Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTV4

TMEM43, Transmembrane protein 43, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM43Q9BTV4 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TMEM43Q9BTV4 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
TMEM43Q9BTV4 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
TMEM43Q9BTV4 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
TMEM43Q9BTV4 TPO-203ENST00000346956 2923 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
TMEM43Q9BTV4 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TMEM43Q9BTV4 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TMEM43Q9BTV4 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
TMEM43Q9BTV4 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
TMEM43Q9BTV4 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
TMEM43Q9BTV4 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
TMEM43Q9BTV4 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
TMEM43Q9BTV4 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
TMEM43Q9BTV4 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
TMEM43Q9BTV4 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
TMEM43Q9BTV4 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
TMEM43Q9BTV4 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
TMEM43Q9BTV4 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TMEM43Q9BTV4 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
TMEM43Q9BTV4 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TMEM43Q9BTV4 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
TMEM43Q9BTV4 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
TMEM43Q9BTV4 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
TMEM43Q9BTV4 TSPAN14-210ENST00000616406 2436 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
TMEM43Q9BTV4 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TMEM43Q9BTV4 LHFPL2-207ENST00000515007 4680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TMEM43Q9BTV4 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TMEM43Q9BTV4 MARK3-202ENST00000303622 3283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TMEM43Q9BTV4 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TMEM43Q9BTV4 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TMEM43Q9BTV4 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TMEM43Q9BTV4 APPL1-201ENST00000288266 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TMEM43Q9BTV4 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TMEM43Q9BTV4 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TMEM43Q9BTV4 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TMEM43Q9BTV4 F2RL1-201ENST00000296677 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TMEM43Q9BTV4 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TMEM43Q9BTV4 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
TMEM43Q9BTV4 MEGF10-202ENST00000418761 2238 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
TMEM43Q9BTV4 AC026748.1-201ENST00000624349 3251 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
TMEM43Q9BTV4 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
TMEM43Q9BTV4 KCNG3-202ENST00000394973 3656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
TMEM43Q9BTV4 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
TMEM43Q9BTV4 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
TMEM43Q9BTV4 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
TMEM43Q9BTV4 ZSWIM8-201ENST00000398706 6062 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
TMEM43Q9BTV4 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
TMEM43Q9BTV4 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
TMEM43Q9BTV4 CATSPER4-202ENST00000456354 1912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
TMEM43Q9BTV4 SLC25A38-201ENST00000273158 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
TMEM43Q9BTV4 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
TMEM43Q9BTV4 VAT1-201ENST00000355653 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
TMEM43Q9BTV4 KCTD15-201ENST00000284006 4918 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
TMEM43Q9BTV4 GPR153-201ENST00000377893 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
TMEM43Q9BTV4 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
TMEM43Q9BTV4 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
TMEM43Q9BTV4 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
TMEM43Q9BTV4 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
TMEM43Q9BTV4 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
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TMEM43Q9BTV4 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC14.47□□□□□ -0.09
TMEM43Q9BTV4 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
TMEM43Q9BTV4 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC14.47□□□□□ -0.09
TMEM43Q9BTV4 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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TMEM43Q9BTV4 EOMES-201ENST00000295743 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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TMEM43Q9BTV4 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
TMEM43Q9BTV4 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
TMEM43Q9BTV4 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
TMEM43Q9BTV4 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
TMEM43Q9BTV4 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
TMEM43Q9BTV4 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
TMEM43Q9BTV4 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
TMEM43Q9BTV4 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
TMEM43Q9BTV4 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
TMEM43Q9BTV4 PRPS1-204ENST00000372435 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
TMEM43Q9BTV4 TEAD3-201ENST00000338863 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
TMEM43Q9BTV4 CRHR2-208ENST00000506074 3109 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
TMEM43Q9BTV4 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
TMEM43Q9BTV4 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
TMEM43Q9BTV4 CICP24-201ENST00000605464 2705 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
TMEM43Q9BTV4 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
TMEM43Q9BTV4 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
TMEM43Q9BTV4 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
TMEM43Q9BTV4 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
TMEM43Q9BTV4 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
TMEM43Q9BTV4 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
TMEM43Q9BTV4 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
TMEM43Q9BTV4 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
TMEM43Q9BTV4 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
TMEM43Q9BTV4 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
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