ76 AC010745.3-201ENST00000439745 415 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
CNTNAP3Q9BZ76 AC245884.1-201ENST00000457113 529 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
CNTNAP3Q9BZ76 SZRD1-203ENST00000471507 892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CNTNAP3Q9BZ76 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
CNTNAP3Q9BZ76 AC125603.2-201ENST00000546835 876 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
CNTNAP3Q9BZ76 AL163636.1-201ENST00000554286 915 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CNTNAP3Q9BZ76 FAM192A-218ENST00000567439 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CNTNAP3Q9BZ76 AL022344.2-201ENST00000568976 968 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CNTNAP3Q9BZ76 AC025279.2-201ENST00000569730 653 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CNTNAP3Q9BZ76 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
CNTNAP3Q9BZ76 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
CNTNAP3Q9BZ76 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
CNTNAP3Q9BZ76 GMFG-209ENST00000600322 622 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CNTNAP3Q9BZ76 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CNTNAP3Q9BZ76 APOBEC3H-206ENST00000613677 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CNTNAP3Q9BZ76 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CNTNAP3Q9BZ76 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CNTNAP3Q9BZ76 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CNTNAP3Q9BZ76 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CNTNAP3Q9BZ76 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CNTNAP3Q9BZ76 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CNTNAP3Q9BZ76 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CNTNAP3Q9BZ76 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CNTNAP3Q9BZ76 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CNTNAP3Q9BZ76 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CNTNAP3Q9BZ76 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CNTNAP3Q9BZ76 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CNTNAP3Q9BZ76 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CNTNAP3Q9BZ76 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CNTNAP3Q9BZ76 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CNTNAP3Q9BZ76 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CNTNAP3Q9BZ76 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CNTNAP3Q9BZ76 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CNTNAP3Q9BZ76 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CNTNAP3Q9BZ76 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CNTNAP3Q9BZ76 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CNTNAP3Q9BZ76 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CNTNAP3Q9BZ76 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
CNTNAP3Q9BZ76 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CNTNAP3Q9BZ76 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CNTNAP3Q9BZ76 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CNTNAP3Q9BZ76 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CNTNAP3Q9BZ76 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CNTNAP3Q9BZ76 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC15.03■□□□□ -0
CNTNAP3Q9BZ76 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CNTNAP3Q9BZ76 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CNTNAP3Q9BZ76 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CNTNAP3Q9BZ76 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CNTNAP3Q9BZ76 CHI3L2-212ENST00000524472 1435 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CNTNAP3Q9BZ76 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CNTNAP3Q9BZ76 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CNTNAP3Q9BZ76 SNHG1-213ENST00000540725 1374 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CNTNAP3Q9BZ76 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CNTNAP3Q9BZ76 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CNTNAP3Q9BZ76 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CNTNAP3Q9BZ76 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CNTNAP3Q9BZ76 KLK11-201ENST00000319720 1198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CNTNAP3Q9BZ76 CMTM5-203ENST00000359320 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CNTNAP3Q9BZ76 TSPO2-201ENST00000373158 718 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CNTNAP3Q9BZ76 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CNTNAP3Q9BZ76 MIR1202-201ENST00000408529 83 ntBASIC15.03■□□□□ -0
CNTNAP3Q9BZ76 HSPC324-201ENST00000411904 557 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CNTNAP3Q9BZ76 AL008707.1-201ENST00000422498 534 ntBASIC15.03■□□□□ -0
CNTNAP3Q9BZ76 LRRC74B-201ENST00000442047 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CNTNAP3Q9BZ76 CENPM-208ENST00000472374 541 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CNTNAP3Q9BZ76 AC010973.2-201ENST00000485974 1230 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CNTNAP3Q9BZ76 PMP22-206ENST00000494511 872 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CNTNAP3Q9BZ76 SNRPF-204ENST00000552085 815 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
CNTNAP3Q9BZ76 DNM1P51-201ENST00000558149 522 ntBASIC15.03■□□□□ -0
CNTNAP3Q9BZ76 IGHV3OR16-8-201ENST00000565407 349 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
CNTNAP3Q9BZ76 AC136428.1-201ENST00000569103 349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CNTNAP3Q9BZ76 AC011495.3-201ENST00000596472 427 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CNTNAP3Q9BZ76 AC005252.2-201ENST00000624630 1141 ntBASIC15.03■□□□□ -0
CNTNAP3Q9BZ76 MEF2C-227ENST00000626391 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CNTNAP3Q9BZ76 MEF2C-231ENST00000628656 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CNTNAP3Q9BZ76 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CNTNAP3Q9BZ76 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CNTNAP3Q9BZ76 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CNTNAP3Q9BZ76 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
CNTNAP3Q9BZ76 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CNTNAP3Q9BZ76 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CNTNAP3Q9BZ76 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CNTNAP3Q9BZ76 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CNTNAP3Q9BZ76 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CNTNAP3Q9BZ76 MYCN-202ENST00000638417 1693 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CNTNAP3Q9BZ76 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC15.03■□□□□ -0
CNTNAP3Q9BZ76 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
CNTNAP3Q9BZ76 KATNA1-201ENST00000335643 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CNTNAP3Q9BZ76 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CNTNAP3Q9BZ76 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CNTNAP3Q9BZ76 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CNTNAP3Q9BZ76 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.1 ms